Unterschied zwischen CDs und ORF

Unterschied zwischen CDs und ORF

Der Schlüsselunterschied Zwischen CDs und ORF ist das CDs ist, dass die tatsächliche Nukleotidsequenz eines Gens, das in ein Protein übersetzt, während ORF eine DNA -Sequenz ist, die mit der Translationsinitiationsstelle (Startcodon) beginnt und mit einer Translation -Terminierungsstelle (Stopp -Codon) endet.

Ein Gen hat eine Codierungssequenz (CDS). Es besteht aus Total -Exons des Gens und einem Startcodon und einem Stop -Codon. Es ist der tatsächliche Teil des Gens, der das Protein übersetzt und produziert. Open Reades Frame oder ORF ist eine Nukleotidsequenz zwischen einem Startcodon und einem Stoppcodon. Es gibt kein Stop -Codon in einem ORF, das den genetischen Code unterbricht, was zu einem Protein führt. In Prokaryoten sind CDs und ORF eines Gens gleich.

INHALT

1. Überblick und wichtiger Unterschied
2. Was ist CDs 
3. Was ist ORF
4. Ähnlichkeiten zwischen CDs und ORF
5. Seite an Seite Vergleich - CDS vs ORF in tabellarischer Form
6. Zusammenfassung

Was ist CDs?

CDs oder Codierungssequenz ist der Teil des Gens, der sich tatsächlich in ein Protein übersetzt. Es umfasst Exons und zwei Codons, die als Aug -Codon und Stop -Codon bekannt sind. CDs enthält keine zwei nicht translatierten Regionen: 5 'UTR und 3 "UTR. Darüber hinaus sind Introns nicht in CDs enthalten.

Abbildung 01: Codierungssequenz

Im Vergleich zu dem gesamten Genom eines Individuums sind kodierende Sequenzen eine kleine Fraktion. Die codierende Sequenz besteht aus der notwendigen Nukleotidsequenz, um die Aminosäuresequenz des Proteins zu machen. Daher sind CDs konzentrierte Exons, die in Nucleotid -Tripletts oder -Codons unterteilt werden können. Codons führen zu Aminosäuren.

Was ist ein ORF?

Offener Leserahmen oder ORF ist die kontinuierliche Strecke einer Nukleotidsequenz, die mit einem Startcodon beginnt und mit einem Stoppcodon endet. In einfachen Worten bezieht sich ORF auf den Bereich der Nucleotidsequenz zwischen Start- und Stoppcodons. Dazwischen gibt es kein Stop -Codon, das die ORF unterbricht. Die Nukleotidsequenz zwischen Start- und Stoppcodon codiert für Aminosäuren. Im Allgemeinen ist das Startcodon ATG, während Stoppcodons Tag, TAA und TGA sind. ORF gibt ein funktionelles Protein an, wenn sie transkribiert und übersetzt werden. Daher enthält ORF ein Startcodon, mehrere Codons im mittleren Bereich und ein Stop -Codon. Interessanterweise hat ORF eine Länge, die durch drei geteilt werden kann.

Abbildung 02: Leserahmen öffnen

In Prokaryoten, da es keine Introns gibt, ist ORF die kodierende Sequenz eines Gens, das direkt in mRNA transkribiert. Daher sind CDs und PRF in Prokaryoten gleich. Bei der Suche nach Genen in Prokaryoten ist es leicht, ein ORF zu erkennen und ein Gen in Prokaryoten zu finden.  In Eukaryoten, da es Introns gibt, ist ORF die Codonsequenz, die sich nach Verarbeitung oder RNA -Spleißen bildet. ORF ist ein Beweis, der die Genvorhersage unterstützt, da lange ORF wahrscheinlich Teil eines Gens ist.

Was sind die Ähnlichkeiten zwischen CDs und ORF??

  • In Prokaryoten sind CDs und ORF gleich.
  • Beide haben Startcodon und Stopp -Codon.
  • Sie haben eine Reihe von Nukleotiden, die durch drei geteilt werden können.
  • Sobald sie übersetzt werden, produzieren sie Aminosäuresequenzen.

Was ist der Unterschied zwischen CDs und ORF?

CDs ist der tatsächliche Teil des Gens, der sich in ein Protein übersetzt, während ORF der DNA -Abschnitt zwischen einem Startcodon und einem Stoppcodon ist. Dies ist also der Hauptunterschied zwischen CDs und ORF. Darüber hinaus enthält CDs keine Introns, aber ORF kann Introns enthalten. CDs transkribiert vollständig in eine vollständige mRNA -Sequenz, während ORF Teil der mRNA -Sequenz sein kann. Dies ist also ein weiterer Unterschied zwischen CDs und ORF.

Die folgenden Infografik -Tabuls nebeneinander die Unterschiede zwischen CDs und ORF.

Zusammenfassung -CDs gegen ORF

CDs und ORF sind zwei wichtige Teile eines Gens. CDs bezieht sich auf die tatsächliche Region der DNA, die sich in ein Protein übersetzt. ORF ist eine Sequenz von DNA, die mit dem Startcodon „ATG“ beginnt und mit einem der drei Terminierungscodons endet (TAA, Tag oder TGA). ORF kann Teil der vollständigen mRNA eines Gens sein. Die codierende Sequenz eines Gens transkribiert jedoch auf die vollständige mRNA -Sequenz. Alle CDS sind ORFs. Aber nicht alle ORFs sind CDSS. Dies fasst also den Unterschied zwischen CDs und ORF zusammen.

Referenz:

1. „Öffnen Sie den Leserahmen.Wikipedia, Wikimedia Foundation, 27. November. 2020, hier erhältlich.

Bild mit freundlicher Genehmigung:

1. "Codierungsregion in DNA" von Pragpats - eigene Arbeit (CC BY -SA 4.0) über Commons Wikimedia
2. "Sampleorf" von Luongdl - eigene Arbeit (Public Domain) über Commons Wikimedia