Unterschied zwischen DNTP und DDNTP

Der Schlüsselunterschied Zwischen DNTP und DDNTP ist das DNTP oder Desoxyribonukleotide sind die Bausteine ​​der DNA und haben a 3-OH -Gruppe auf der Pentose -Zuckerstruktur, während DDNTP- oder Dideoxynukleosidtriphosphate Nukleotide sind, die mangeln 3-OH -Gruppe und sie werden in der Sanger -Dideoxy -DNA -Sequenzierungstechnik verwendet, um DNA -Sequenzen unterschiedlicher Länge zu erzeugen.

DNTP und DDNTP sind Nukleotide. DNTP bezieht sich auf Desoxyribose -Nukleotide. Sie sind die Bausteine ​​der DNA. DNTPs werden verwendet, um DNA zu synthetisieren. DNTP hingegen bezieht sich auf Dideoxynukleosidtriphosphate. Sie werden in der Sanger -Sequenzierung verwendet, um die DNA -Synthese in unterschiedlichen Längen zu beenden. Ihnen fehlt eine OH -Gruppe an der 3ʹ -Position. Ein Wasserstoff ist an der Position 3 ʹ anstelle der OH -Gruppe vorhanden. Daher können DDNTPs keine Phosphodiesterbindung mit dem nächsten Nukleotid bilden. DNTP ist in der Lage, die Synthese von DNA auszuführen, während DDNTP die Polymerisation von DNA beenden kann.

INHALT

1. Überblick und wichtiger Unterschied
2. Was ist dntp 
3. Was ist ddntp
4. Ähnlichkeiten zwischen DNTP und DDNTP
5. Seite für Seitenvergleich - dntp vs ddntp in tabellarischer Form
6. Zusammenfassung

Was ist dntp?

DNTP steht für Desoxyribose -Nukleotid oder Desoxyribonukleotid. Es ist der Baustein der DNA. Es gibt vier Arten von DNTPs. Sie sind DATP, DTTP, DCTP und DGTP. Sie sind nach den stickstoffhaltigen Basen von Purin oder Pyrimidin benannt: Adenin (A), Guanin (G), Thymin (T) und Cytosin (c).

Abbildung 01: DNTP

Adenin und Guanin sind Purinbasen, während Thymin und Cytosin Pyrimidinbasen sind. Der Pentosezucker von DNTP ist Desoxyribose. Es gibt auch eine Phosphatgruppe. Daher besteht DNTP aus drei Komponenten: einer stickstoffhaltigen Base, Desoxyribosezucker und einer Phosphatgruppe. Diese DNTPs verbinden sich über Phosphodiesterbindungen miteinander. In DNTPs gibt es eine OH -Gruppe, die an Position 3ʹ von Pentosezucker gebunden ist, die erforderlich ist, um eine Verbindung mit der Phosphatgruppe zu bilden, die an den 5ʹ -Kohlenstoff des Zuckers des nächsten Nukleotids gebunden ist. Da alle DNTPs diese 3ʹ -OH -Gruppe haben, können sie DNA -Stränge synthetisieren und erweitern. Daher fungiert DNTP als grundlegende Wiederholungseinheit von DNA und chemischer Angelegenheit von Genen. Die DNA -Synthese verläuft immer von 5ʹ bis 3ʹ.

Was ist ddntp?

Die Sanger-Sequenzierung ist eine DNA-Sequenzierungsmethode der ersten Generation, die von Frederick Sanger und seinen Colleges im Jahr 1977 entwickelt wurde. Es ist auch als Kettenabschlussequenzierung oder Dideoxy -Sequenzierung bekannt, da das Grundprinzip dieser Methode die Kettenabschluss unter Verwendung von Dideoxynucleosidtriphosphaten (DDNTPs) ist. DDNTPs sind Nukleotide, die bei der Sanger -Sequenzierung verwendet werden. Die Sanger -Sequenzierung basiert auf dem selektiven Einbau von DDNTPs und der Beendigung der DNA -Synthese während der in vitro DNA Replikation. Die Spezialität der DDNTPs ist, dass ihnen die 3ʹ-OH-Gruppe am Pentosezucker fehlt, um die Bildung der Phosphodiesterbindungen zwischen der Phosphatgruppe von 5 ° in benachbarten Nukleotid fortzusetzen. Sobald ein DDNTP an den Ausdehnungstrang befestigt ist, hört die Kettenverlängerung ab und endet von diesem Punkt. DDNTPs wirken als kettenbezogene Inhibitoren der DNA-Polymerase während der Sanger-Sequenzierungsmethode.

Abbildung 02: ddntp

Es gibt vier DDNTPs: DDATP, DDCTP, DDGTP und DDTTP, die in der Sanger -Sequenzierung verwendet werden. Diese Nukleotide stoppen den DNA -Replikationsprozess, wenn sie in den wachsenden DNA -Strang eingebaut werden. Infolgedessen erzeugt die Sanger -Sequenzierung unterschiedliche Längen der kurzen DNA. Kapillargelelektrophorese wird verwendet, um diese kurzen DNA -Stränge nach ihren Größen auf einem Gel zu organisieren. DDNTPs sind radioaktiv oder fluoreszenz mit verschiedenen Farben markiert, um die DNA -Sequenz zu vereinfachen. Durch Analyse des Gels kann die Nukleotidsequenz des unbekannten DNA -Strangs bestimmt werden.

Was sind die Ähnlichkeiten zwischen DNTP und DDNTP?

• Sowohl DNTP als auch DDNTP werden in der Sanger -Sequenzierung verwendet.
• Es gibt vier Arten von DNTPs und DDNTPs.
• Sie bestehen aus drei Komponenten: einer stickstoffhaltigen Basis, Desoxyribosezucker und Phosphatgruppen.

Was ist der Unterschied zwischen DNTP und DDNTP?

DNTP ist eine der vier Arten von Desoxyribonukleotiden, die Bausteine ​​von DNA sind. DDNTP ist eine der vier Arten von Dideoxyribonukleosidtriphosphaten, die in der Sanger -Sequenzierungstechnik verwendet werden. DNTP hat eine 3ʹ-OH. Dies ist daher der Schlüsselunterschied zwischen DNTP und DDNTP. Darüber hinaus führen DNTPs DNA -Polymerisation durch, während DDNTPs die DNA -Polymerisation beenden. Daher ist dies ein weiterer großer Unterschied zwischen DNTP und DDNTP.

Die folgende Infografik listet die Unterschiede zwischen DNTP und DDNTP in tabellarischer Form auf.

Zusammenfassung -dntp vs ddntp

Normale DNTPs sind Bausteine ​​von DNA, während DDNTPs Nukleotide sind, die in der Sanger -Sequenzierungstechnik verwendet werden. DNTP hat 3ʹ-oh, während ddntp 3ʹ-oh fehlt. Dies ist daher der Schlüsselunterschied zwischen DNTP und DDNTP. Darüber hinaus kann DNTP einen DNA -Strang synthetisieren, während DDNTP die DNA -Polymerisation beenden kann. Daher werden DDNTPs in der Sanger -Sequenzierung verwendet, um unterschiedliche DNA -Stränge mit unterschiedlichen Längen zu erzeugen. Während der Sanger -Sequenzierung sind sowohl DNTP als auch DDNTP enthalten.

Referenz:

1. „Dideoxynukleotid.”Wikipedia, Wikimedia Foundation, 12. Juli 2020, hier erhältlich.
2. „Struktur und Funktion von DNA.”Lumen, hier erhältlich.

Bild mit freundlicher Genehmigung:

1. "Desoxyribonukleotide" Par Bionet - Travail -Personal (CC0) über Commons Wikimedia

2. "Dideoxy -Beendigung der DNA -Dehnung en" von Michał Sobkowski - eigene Arbeit (CC von 3.0) über Commons Wikimedia