Unterschied zwischen RNase A und RNase H

Unterschied zwischen RNase A und RNase H

Schlüsselunterschied - RNase A vs RNase H
 

Die Ribonukleasen sind Nukleasen, die die RNA spezifisch in kleinere Einheiten zerlegen. Sie können in zwei Kategorien unterteilt werden; Endoribonukleasen und Exoribonukleasen. Endoribonuklease ist eine Endonuklease, die entweder einzeln gestrandete oder doppelt gestrandete RNA abbauen kann. Es spaltet die Phosphodiesterbindungen in einer RNA -Polynukleotidkette. Die Beispiele sind RNase A, RNase III, RNase T1, RNase P und RNase H. Exoribonuklease ist eine Exonuklease, die die RNA durch Entfernen von terminalen Nukleotiden aus entweder 5'end oder 3'end des RNA -Moleküls abgebaut hat. Die Beispiele sind RNase R, RNase II, RNase D und RNase PH. Der Schlüsselunterschied Zwischen RNase A und RNase H ist das die RNase A ist eine Pankreas-Ribonuklease, die spezifisch einsträngige RNA in kleinere Komponenten beeinträchtigt.

INHALT

1. Überblick und wichtiger Unterschied
2. Was ist rnase a
3. Was ist RNase H
4. Ähnlichkeiten zwischen RNase A und RNase H
5. Seite an Seite Vergleich - RNase A gegen RNase H in tabellarischer Form
6. Zusammenfassung

Was ist rnase a?

Die RNase A ist eine Pankreas-Ribonuklease, die die ungepaarten Cytosin- und Uracil-Reste am Ende von einzelsträngigen RNA spezifisch spaltet. RNase H arbeitet in einer höheren Salzkonzentration (0).3 m oder höher NaCl -Konzentration). Die hydrolytische Reaktion besteht aus zwei Schritten. Es bildet ein 3 'phosphoryliertes Produkt über 2', 3 'cyclische Monophosphat -Zwischenprodukt. Obwohl es spezifisch für einsträngige RNA bei höherer Salzkonzentration ist, kann es auch doppelsträngige RNA und RNA in RNA-DNA-Hybrid bei niedrigerer NaCl-Konzentration abbauen (niedriger als 0.3m NaCl).

Bruce Merrifield synthetisierte dieses Enzym zuerst. RNase A ist ein sehr beliebtes Enzym in der molekularen Forschung. Rinderpankreas -RNase A ist ein Beispiel für RNase A. Und es ist eines der härtesten Enzyme, die im Labor verwendet werden. Dieses Enzym benötigt keinen Cofaktor für seine Aktivität. Es ist ein sehr thermostabiles Enzym. RNase A ist das erste Enzym und das dritte Protein, dem eine korrekte Aminosäuresequenz nachgewiesen wurde. Dieses Enzym ist sehr klein mit 124 Aminosäuren und molekularen Masse von 12600DA. Und es hat vier Histidinreste (seine 12 und seine 119, die sich für die katalytische Reaktion beinhalten).

Abbildung 01: Die RNase a

RNase A kann isoliert werden, indem eine grobe Probe kochen. Beim Strahlen verschlechtern alle anderen Enzyme die verbleibende RNase A. RNase A ist ein erstaunlich stabiles Enzym. Dieses Enzym hemmt mit Ribonuklease -Inhibitor -Protein, Schwermetall- und Uridin -Vanadat -Komplexen.

Was ist RNase H?

Die RNase H ist ein unspezifisches Ribonuklease-Enzym, das RNA in RNA-DNA-Hybrid über hydrolytische Reaktion abbauen kann. Die RNase H spaltet die 3'- Die O-P-Bindung von RNA in einem RNA-DNA-Hybrid. Letztendlich produziert es 3'OH- und 5 -' -Phosphat -Kündigungsprodukte. In der DNA -Replikation spielt es eine zentrale Rolle, indem RNA -Primer nach neuen DNA -Strängen gebildet werden. Unter Laborbedingungen verschlechtert es spezifisch die RNA in RNA-DNA-Hybrid, jedoch nicht in DNA und ungehybridisierter RNA. Und dieses Enzym wird normalerweise verwendet, um die RNA -Vorlage zu zerstören, nachdem während der cDNA -Synthese der erste komplementäre DNA -Strang gebildet wurde.

Abbildung 02: rnase h

RNase H verwendet auch in Nuklease -Schutz -Assays. Es kann auch in die Entfernung von Poly A -Schwanz von mRNA eingebaut werden. RNase H hat die Fähigkeit, die nichtkodierende RNA innerhalb und außerhalb der Zelle zu zerstören. Die Metallionen werden als Cofaktoren für diese Proteinaktivität benötigt. Ein Chelator (EDTA) kann verwendet werden, um das RNase H -Enzym zu hemmen.

Was sind die Ähnlichkeiten zwischen RNase A und RNase H?

  • Beide sind Protein in der Natur.
  • Beide sind Endoribonuklease
  • Beide können die RNA abbauen.
  • Beide führen hydrolytische Reaktionen durch.
  • Molekulare Laboratorien verwenden beide.

Was ist der Unterschied zwischen RNase A und RNase H?

Rnase a vs rnase h

RNase A ist eine Pankreas-Ribonuklease, die das 3'-Ende von ungepaarten Cytosin- und Uracilresten von einsträngiger RNA bei höherer Salzkonzentration spezifisch spaltet. RNase H ist ein unspezifisches Ribonuklease-Enzym, das RNA in RNA-DNA-Hybrid über hydrolytische Reaktion abbauen kann.
 Art der RNA -Spaltung
RNase A spaltet spezifisch einsträngige RNA bei höherer Salzkonzentration. RNase H spaltet RNA in RNA-DNA-Hybrid.
Notwendigkeit von Co-Faktoren für die Aktivität
RNase A benötigt keine Cofaktoren für seine Aktivität. RNase H braucht Metallionen als Cofaktoren für seine Aktivität.
 Inhibitoren der Proteinaktivität
Ribonuklease -Inhibitorprotein, Schwermetall und Uridin -Vanadatkomplexe hemmt die RNase A -Aktivität. Ein Chelator (EDTA) hemmt die RNase H -Aktivität.
RNA -Primerentfernung in der DNA -Replikation
RNase A wird nicht zur Entfernung der RNA -Primer in der DNA -Replikation verwendet. RNase H wird zur Entfernung der RNA -Primer in der DNA -Replikation verwendet
Entfernung der DNA-Template in der komplementären DNA-Synthese (C-DNA)
RNase A wird nicht zur Entfernung der RNA-Template während der komplementären DNA-Synthese (C-DNA) verwendet. RNase H wird zur Entfernung der RNA-Vorlagen während der komplementären DNA-Synthese (C-DNA) verwendet.
Entfernung von Poly-a-tail in mRNA, hybridisiert mit Oligo (DT)
RNase A wird nicht verwendet, um „Poly-A-Schwanz“ in mRNA zu entfernen, die nach Oligo (DT) hybridisiert wurden. RNase H wird verwendet, um „Poly-A-Schwanz“ in mRNA zu entfernen, die nach Oligo (DT) hybridisiert wurden

Zusammenfassung - Rnase a vs rnase h

Die Ribonukleasen sind Nuklease -Enzyme, die die Fähigkeit haben, RNA in kleinere Einheiten zu spalten. Sie sind zwei Arten; Endoribonukleasen und Exoribonukleasen. Endoribonuklease ist eine Endonuklease, die die Fähigkeit zur Abbau von einzelsträngigen oder doppelsträngigen RNA hat.  Und es spaltet die Phosphodiesterbindung in einer RNA -Polynukleotidkette. RNase A und RNase H sind zwei Endoribonukleasen. RNase A ist eine Pankreas-Ribonuklease, die ungepaarte Cytosin- und Uracil-Reste am 3'-Ende der einsträngigen RNA bei höherer Salzkonzentration spezifisch spaltet. RNase H ist ein unspezifisches Ribonuklease-Enzym, das RNA in RNA-DNA-Hybrid über hydrolytische Reaktion abbauen kann. Dies ist der Unterschied zwischen RNase A und RNase H.

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Referenz:

1.Karuturi, Autor Amrutha. „17 müssen Fakten über RNase a wissen.”Ag Blog, 22. Februar. 2017. Hier verfügbar
2.„Ribonuklease.Wikipedia, Wikimedia Foundation, 5. Januar. 2018. Hier verfügbar  

Bild mit freundlicher Genehmigung:

1.'Rnase a'By kein maschinelles Lesbarer Autor zur Verfügung gestellt. Vossman nahm an (basierend auf Urheberrechtsansprüchen)., (CC BY-SA 2.5) über Commons Wikimedia
2.'Rnase h fix'by kein maschinenlesbarer Autor zur Verfügung gestellt. Vossman nahm an (basierend auf Urheberrechtsansprüchen)., (CC BY-SA 2.5) über Commons Wikimedia