Unterschied zwischen shRNA und siRNA

shRNA gegen siRNA

Während des RNA -Interferenzungsprozesses (RNAI) wird die Expression eines Zielgens mit hoher Spezifität und Selektivität niedergeschlagen. RNAi ist ein natürlicher Prozess und beinhaltet kleine störende RNA (siRNA) und kurze Haarnadel-RNA (shRNA) und bi-funktionale shRNA. Gegenwärtig wird RNAi häufig als Instrument für eine personalisierte Krebstherapie verwendet. Die Anwendungen von RNAi werden im Wesentlichen mit den chemisch synthetisierten doppelsträngigen siRNA- und vektorbasierten shRNA-Molekülen erfolgen. Obwohl diese beiden Moleküle ähnliche funktionelle Ergebnisse aufweisen, unterscheiden sie sich in ihrer Struktur; Somit unterscheiden sich auch die molekularen Wirkungsmechanismen, die RNA.

shrna

shRNA ist eine Sequenz von kleinem RNA. Die Expression von shRNA wird durch einen Vektor erreicht, der entweder ein Virus oder ein Bakterium oder durch Abgabe von Plasmiden sein kann. Sie werden im Zellkern synthetisiert und für weitere Prozesse zum Zytoplasma transportiert. Diese Moleküle weisen ähnliche Reifungswege von miRNA auf; Somit hat die Synthese von miRNA den Grundstein für das Verständnis der shRNA -Synthese geliefert. Entweder RNA -Polymerase II oder III können shRNA durch RNA -Polymerase II- oder III -Promotoren transkribieren. Der Vorteil der Verwendung von SHRNAs besteht darin. Der Nachteil ist, dass es einen Ausdrucksvektor benötigt, der einige Sicherheitsprobleme verursachen kann.

siRNA

siRNAs sind doppelt gestrandete RNA. Diese werden zur Genunterdrückung verwendet, indem jedes Gen mit komplementärer Nucleotidsequenz im RNAi -Weg zum Schweigen gebracht wird. Der Gen -Knockdown durch Transfektion von siRNA ist aufgrund der vorübergehenden Wirkung häufig erfolglos; vor allem in schnell teilenden Zellen und die Unterdrückung dauert nicht länger. Um dieses Problem zu überwinden, wird die siRNA durch Einführung einer kurzen Haarnadelstruktur modifiziert. Dieses modifizierte Molekül, das damals als shRNA bekannt ist. shRNA sollte von einem Dicer in siRNA umgewandelt werden, um seine normale Funktion fortzusetzen.

Was ist der Unterschied zwischen shRNA und siRNA?

• Im Gegensatz zur siRNA hat shRNA eine zusätzliche Haarnadelstruktur. shRNA ist eine modifizierte Version von siRNA.

• shRNA benötigt einen Expressionsvektor, während siRNA dies nicht tut.

• SHRNA kann zum langfristigen Knockdown verwendet werden, während siRNA nur zum kurzfristigen Abbau von Genen verwendet werden kann.

• Im Gegensatz zur Genunterdrückung von siRNA ist die Unterdrückung von shRNA langlebig, und wenn sie über einen geeigneten Virusvektor eingeführt wird, kann es dauerhafte Gen -Stummschalt -Effekte erzeugen.

• Dicer ist erforderlich, um die shRNA wieder in siRNA -Molekül umzuwandeln, um ihre normalen Funktionen auszuführen.