Unterschied zwischen dem Kandidatengen und GWAS

Der Schlüsselunterschied Zwischen dem Kandidaten Gen und GWAS ist das Der Kandidatengenansatz untersucht die genetische Variation innerhalb einer geringen Anzahl von interessierten Genen, während GWAS das gesamte Genom für eine gemeinsame genetische Variation hinter einer bestimmten Krankheitserkrankung untersucht.

Kandidatengenansatz und genomweite Assoziationsstudien (GWAS) sind zwei Methoden, die wichtig sind, um die genetische Anfälligkeit für Krankheiten nachzuweisen. Der Kandidatengenansatz basiert auf einer vorgegebenen kleinen Anzahl von Genen, während GWAS auf dem Testen des gesamten Genoms basiert. Der Kandidatengenansatz erfordert daher Vorkenntnisse über Gene mit Relevanz für die Krankheit, im Gegensatz zu GWAS.

INHALT

1. Überblick und wichtiger Unterschied
2. Was ist ein Kandidatengen 
3. Was ist GWAS
4. Ähnlichkeiten zwischen Kandidatengen und GWAS
5. Nebenseitiger Vergleich - Kandidatengen gegen GWAS in tabellarischer Form
6. Zusammenfassung

Was ist ein Kandidatengen?

Der Ansatz des Kandidatengens ist eine der Techniken, die den Zusammenhang zwischen genetischen Variationen innerhalb von interessierten Genen und Phänotypen oder Krankheitszuständen untersuchen. Bei diesem Ansatz ist es notwendig, Vorkenntnisse über die biologischen funktionellen Auswirkungen des Gens auf das betreffende Merkmal oder die betreffende Krankheit zu haben. Basierend auf diesem Wissen wird eine kleine Anzahl von Genen ausgewählt und auf genetische Variation analysiert.

Abbildung 01: Ansatz des Kandidatengens

Die Auswahl der Gene basiert auf der biologischen, physiologischen und funktionellen Relevanz für die fragliche Krankheit in diesem Ansatz. Dieser Ansatz wird häufig als Fall-Kontrollstudie konzipiert.

Was ist GWAS?

GWAS steht für die genomweite Assoziationsstudie. Es bezieht sich auch auf Studien des gesamten Genomverbandes. Diese Studien konzentrieren sich hauptsächlich auf Beobachtungsstudien. Sie analysieren die genetischen Varianten verschiedener Individuen, die normalerweise mit einem bestimmten Merkmal assoziiert sind. Das gesamte Genom ist wichtig für die GWAS -Analyse.

GWAS ist ein wichtiges Instrument bei der Analyse von Einzelnukleotidpolymorphismen, die mit verschiedenen Erkrankungen verbunden sind. Es ist eine vergleichende Untersuchung der verschiedenen einzelnen Nukleotidpolymorphismen in einer Weitwinkelpopulation. Die Untersuchungsprobe von GWAS ist sehr hoch; Daher nimmt es auch das Format einer Querschnittskohortenstudie an.

Abbildung 02: GWAS

Die erste GWAS -Studie fand im Hinblick auf den Myokardinfarkt und die Analyse der mit dem Myokardinfarkt verbundenen Gene statt. Derzeit spielt GWAS eine wichtige Rolle bei der Bestimmung des genetischen Hintergrunds komplexer Krankheiten mit unbekannter Ätiologie.

Was sind die Ähnlichkeiten zwischen dem Kandidatengen und GWAS?

• Sowohl der Kandidatengenansatz als auch GWAS sind Techniken, die den genetischen Zusammenhang zwischen Genotyp und Phänotyp der Krankheit analysieren.
• Beide Ansätze tragen dazu bei, die genetische Grundlage der Anfälligkeit für Krankheiten zu verstehen.

Was ist der Unterschied zwischen dem Kandidatengen und GWAS?

Der Kandidatengenansatz basiert auf den Kandidatengenen oder vorgegebenen Genen, während GWAS auf dem gesamten Genom basiert. Dies ist also der Hauptunterschied zwischen Kandidatengen und GWAS. Auch im Ansatz des Kandidatengens ist die Auswahl der Gene erforderlich, während sie in GWAS nicht benötigt wird.

Darüber hinaus erfordert der Kandidatengenansatz Vorkenntnisse über die für die Krankheit relevanten Gene, während er für GWAS nicht erforderlich ist.

Die folgende Infografik bietet einen detaillierteren Vergleich im Zusammenhang mit dem Unterschied zwischen dem Kandidatengen und GWAS.

Zusammenfassung - Kandidatengen gegen GWAS

Kandidatengen und GWAS sind zwei Studien der Genassoziationen. Der Kandidatengenansatz konzentriert sich auf die genetische Variation im Zusammenhang mit der Krankheit innerhalb einer kleinen Anzahl von vorgegebenen Genen. Im Gegensatz dazu untersucht GWAS die genetische Variation, die mit der Krankheit innerhalb des gesamten Genoms verbunden ist. Dies ist also der Hauptunterschied zwischen Kandidatengen und GWAS. Beide Methoden sind wichtig, um die genetische Grundlage der Anfälligkeit für Krankheiten zu verstehen.

Referenz:

1. „Kandidatengen - Ein Überblick | Sciencedirect -Themen “. Sciencedirect.Com, 2020, hier erhältlich.
2. "Kandidatengen". En.Wikipedia.Org, 2020, hier erhältlich.

Bild mit freundlicher Genehmigung:

1. „Ranking-Candidate-Disease-Genes-From-Gen-Gen-Expression-und-Protein-Interaktion-A-Katz-Zentralitätspone.0024306.G001 ”von Zhao J, Yang T, Huang Y, Holme P - Bilddatei von Zhao J, Yang T, Huang Y, Holme P (2011). "Ranking Kandidatenerkrankungsgene aus der Genexpression und der Proteinwechselwirkung: Ein auf Katz-Zentralität basierender Ansatz". PLUS EINS. Doi: 10.1371/Journal.Pone.0024306. PMID 21912686. PMC: 3166320 (CC by 3.0) über Commons Wikimedia
2. "Manhattan Plot" von m. Kamran Ikram et al. - Ikram MK et al. (2010) Vier neue Loci (19Q13, 6Q24, 12Q24 und 5Q14) beeinflussen die Mikrozirkulation in vivo. PLoS Genet. 2010 Okt 28; 6 (10): E1001184. doi: 10.1371/Journal.pgen.1001184.G001 (CC von 2.5) über Commons Wikimedia