Unterschied zwischen genomischer DNA und Plasmid -DNA -Isolierung

Der Schlüsselunterschied Zwischen genomischer DNA und Plasmid -DNA -Isolierung ist die Genomische DNA -Isolierungen zielen auf die Extraktion der genomischen DNA ab.

Die DNA -Isolierung ist ein chemischer Prozess, bei dem DNA von verschiedenen Spezies oder aus verschiedenen Proben isoliert wurde. Die DNA -Isolierung ist wichtig bei stromabwärts gelegenen Molekularbiologie -Techniken wie Gelelektrophorese, Polymerasekettenreaktion und DNA -Sequenzierungstechniken. Daher ist die Isolierung von DNA ein wesentlicher chemischer Prozess in molekularen biologischen Untersuchungen. Basierend auf dem Zweck der Forschung ist es manchmal notwendig, genomische DNA zu isolieren. Darüber hinaus konzentrieren sich einige Studien auf die Isolierung von Plasmid -DNA aus Bakterien. Genomische DNA -Isolierung ist der Prozess der isolierten genomischen DNA aus einer prokaryotischen oder einer eukaryotischen Probe. Die Isolationsschritte unterscheiden sich je nach Art der Zelle, in der die DNA isoliert. Die Plasmid -DNA -Isolierung ist der Prozess der Isolierung von Plasmid -DNA aus einer Bakterienzelle. Im Vergleich zur genomischen DNA -Isolierung ist der Gesamtprozess in der Plasmid -DNA -Isolierung komplex.

INHALT

1. Überblick und wichtiger Unterschied
2. Was ist eine genomische DNA -Isolierung
3. Was ist Plasmid -DNA -Isolation
4. Ähnlichkeiten zwischen genomischer DNA und Plasmid -DNA -Isolierung
5. Seite für Seitenvergleich - Genomische DNA gegen Plasmid -DNA -Isolierung in tabellarischer Form
6. Zusammenfassung

Was ist eine genomische DNA -Isolierung?

Genomische DNA -Isolierung ist der Prozess der Extraktion der gesamten genomischen DNA eines Organismus. Dieser spezielle Prozess beinhaltet drei wichtigste Ereignisse. Sie sind Zelllyse oder Kernlyse, Proteinabbau oder Proteolyse und Ausfällung der genomischen DNA. Der Lyse -Schritt kann sich je nach Zelltyp unterscheiden. In Prokaryoten sollte der erste Schritt die Aufschlüsselung der Zellwand sein, da es eine Peptidoglycan -Zellwand gibt. Andererseits beinhaltet der Lyse -Schritt in Eukaryoten den Abbau der Plasmamembran und der Kernmembran, um die DNA nach außen herauszuholen. Im Gegensatz dazu sind besondere Schritte für die Lyse der Pflanz- und Pilzzellwände von entscheidender Bedeutung.

Abbildung 01: Genomische DNA -Isolierung

Nach Abschluss des Lyse -Schritts wird die DNA schließlich zum Überstand kommen. Gleichzeitig erfolgt der Proteinabbau auch in der Lösung aufgrund der Zugabe von Proteinase K. Der nächste Schritt besteht darin, die genomische DNA zu trennen und Proteine ​​voneinander abzubauen. Daher trennen sich die degradierten Proteine ​​durch Niederschlag, die es der genomischen DNA im Überstand ermöglichen, im Überstand zu bleiben. Nach der Ausfällung von Proteinen kann genomische DNA in einem geeigneten Puffer ausgefällt und neu geschnitten werden, bis sie für das Experiment erforderlich ist.

Genomische DNA, die lineare DNA ist, enthält alle genetischen Informationen eines Organismus. Mit anderen Worten, das Genom ist das Vererbungsmaterial eines lebenden Organismus, der für alle strukturellen und funktionellen Aktivitäten der Zelle verantwortlich ist. Es besteht sowohl aus codierenden als auch nicht-kodierenden DNA-Sequenzen. Bei der Isolierung genomischer DNA enthält es das gesamte Genom des Organismus.

Was ist Plasmid -DNA -Isolation?

Die Plasmid -DNA -Isolierung ist ein besonderer und komplizierterer Prozess der DNA -Isolierung. Plasmide sind extrachromosomale DNA in den meisten Bakterienzellen. Sie sind ruhende kreisförmige DNA, die die Bakterien unterstützt, um unter harten Umweltbedingungen zu überleben. Plasmid -DNA besteht aus speziellen resistenten Genen, die den Bakterien wie Antibiotikaresistenz, Virulenzeigenschaften und toxischen Eigenschaften zusätzliche Vorteile bieten.

Abbildung 02: Plasmid -DNA -Isolierung

Die Plasmid -DNA -Isolierung beinhaltet auch drei Hauptprozesse; Zelllyse, Proteinolyse und DNA -Ausfällung. Obwohl der biochemische Mechanismus der Isolierung dem der genomischen DNA -Isolierung ähnlich ist, ist der Prozess komplexer als es. Der Zelllyseprozess ist der wichtigste Prozess in diesem Verfahren. Am wichtigsten ist, dass genomische DNA und Plasmid -DNA nicht miteinander gemischt werden sollten. Daher enthält ein viel milderer Lyse -Prozess in das Plasmid -DNA -Isolierungsverfahren. Daher verwenden in den meisten Plasmid -DNA -Isolierungsverfahren das Reinigungsmittel; Natriumdodecylsulfat für die Zelllyse.

Was sind die Ähnlichkeiten zwischen genomischer DNA und Plasmid -DNA -Isolierung?

• Genomische DNA und Plasmid -DNA -Isolierung konzentrieren sich auf die Extraktion der DNA eines Organismus.
• Außerdem folgen beide dem gleichen Gesamtprozess, der Zelllyse, Proteinabbau und DNA -Ausfällung umfasst.
• Darüber hinaus ist die resultierende DNA beider Prozesse für nachgeschaltete Prozesse wichtig.
• Darüber hinaus umfassen beide Isolationsprozesse die Schritte zum Reinigen und Speichern der DNA unter bestimmten Speicherbedingungen.
• Außerdem wird Proteinase K in beiden Methoden zum Abbau von Proteinen verwendet.

Was ist der Unterschied zwischen genomischer DNA und Plasmid -DNA -Isolierung?

Die genomische DNA -Isolierung konzentriert sich auf die Extraktion der gesamten genomischen DNA des Zielorganismus, während sich die Plasmid -DNA -Isolierung darauf konzentriert. Daher ist dies der Schlüsselunterschied zwischen genomischer DNA und Plasmid -DNA -Isolierung. Darüber hinaus liegt ein weiterer Unterschied zwischen genomischer DNA und Plasmid -DNA -Isolierung im Verfahren. Die genomische DNA -Isolierung ist ein weniger komplexes Verfahren im Vergleich zur Plasmid -DNA -Isolierung. Bei der Isolierung von Plasmid -DNA müssen daher Vorsichtsmaßnahmen getroffen.

Das folgende Infograohic liefert weitere Details zum Unterschied zwischen genomischer DNA und Plasmid -DNA -Isolierung.

Zusammenfassung -genomische DNA gegen Plasmid -DNA -Isolierung

Die DNA -Isolierung ist ein wichtiger Prozess bei molekularen Biologie -Techniken. Es gibt zwei Arten von DNA, nämlich genomische DNA und Plasmid-DNA (extra-chromosomale DNA). Basierend auf den Anforderungen, einige Verfahren, die zur Isolierung genomischer DNA durchgeführt wurden, während einige Verfahren der Isolierung von nur Plasmid -DNA aus Bakterien konzentrieren. Daher unterscheiden sich die in beiden Prozesse beteiligten Schritte geringfügig voneinander. Der Gesamtprozess ist jedoch in beiden Isolierungen gleich. Die isolierte DNA beider Prozesse hat immensen in nachgeschalteten Prozessen wie Klonierung, Gelelektrophorese und Polymerasekettenreaktionen. Am Ende des genomischen DNA -Isolierungsprotokolls kann die gesamte genomische DNA des Organismus als Endprodukt isoliert werden. Daher ist dies der Unterschied zwischen genomischer DNA und Plasmid -DNA -Isolierung.

Referenz:

1.„DNA -Extraktion aus Bakterien.” DNA -Extraktion aus Bakterien. Hier verfügbar 

Bild mit freundlicher Genehmigung:

1."DNA -Extraktion" von Joo Nath - eigene Arbeit (CC BY -SA 4).0) über Commons Wikimedia 
2."Plasmid miniprep" von Retama - eigene Arbeit, (CC BY -SA 4.0) über Commons Wikimedia