Unterschied zwischen Syntenie und Kollinearität

Der Schlüsselunterschied Zwischen Syntenie und Kollinearität ist das Syntenie ist die physikalische Co-Lokalisierung genetischer Loci auf demselben Chromosom in Spezies, während Kollinearität die physikalische Co-Lokalisierung von genetischen Loci auf demselben Chromosom bei verschiedenen Arten ist.

Syntenie und Kollinearität sind zwei Begriffe, die in der Genomik austauschbar verwendet werden. Beide Begriffe beschreiben die Genlokalisierungsmuster der Gene bei Chromosomen bei verschiedenen Arten. Diese verwandten Genvereinbarungen zwischen den Taxa sind wertvolle Informationen, wenn sie gemeinsame Gene abschließen. Syntenie bezieht. Die Kollinearität bezieht sich auf die physikalische Co-Lokalisierung genetischer Loci auf demselben Chromosom bei verschiedenen Arten, die die gleiche Ordnung haben. Daher ist es eine Form der Syntenie.

INHALT

1. Überblick und wichtiger Unterschied
2. Was ist Syntenie 
3. Was ist Kollinearität
4. Ähnlichkeiten zwischen Syntenie und Kollinearität
5. Nebenseitiger Vergleich - Syntenie gegen Kollinearität in tabellarischer Form
6. Zusammenfassung

Was ist Syntenie?

Bei verschiedenen Arten befindet sich eine Reihe von Genen auf demselben Chromosom. Und diese physikalische Co-Lokalisierung von Genen auf demselben Chromosom in verschiedenen Arten ist als Syntenie bekannt. Außerdem sind diese Gene bei einem einzelnen Chromosom sehr nahe beieinander zu finden. Die Reihenfolge der Gene ist möglicherweise nicht unbedingt der gleiche. Die Lokalisierung von Genen in der Nähe voneinander auf demselben Chromosom findet jedoch syntenie statt. Daher beschreibt die Syntenie hauptsächlich das Verteilungsmuster von Genen auf einem Chromosom. Diese Muster der Gen-Co-Lokalisierung zeigen Beziehungen zwischen verschiedenen Arten und ihrer Entwicklung an. Die Syntenie kann jedoch aufgrund chromosomaler Umlagerungen wie Translokationen, Inversion und Chromosomenfusion usw. gestört werden. Duplikationen, Verlust und ungleiche homologe Rekombination.

Abbildung 01: Syntenie

Es wird angenommen, dass alle verbundenen Gene syntenisch sind. Allerdings sind nicht alle syntenischen Gene unbedingt miteinander verbunden. Sie besitzen gemeinsame Chromosomensequenzen. Menschen haben viele syntenische Gene mit anderen Säugetieren. Darüber hinaus haben viele Getreide syntenische Gene.

Was ist Kollinearität?

Kollinearität ist eine spezifischere Form der Syntenie, in der sich eine Reihe von Genen auf demselben Chromosom verschiedener Arten in der gleichen Reihenfolge befindet wie bei den Stammarten. Wenn es eine Abweichung von der Kollinearität gibt, wird es daher ein zuverlässigerer phylogenetischer Charakter sein, da die Kollinearität die gemeinsame Abstammung von Genen erklärt.

Abbildung 02: Kollinearität

Die Multiway -Kollinearitätsanalyse liefert viel zuverlässigere Informationen über die verwandten Arten und ihre Phylogenie.

Was sind die Ähnlichkeiten zwischen Syntenie und Kollinearität?

• Sowohl in Syntenie als auch in der Kollinearität befindet sich ein Satz von Loci in zwei verschiedenen Arten auf demselben Chromosom.
• Diese Begriffe beschreiben die physikalische Co-Lokalisierung von genetischen Loci auf demselben Chromosom.
• Kollinearität ist eine spezifischere Form der Syntenie.
• Manchmal werden beide Begriffe in der Genomik austauschbar verwendet.
• Wenn zwei Regionen eine Kollinearität haben, sind sie offensichtlich syntenös.
• Sie sind nützlich, um die Phylogenie zu schließen.

Was ist der Unterschied zwischen Syntenie und Kollinearität?

Syntenie und Kollinearität sind zwei Begriffe, die in der Genomik austauschbar verwendet werden. Syntenie bezieht. Kollinearität ist eine Form der Syntenie, bei der die Genemenge in der gleichen Reihenfolge unter den verschiedenen Arten kooklasiert sind. Daher ist dies der Hauptunterschied zwischen Syntenie und Kollinearität.

Zusammenfassung -Syntenie gegen Kollinearität

Die Begriffe Syntenie und Kollinearität beziehen sich auf eine Reihe von Genen, die sich auf demselben Chromosom in verschiedenen Arten befinden. Tatsächlich sind diese Gene im selben Chromosom in verschiedenen Arten co-lokalisiert. Die Syntenie beschreibt die physikalische Co-Lokalisierung von Set-Genen auf demselben Chromosom bei verschiedenen Arten, während die Kollinearität eine spezifischere Form der Syntenie ist, bei der die Genemenge in derselben Reihenfolge kooklokalisiert werden. Dies fasst den Unterschied zwischen Syntenie und Kollinearität zusammen.

Referenz:

1. "Syntenie". En.Wikipedia.Org, 2020, hier erhältlich.
2. "Genomik und vergleichende Genomik". Integrated Breeding.NET, 2020, hier erhältlich.

Bild mit freundlicher Genehmigung:

1. "Human-Maus-Syntenie" von Sinha Au, Meller J. - BMC -Bioinformatik. 2007 März 8; 8: 82 [PMID: 17343765] (CC von 2.0) über Sscommons Wikimedia