Unterschied zwischen NGS und WGS

Der Schlüsselunterschied zwischen NGS und WGS ist, dass die Sequenzierung der nächsten Generation (NGS) eine massiv parallele Sequenzierungstechnologie der zweiten Generation ist, die einen hohen Durchsatz, kostengünstig und schnell ist, während Sequenzierung des Gesamtgenoms (WGS) eine umfassende Methode zur Analyse der gesamten genomischen DNA einer Zelle ist zu einem einzigen Zeit.

In den letzten Jahrzehnten hat das Verständnis des Genoms von Menschen und anderen Tieren aufgrund der Entdeckung schneller Sequenzierungstechniken und Bioinformatikwerkzeuge massiv zugenommen. Konventionelle Sequenzierungstechniken wie die Sanger-Sequenzierung hatten ihre Grenzen, die die Entwicklung neuer Rapid-Sequenzierungsmethoden wie Sequenzierung der nächsten Generation (NGS) und Nanopore-Sequenzierung erforderten. Die WGS-Technik (Ganz-Genomsequenzierung) ist ein neuer Ansatz, der bereits in vielen genomischen Forschungsprojekten verwendet wird, wie das 100.000 genomische Projekt von Genomic England, UK. NGS und WGS sind also zwei Sequenzierungsmethoden, die sich derzeit in vielen genomischen Projekten einbeziehen.

INHALT

1. Überblick und wichtiger Unterschied
2. Was ist NGS 
3. Was ist WGS
4. Ähnlichkeiten - NGS und WGS
5. NGS vs WGs in tabellarischer Form
6. Zusammenfassung - NGS vs WGS

Was ist NGS?

Ngs (Sequenzierung der nächsten Generation) ist eine massiv parallel. Es gibt keine genaue Definition für die Sequenzierung der nächsten Generation. Wir können es jedoch deutlich von herkömmlichen Sequenzierungstechniken auf Kapillarbasis unterscheiden. Die Sequenzierung der nächsten Generation ermöglicht die Sequenzierung eines DNA-Moleküls mit einer Gesamtgröße von mehr als 1 Million Basenpaaren in einem einzelnen Experiment. Es bietet beispiellose Geschwindigkeit und hohe Durchsatzoptionen, z. Dies wird durch Miniaturisierung des Volumens einzelner Sequenzierungsreaktionen erreicht. Darüber hinaus begrenzt dies auch die Größe der Instrumente und minimiert die Kosten für Reagenzien pro Reaktion.

Abbildung 01: NGS -Plattformen

NGS ist eine kurzlesene Sequenzierungsmethode, die das Bereich der biologischen Forschung bereits revolutioniert hat. Darüber hinaus wird NGS in verschiedenen Bereichen wie De-novo-Genomsequenzierung, Sequenzierung des Gesamtgenoms, Transkriptomanalyse, kleiner RNA- und Mikro-RNA.

Was ist WGS?

Wgs (Sequenzierung des gesamten Genoms) ist eine umfassende Methode zur Analyse der gesamten genomischen DNA einer Zelle zu einem einzigen Zeit. Es ist auch als vollständige Genomsequenzierung oder komplette Genomsequenzierung bekannt. Die Sequenzierung des gesamten Genoms beinhaltet die Sequenzierung der chromosomalen DNA eines Organismus sowie die DNA in Mitochondrien und für Pflanzen die DNA im Chloroplasten zu einem einzigen Zeitpunkt. Mit WGS können Wissenschaftler die genaue Abfolge aller Buchstaben lesen, aus denen die vollständige DNA -Menge besteht. Es wird erwartet.

Abbildung 02: WGS gegen hierarchische Schrotflintensequenzierung

Die Sequenzierung des gesamten Genoms wurde 2014 in die klinische Versorgung eingeführt. Darüber hinaus beinhaltet die Anwendung von WGs die Gensequenzierung auf SNP -Ebene auf die Funktionsvarianten in Assoziationsstudien, die therapeutische Intervention in personalisierte Medizin, Evolutionsbiologie, vergleichende genomische Analyse, Mutationen und Umlagerungen, seltene Varianten -Assoziationsstudien und Vorhersage von Erkrankungen Ansauigkeit und Drogen Antwort.

Was sind die Ähnlichkeiten zwischen NGS und WGS?

• NGs und WGs sind zwei Sequenzierungstechniken.
• Beide Techniken entweder Sequenz -DNA oder RNA.
• Diese Techniken sind neu und zuverlässig.
• Sie werden beide zur Diagnose von Krankheiten und Drogenentdeckungen verwendet.

Was ist der Unterschied zwischen NGS und WGS?

NGS ist eine massiv parallele Sequenzierungstechnologie der zweiten Generation, die einen hohen Durchsatz, kostengünstigen und schnellen Kosten entspricht, während WGS eine umfassende Methode zur Analyse der gesamten genomischen DNA einer Zelle zu einer einzigen Zeit durch Verwendung von Sequenzierungstechniken wie Sanger-Sequenzierung, Shotgun ist Annäherung oder NGS -Sequenzierung mit hohem Durchsatz. Dies ist also der Hauptunterschied zwischen NGS und WGS. Darüber hinaus besteht NGS nur aus Sequenzierungsmethoden der zweiten Generation, während WGS aus den ersten, Sequenzierungsmethoden der ersten, zweiten und dritten Generationen besteht.

Die folgende Tabelle zeigt die Unterschiede zwischen und NGS und WGS in tabellarischer Form für den Vergleich von Seite für Seite.

Zusammenfassung -NGS vs WGS

In den letzten Jahrzehnten wurden in der zeitgenössischen molekularen Forschung routinemäßig verschiedene Sequenzierungstechniken angewendet. Und selbst sie sind sehr leistungsstarke Werkzeuge für viele klinische Anwendungen. NGS und WGS sind zwei Sequenzierungsmethoden, die sich derzeit in vielen genomischen Projekten einbeziehen.   NGS ist eine Sequenzierungstechnologie der zweiten Generation, die einen hohen Durchsatz, kostengünstige und schnell. Andererseits ist WGS eine Methode zur Analyse der gesamten genomischen DNA oder der vollständigen genomischen DNA einer Zelle zu einem einzigen Zeit. Dies ist also die Zusammenfassung des Unterschieds zwischen NGS und WGS.

Referenz:

1. Behjati, Sam und Patricks Tarpey. „Was ist die Sequenzierung der nächsten Generation?Archive der Krankheit in der Kindheit. Ausgabe für Bildung und Praxis, BMJ Publishing Group.
2. „Die Sequenzierung des gesamten Genoms.”Ein Überblick | Sciencedirect -Themen.

Bild mit freundlicher Genehmigung:

1. „Sequenzierung der 2. Generation“ von Chandra Shekhar Pareek, Rafal Smoczynski und Andrzej Tretyn - Journal of Applied Genetics - Band 52 - Ausgabe 4 (CC BY -SA 3.0) über Commons Wikimedia
2. "Ganzes Genom -Schrotflintensequenzierung versus hierarchische Schrotflintensequenzierung" von Commins, J., Toft, c., Tarife, m. A. - "Computerbiologische Methoden und ihre Anwendung auf die vergleichende Genomik endozellulärer symbiotischer Bakterien von Insekten" Biol ". Verfahren online (2009). Zugriff über Springerimages. (CC BY-SA 2.5) über Commons Wikimedia