Unterschied zwischen Microarray und Sequenzierung der nächsten Generation
Schlüsselunterschied - Microarray gegen Sequenzierung der nächsten Generation
DNA -Sequenzierungsprozesse werden in den Bereichen Biotechnologie, Virologie, medizinische Diagnose und forensische Wissenschaften häufig verwendet. Es ist ein Prozess, der die genaue Reihenfolge der Nukleotide, Adenin, Guanin, Thymin und Cytosin in einem DNA -Molekül vorliegt. DNA -Sequenzierungsverfahren sind zu einem Beschleunigungsmittel für wundersame Entdeckungen in der medizinischen und biologischen Forschung geworden. Diese Sequenzierungsmethoden haben sich zur Sequenzierung eines vollständigen Genoms einzelner Organismen wie Menschen und anderer lebender Arten entwickelt. Microarrays und Sequenzierung der nächsten Generation sind moderne DNA -Sequenzierungsverfahren. Die Microarray -Technik basiert speziell auf der Hybridisierung, die einen Satz bekannter Ziele enthält. Die Sequenzierung der nächsten Generation basiert auf der Synthese (bei der DNA -Polymerase zum Einbau von Nukleotiden verwendet wird) und kann das gesamte Genom unabhängig von zuvor ausgewählten Zielen sequenzieren. Dies ist der Schlüsselunterschied zwischen Microarray und Sequenzierung der nächsten Generation.
INHALT
1. Überblick und wichtiger Unterschied
2. Was ist Microarray
3. Was ist Sequenzierung der nächsten Generation
4. Ähnlichkeiten zwischen Microarray und Sequenzierung der nächsten Generation
5. Seite für Seite Vergleich - Microarray gegen Sequenzierung der nächsten Generation in tabellarischer Form
6. Zusammenfassung
Was ist Microarray?
DNA Microarray wird als Laborwerkzeug verwendet, um gleichzeitig Tausende verschiedener Genausdrücke zu identifizieren. Es ist eine feste Oberfläche, ich.e., Mikroskop -Objektträger, der eine Sammlung von mikroskopischen DNA -Flecken enthält, die darauf gedruckt sind. Jeder gedruckte Punkt enthält eine bekannte Gensequenz oder ein Gen. Diese auf der Folie gedruckten bekannten Sonden dienen als Sonden, um die Genexpression nachzuweisen. Dies ist als Transkriptom bekannt. Die Hybridisierung zwischen zwei DNA -Strängen ist das primäre Prinzip, auf dem Microarrays basieren. Es ist die komplementäre Basenpaarung von Nukleinsäuresequenzen mit der Bildung von Wasserstoffbrückenbindungen.
Abbildung 01: Microarray
Anfänglich werden mRNA. Experimentelle Proben werden von erkrankten Personen erhalten; Zum Beispiel eine Person, die an Krebs leidet. Sobald Sie erhalten wurden, werden beide mRNA -Proben in cDNA (komplementäre DNA) umgewandelt, um. Als nächstes wird jede Probe unter Verwendung einer Fluoreszenzsonde markiert. Die Fluoreszenzsonden haben unterschiedliche Farben, um die Proben -cDNA von der Referenz -cDNA zu unterscheiden. Um die Bindung der cDNA -Moleküle an den Microarray -Objektträger zu initiieren. Hybridisierung ist der Prozess, durch den die cDNA -Moleküle an den DNA. Sobald die Hybridisierung abgeschlossen ist, findet eine Reihe von Reaktionen statt, um die Expression jedes Gens mit dem Auftreten verschiedener Farben gemäß der Menge des exprimierten Gens zu identifizieren und zu messen. Die Ergebnisse von Microarray werden bei der Schaffung eines Genexpressionsprofils verwendet, das verwendet werden kann, um verschiedene Erkrankungen zu identifizieren.
Was ist Sequenzierung der nächsten Generation?
Die Sequenzierung der nächsten Generation (NGS) ist eine erweiterte Methode der genetischen Sequenzierung. Sein Prinzip ähnelt dem der Sanger -Sequenzierung, die von der Kapillarelektrophorese abhängt. In NGS wird der genomische Strang fragmentiert und in einen Vorlagenstrang ligiert. Die Grundlagen jedes Strangs werden durch die emittierten Signale während ihres Ligationsprozesses identifiziert. Bei der Sanger -Sequenzierungsmethode sind drei separate Schritte, Sequenzierung, Trennung und Nachweis beteiligt. Aufgrund dieser getrennten Schritte ist die Automatisierung der Probenvorbereitung im Durchsatz begrenzt. In NGS wird die Technik unter Verwendung einer Array -basierten Sequenzierung mit der Kombination der Schritte des Sanger -Sequenzierungsverfahrens entwickelt, die dazu führen können, dass Millionen von Reaktionserien gleichzeitig parallel durchgeführt werden. Dies führt zu hohen Geschwindigkeit und Durchsatz zu niedrigen Kosten.
Abbildung 02: Entwicklungen in NGS
NGS besteht aus drei Schritten; Bibliotheksvorbereitung (Erstellung von Bibliotheken mit der Verwendung von zufälliger Fragmentierung von DNA), Amplifikation (Amplifikation der Bibliothek unter Verwendung klonaler Amplifikation und PCR) und Sequenzierung). Die Genomsequenzierungsverfahren, die für extrem lange Dauer unter Verwendung des Sanger -Sequenzierungsverfahrens durchgeführt werden, könnte innerhalb weniger Stunden mit NGS abgeschlossen werden.
Was ist die Ähnlichkeit zwischen Microarray und Sequenzierung der nächsten Generation?
- Sowohl Microarray- als auch Sequenzierung der nächsten Generation werden unter Verwendung von Array -basierten Sequenzierung entwickelt.
Was ist der Unterschied zwischen Microarray und Sequenzierung der nächsten Generation?
Microarray gegen Sequenzierung der nächsten Generation | |
| Microarray ist eine Sammlung mikroskopischer DNA. | NGS (Sequenzierung der nächsten Generation) ist eine nicht sangerbasierte Hochdurchsatz-DNA-Sequenzierungstechnologie, die Millionen oder Milliarden DNA-Stränge parallel sequenziert werden kann. |
| Wechselwirkungen mit Antigen | |
| Microarray basiert auf Hybridisierung, die aus einem Satz bekannter Ziele besteht. | NGS basiert auf der Synthese, die DNA -Polymerase zum Einbau von Nukleotiden verwendet und unabhängig von zuvor ausgewählten Zielen ist. |
Zusammenfassung -Microarray gegen Sequenzierung der nächsten Generation
Im Kontext der Forschung ist die DNA -Sequenzierung zu einem wichtigen Beschleunigungsmittel geworden. Es wird in Biotechnologie, medizinischer Diagnose und forensischen Studien häufig verwendet. Es hat sich zu effizienteren und schnellen Sequenzierungsverfahren entwickelt und entwickelt. Microarrays und NGs sind zwei fortschrittliche DNA -Sequenzierungstechniken vorhanden. Beide werden unter Verwendung von Array -basierter Sequenzierung entwickelt. Die Microarray -Technik basiert auf der Hybridisierung, während NGs auf der Synthese basiert, bei der DNA -Polymerase zum Einbau von Nukleotiden verwendet wird. Dies ist der Hauptunterschied zwischen Microarray und Sequenzierung der nächsten Generation.
Laden Sie die PDF -Version von Microarray gegen Sequenzierung der nächsten Generation herunter
Sie können die PDF -Version dieses Artikels herunterladen und ihn für Offline -Zwecke gemäß Citation Note verwenden. Bitte laden Sie die PDF -Version hier den Unterschied zwischen Microarray und Sequenzierung der nächsten Generation herunter
Verweise:
1.Behjati, Sam und Patricks Tarpey. „Was ist die Sequenzierung der nächsten Generation?Archive der Krankheit in der Kindheit. Ausgabe für Bildung und Praxis, BMJ Publishing Group, Dez. 2013, hier erhältlich. Zugriff 23. August. 2017
2.Bumgarner, Roger. „Überblick über DNA Microarrays.Aktuelle Protokolle in der Molekularbiologie, John Wiley und Sons Inc., 9. Februar. 2016, hier erhältlich. Zugriff 23. August. 2017.
3.„DNA Microarray -Technologie.”Nationales Human Genome Research Institute (NHGRI), hier verfügbar. Zugriff 23. August. 2017.
Bild mit freundlicher Genehmigung:
1. "DNA Microarray" von Guillaume Paumier (Benutzer: Guillom) - eigene Arbeit (CC BY -SA 3.0) über Commons Wikimedia
2. „Entwicklungen in der Sequenzierung der nächsten Generation“ von Nederbragt, Lex (2012) - (CC von 3.0) über Commons Wikimedia
