Unterschied zwischen Primer und Promotor

Unterschied zwischen Primer und Promotor

Der Schlüsselunterschied Zwischen Primer und Promotor ist das Primer ist eine kommerziell synthetisierte kurze DNA -Sequenz, die in der PCR zur Amplifikation einer Ziel -DNA -Sequenz verwendet wird, während der Promotor eine spezifische DNA Transkriptionsfaktoren Um Transkription zu initiieren.

Primer und Promotor sind zwei Arten von DNA -Sequenzen. Primer ist ein kleines DNA -Fragment, das für die Polymerasekettenreaktion (PCR) benötigt wird. Es hat kurze Nukleotidsequenzen, die zum flankierenden Ende des DNA -Strangs komplementär sind. Es gibt zwei Arten von Primern, und sie wirken als Ausgangspunkte für die Synthese neuer DNA -Stränge. Im Gegensatz dazu ist ein Promotor eine spezifische DNA -Sequenz, die sich stromaufwärts bis zur Transkriptionsinitiationsstelle eines Gens befindet. Es interagiert direkt mit den Komponenten des Transkriptionsmechanismus wie RNA -Polymerase und Transkriptionsfaktoren, um die DNA -Transkription zu kontrollieren. Daher binden RNA -Polymerase und andere Transkriptionsfaktoren an die Promotorsequenz und initiieren die Transkription.

INHALT

1. Überblick und wichtiger Unterschied
2. Was ist ein Primer 
3. Was ist ein Promoter
4. Ähnlichkeiten zwischen Primer und Promotor
5. Seite für Seitenvergleich - Primer vs Promotor in tabellarischer Form
6. Zusammenfassung

Was ist ein Primer?

Primer sind kurze DNA -Sequenzen, die für die Amplifikation von Ziel -DNA -Sequenzen entwickelt wurden. Strukturell besitzen sie kurze Nukleotidsequenzen, die zu den flankierenden Enden der DNA -Doppelstränge komplementär sind. Sie sind normalerweise ungefähr 20 Nukleotide lang. Während der PCR katalysiert Taq -Polymerase die Zugabe von Nukleotiden in die bereits bestehende Nukleotidsequenz. Daher dienen Primer als Ausgangspunkte für die Synthese neuer Stränge. Taq -Polymerase funktioniert nur in 5 bis 3 'Richtung. Daher findet auch die DNA -Synthese in der gleichen 5 'bis 3' Richtung statt. Da die DNA doppelstrangiert ist, werden in der PCR zwei Arten von Primern benötigt. Sie sind als Vorwärtsprimer und Reverse Primer bekannt, basierend auf der Richtung der Verlängerung des Primers während der DNA -Synthese.

Abbildung 01: Primer

Forward Primer Tempern mit Antisense -DNA -Strang und initiiert die Synthese des + Strangs des Gens in 5 'bis 3' Richtung. Es hat eine kurze Nukleotidsequenz, die zum 3 'flankierenden Ende des Antisense -Strangs ergänzt. Reverse Primer -Tempern mit dem Sinnesstrang und initiiert die Synthese eines komplementären Strangs des kodierenden Strangs, der ein Strang des Gens in 5'to 3 'Richtung ist. Somit ist Reverse Primer komplementär zum 3' -Ende des Codierungsstrangs konzipiert. Beide umgekehrte und vorwärts -Primer sind wichtig für die Herstellung von Millionen bis Milliarden Kopien bestimmter Regionen DNA, die gezielt oder interessiert sind.

Was ist ein Promoter?

Der Promotor ist eine DNA. Es bietet eine Bindungsstelle für RNA -Polymerase und bestimmte regulatorische Elemente, um die Transkription des Gens zu initiieren. Es ist eine regulatorische Sequenz, die zum Ein- oder Ausschalten eines Gens erforderlich ist. Es gibt eine bestimmte Nukleotidsequenz im Promotor. Es kann 100-1000 Basispaare haben. Promotor zeigt die Transkriptionsrichtung. Darüber hinaus zeigt es den Sinnesstrang an, der transkribiert werden sollte.

Abbildung 02: Promotor eines Gens

Es gibt drei Arten von Promotorelementen als Kernpromotor, proximaler Promotor und distaler Promoter. Der Kernpromotor ist der minimale Teil des Promotors, der zur Initiierung der Transkription erforderlich ist. Es befindet sich am proximalsten zum Startcodon. Tata Box ist eine konservierte Region, die in vielen eukaryotischen Kernförderern vorkommt. Es befindet sich 25 bis 35 Basispaare stromaufwärts der Transkriptionsstartstelle. Der proximale Promotor wird vor dem Kernpromoter mehr vorgelöst. Im Allgemeinen befindet es sich 250 Basispaare stromaufwärts zum Startcodon und enthält primäre regulatorische Elemente. Der distale Promotor befindet sich stromaufwärts zum proximalen Promotor und enthält zusätzliche regulatorische Elemente. Bakterielle Promotoren haben zwei kurze Sequenzelemente in ihren Promotoren. Tataat ist die Konsensussequenz bei -10 des bakteriellen Promotors, während TTGACA die Konsensussequenz bei -35 ist. Sie sind als -10 Element und -35 Element bekannt.

Was sind die Ähnlichkeiten zwischen Primer und Promotor??

  • Primer und Promotor sind zwei Arten von DNA -Sequenzen.
  • Sie bestehen aus Nukleotidsequenzen.
  • Sowohl Primer als auch Promotor sind wichtig für die Genexpression.

Was ist der Unterschied zwischen Primer und Promoter?

Primer ist eine kurze Nukleotidsequenz für die Amplifikation von Ziel -DNA. Im Gegensatz dazu ist der Promotor eine spezifische regulatorische DNA -Sequenz, die stromaufwärts zur Transkriptionsinitiationsstelle eines Gens gefunden wurde. Dies ist also der Schlüsselunterschied zwischen Primer und Promotor. Primer sind ungefähr 20 Basispaare lang, während der Promotor 100 -1000 Basispaare haben kann. Funktionell werden Primer als Startsequenzen für die neue Strangsynthese serviert, während die Promotoren die Gentranskription steuern, indem Bindungsstellen für RNA -Polymerase und andere Transkriptionsfaktoren bereitgestellt werden.

Darüber hinaus ist ein Promotor als die Richtung der Transkription definiert und zeigt den Sinnesstrang eines Gens an. Strukturell ist Primer eine kurze, einsträngige DNA-Sequenz, während der Promotor eine lange doppelsträngige DNA-Sequenz ist.

Das folgende info-grafische Tabuls mehr Vergleiche im Zusammenhang mit dem Unterschied zwischen Primer und Promoter.

Zusammenfassung -Primer vs Promoter

Primer sind kurze Nukleotidsequenzen, die zu den flankierenden Enden des Ziel-DNA. Zwei Arten von Primern werden in PCR verwendet. Sie dienen als Startsequenzen für die Synthese neuer Stränge. Primer sind kommerziell ausgelegt und sind Temperaturstabile -Sequenzen. Andererseits ist der Promotor eine regulatorische Sequenz eines Gens, das sich stromaufwärts bis zur Transkriptionsinitiationsstelle befindet. Promotoren steuern die Transkription von Genen. Sie bieten Bindungsstellen für RNA -Polymerase- und Transkriptionsfaktoren zur Initiierung der Transkription. Dies ist also die Zusammenfassung des Unterschieds zwischen Primer und Promotor.

Referenz:

1. "Addgene: Promotoren". Addgene.Org, 2020, hier erhältlich.
2. "Primer (Molekularbiologie)". En.Wikipedia.Org, 2020, hier erhältlich.

Bild mit freundlicher Genehmigung:

1. "Primer revcompc" von Zephyris - eigener Arbeit (CC BY -SA 3.0) über Commons Wikimedia
2. "Genstruktur Eukaryote 2 Annotated" von Thomas Shafee - Shafee T, Lowe R (2017). "Eukaryotische und prokaryotische Genstruktur". Wikijournal of Medicine 4 (1). Doi: 10.15347/WJM/2017.002. ISSN 20024436 (CC von 4.0) über Commons Wikimedia