Unterschied zwischen Linker und Adapter

Der Schlüsselunterschied Zwischen Linker und Adapter ist das Ein Linker hat keine zusammenhängenden Ziele, während ein Adapter ein zusammenhängendes Ende hat.

DNA -Ligation ist der Prozess, zwei DNA -Moleküle zusammenzuschließen und Phosphodiesterbindungen zu bilden. Das Enzym namens DNA -Ligase katalysiert diese Reaktion. Es ist einer der kritischen Schritte in modernen molekularen biologischen Feldern wie rekombinanter DNA -Technologie und DNA -Klonierung. Die Ligationseffizienz hängt von den Enden der DNA -Moleküle ab, die ligiert werden sollen. Es gibt zwei Arten von DNA -Enden als klebrige Enden und stumpfe Enden. Die Ligationseffizienz ist hoch mit klebrigen Enden als mit stumpfen Enden. Wenn die Ziel -DNA -Moleküle stumpfe Enden haben, sind Moleküle, die als Adapter oder Linker bezeichnet werden. Adapter und Linker werden chemisch synthetisierte Oligonukleotidmoleküle, die bei der DNA -Ligation helfen. Sie haben auch interne Restriktionsstellen. Adapter hat ein klebriges Ende und ein stumpfes Ende, während Linker zwei stumpfe Enden hat.

INHALT

1. Überblick und wichtiger Unterschied
2. Was ist ein Linker 
3. Was ist ein Adapter
4. Ähnlichkeiten zwischen Linker und Adapter
5. Seite an Seite Vergleich - Linker vs Adapter in tabellarischer Form
6. Zusammenfassung

Was ist ein Linker?

Linker ist eine chemisch synthetisierte Oligonukleotidsequenz, die doppelsträngig ist. Linker hat zwei stumpfe Enden. Linker werden verwendet, um DNA. Es enthält eine oder mehrere interne Restriktionsstellen. Diese Restriktionsstellen wirken als Erkennungsstellen für Restriktionsenzyme.

Abbildung 01: Linker

Nach der Ligation ist die DNA erneut mit Restriktionsenzymen eingeschränkt, um kohärente Enden zu erzeugen. Ecori-Linker und Sal-i-Linker sind häufig verwendete Linker.

Was ist ein Adapter?

Ein Adapter ist eine doppelsträngige Oligonukleotidsequenz, mit der zwei DNA-Moleküle miteinander verbunden werden. Es ist eine kurze Sequenz mit einem stumpfen Ende und einem klebrigen oder zusammenhängenden Ende. Daher besteht es aus einem einzigen Strangschwanz an einem Ende, der die Effizienz der DNA-Ligation verbessert.

Abbildung 02: DNA -Ligation durch einen Adapter

Darüber hinaus verfügt der Adapter über interne Restriktionsstellen. Daher kann die DNA nach der Ligation mit geeigneten Restriktionsenzymen eingeschränkt werden, um einen neuen vorstehenden Terminus zu erstellen. Ein Nachteil von Adaptern ist, dass zwei Adapter durch Basispaarung mit sich selbst Dimmer bilden können. Dies kann vermieden werden, indem sie mit dem Enzym namens alkalische Phosphatase behandelt werden.

Was sind die Ähnlichkeiten zwischen Linker und Adapter??

• Sowohl Linker als auch Adapter sind doppelsträngige kurze Oligonukleotidsequenzen.
• Sie tragen interne Beschränkungsstellen.
• Darüber hinaus sind sie chemisch synthetisierte DNA -Moleküle und sind synthetische Moleküle.
• Sie können zwei DNA -Moleküle miteinander verbinden.
• Nach der Ligation von Linker und Adaptern ist die DNA erneut mit Einschränkungsenzymen eingeschränkt, um klebrige Enden zu erzeugen.

Was ist der Unterschied zwischen Linker und Adapter?

Ein Linker ist ein chemisch synthetisiertes kurzes Oligonukleotid -Duplex mit zwei stumpfen Enden. Ein Adapter ist ein chemisch synthetisiertes kurzes Oligonukleotid -Duplex mit einem klebrigen Ende und einem stumpfen Ende. Dies ist daher der Schlüsselunterschied zwischen Linker und Adapter. Darüber hinaus können Adapter Dimere bilden, während Linker keine Dimer bilden. Dies ist also ein weiterer signifikanter Unterschied zwischen Linker und Adapter.

Im Folgenden finden Sie eine Zusammenfassung der Unterschiede zwischen Linker und Adapter in tabellarischer Form.

Zusammenfassung -Linker vs Adapter

Linker und Adapter sind zwei Arten von chemisch synthetisierten Oligonukleotiden. Linker hat zwei stumpfe Enden, während Adapter ein stumpfes Ende und ein zusammenhängendes Ende hat. Dies ist also der Hauptunterschied zwischen Linker und Adapter. Es handelt sich um doppelsträngige Moleküle mit internen Restriktionsstellen.  Sie werden häufig bei rekombinanter DNA -Technologie und DNA -Klonierung verwendet.

Referenz:

1. „Linker DNA.”Wikipedia, Wikimedia Foundation, 31. August. 2020, hier erhältlich.
2. Rothstein, r.J., et al. „[7] Synthetische Adapter zum Klonen von DNA.Methoden in der Enzymologie, Akademische Presse, 7. Januar. 2004, hier erhältlich.

Bild mit freundlicher Genehmigung:

1. "SENGEN WORKFLOW (UPDATE V2)" von Karahavet - eigene Arbeit (CC BY -SA 4.0) über Commons Wikimedia
2. „Bibliotheksvorbereitung für die solide Plattform“ von Philippe Hupé-Emmanuel Barillot, Laurence Calzone, Philippe Hupé, Jean-Philippe Vert, Andrei Zinovyev, Computersysteme Biologie von Cancer Chapman & Hall/CRC Mathematical Biology, 2012 (CC BY-SA 3.0) über Commons Wikimedia