Unterschied zwischen AFLP und RFLP

Schlüsselunterschied - AFLP vs RFLP
 

DNA -Studien haben eine immense Bedeutung für das Verständnis und die Bestimmung phylogenetischer Beziehungen, die Diagnose von genetischen Erkrankungen und die Kartierung der Genome des Organismus. Für die Identifizierung eines bestimmten Gens oder einer DNA -Sequenz in einem Pool unbekannter DNA werden auch verschiedene mit der DNA -Analyse verbundene Techniken verwendet. Sie sind als molekulare Marker bekannt. Amplifizierte Fragmentlänge Polymorphismus (AFLP) und Restriktionsfragmentlänge Polymorphismus (RFLP) sind zwei solche molekularen Marker (Methoden), die in der molekularen Biologie entwickelt wurden, um genetische Variationen zwischen Organismen nachzuweisen. Beide Methoden sind gleich wichtig und haben Vor- und Nachteile. Der Hauptunterschied zwischen AFLP und RFLP ist das AFLP beinhaltet eine selektive PCR -Amplifikation der verdauten DNA, während RFLP keine selektive PCR -Amplifikation der DNA -Fragmente beinhaltet.

INHALT
1. Überblick und wichtiger Unterschied
2. Was ist AFLP
3. Was ist RFLP
4. Seite an Seitenvergleich - AFLP vs RFLP
5. Zusammenfassung

Was ist AFLP?

AFLP (amplifizierter Fragmentlänge -Polymorphismus) ist ein wichtiges Instrument in der molekularen Biologie und wird in der genetischen Variationsanalyse ausführlich eingesetzt. AFLP basiert auf der spezifischen PCR -Amplifikation der fragmentierten genomischen DNA und dem Nachweis des Polymorphismus durch Autoradiographien über Gelelektrophorese. AFLP trägt weitgehend dazu bei. AFLP kann mit geringen Mengen unbekannter DNA -Proben durchgeführt werden. Es erfordert keine vorherige Sequenzwissen und das Entwerfen von Sonden.

Schritte von AFLP

1. Isolierung von DNA
2. Verdauung der DNA mit Restriktionsendonukleasen
3. Ligation der eingeschränkten DNA -Fragmente mit Adaptern
4. Selektive Amplifikation der Fragmente mit spezifischen Restriktionsstellen
5. Trennung der PCR -Produkte durch Gelelektrophorese
6. Visualisierung der Gelmatrix durch Autoradiograph

AFLP ist eine empfindlichere und reproduzierbarere Methode, die bei der DNA -Profilierung mehrerer Taxa verwendet werden kann, darunter Pilze, Bakterien, Pflanzen und Tier ohne Vorkenntnis von DNA -Sequenzen. Es hilft bei der Ermittlung geringfügiger Unterschiede zwischen Individuen in Populationen aufgrund seiner hochempfindlichen Natur. AFLP ist auch wichtig für Genom Mapping, forensische Studien, Elterntests, Genotypisierung usw.

Abbildung 01: AFLP

Was ist RFLP?

Restriktionsfragmentlänge Polymorphismen (RFLPs) ist eine Technik, mit der die genetischen Variationen in homologen DNA -Sequenzen nachgewiesen werden. Es ist die erste Methode, die für die DNA -Profilerstellung entwickelt wurde. Organismen haben einzigartige DNA -Fingerabdrücke oder DNA -Profile. RFLP dient als wichtiges Instrument zur Analyse der Variation zwischen DNA -Profilen von intraspezifischen oder eng verwandten Organismen, da homologe Sequenzen unterschiedliche Restriktionsstellen (Orte) haben. Wenn homologe DNA mit spezifischen Restriktionsendonukleasen verdaut werden, führt dies zu verschiedenen DNA -Profilen, die für jedes Individuum einzigartig sind. Daher ist der Haupt dieser Methode der Nachweis genetischer Variation zwischen Organismen durch Einschränkung der homologen DNA mit spezifischen Restriktionsenzymen und Analyse des Fragmentlängenpolymorphismus über Gelelektrophorese und Blotting. Blotting -Muster sind für jeden Organismus einzigartig und charakterisieren die spezifischen Genotypen.

Schritte von RFLP

1. Isolierung einer ausreichenden Menge DNA aus Proben
2. Fragmentierung der DNA -Proben mit spezifischen Restriktionsendonukleasen in eine kurze Sequenz
3. Trennung der entstandenen Fragmente mit unterschiedlichen Längen durch Agarosegelelektrophorese.
4. Übertragen des Gelprofils in eine Membran von Southern Blotting

5. Hybridisierung der Membran mit markierten Sonden und Analyse des Fragmentlängenpolymorphismus in jedem Profil

RFLP ist eine sehr wichtige Technik bei der Erkennung von Erkrankungen der Krankheitsvererbung und der Ermittlung des Risikos des Krankheitsvorkommens bei Familienmitgliedern. RFLP wird auch häufig bei der Genom Mapping verwendet, die Kriminelle in Forensik, Vaterschaftstests usw. identifiziert. RFLP hat auch mehrere Einschränkungen. RFLP erfordert das Vorkenntnis von Sequenzdaten, um Sonden für die Hybridisierung zu entwerfen. Es erfordert auch die Isolierung einer ausreichenden Menge an DNA aus der Probe, was in forensischen Studien schwierig ist.

Abbildung 01: RRFLP -Zuordnung

Was ist der Unterschied zwischen AFLP und RFLP?

Zusammenfassung -AFLP vs RFLP

AFLP und RFLP sind zwei Techniken, die als genetische Marker zur Bewertung der Vielfalt und Bewertung der genetischen Beziehungen in der molekularen Biologie verwendet werden. AFLP dient als effiziente und empfindliche Methode zum Nachweis des genetischen Polymorphismus zwischen Organismen als RFLP. Obwohl diese beiden Methoden bei der Nachweis genetischer Variationen unterschiedliche Effizienz haben, werden sie dennoch für die DNA -Fingerabdruck- und Krankheitsdiagnose verwendet.

Referenz:
'1. Garcia, Antonio a. F., Luciana l. Benchimol, Antônia m. M. Barbosa, Isaias O. Geraldi, Souza Jr. Cláudio l., und Anete p. De Souza. „Vergleich von RAPD-, RFLP-, AFLP- und SSR -Markern für Diversity -Studien in tropischen Mais -Inzuchtlinien.”Genetik und Molekularbiologie. Sociedade Brasileira de Genética, 2004. Netz. 19. März. 2017
2. „Restriktionsfragmentlänge Polymorphismus (RFLP).Nationales Zentrum für Biotechnologieinformationen. U.S. Nationalbibliothek für Medizin, n.D. Netz. 19. März. 2017
3. Massiga d. K. und Turner c. M. (2004). "Amplifizierte (Restriktion) Fragmentlänge Polymorphismus (AFLP) -Analyse". Methoden Mol Biol: 270: 173-86. NCBI. Netz. 19. März. 2017

Bild mit freundlicher Genehmigung:
1. "Alfp" von Barbarossa bei Dutch Wikipedia - von NL übertragen.Wikipedia nach Commons. (Public Domain) über Commons Wikimedia
2. "RFLP Mapping" von Retama - eigene Arbeit (GFDL) über Commons Wikimedia