Unterschied zwischen der gesamten Genomsequenzierung und der Exomsequenzierung

Der Schlüsselunterschied zwischen der gesamten Genomsequenzierung und der Exomsequenzierung ist das, dass die Ganzes Genomsequenzieren Sequenzen das gesamte Genom eines Organismus, während die Exomsequenzierung nur das Exom oder die proteinkodierenden Gene eines Organismus sequenzieren.

Sequenzierung ist eine Technik, die die genaue Reihenfolge der Nukleotide in einem bestimmten DNA -Molekül bestimmt. Es spiegelt lediglich die richtige Reihenfolge der vier Basen wider; Adenin (A), Guanin (G), Cytosin (C) und Thymin (T) in einem DNA -Fragment. Es gibt mehrere Sequenzierungsmethoden wie Sanger-Sequenzierung, Sequenzierung der nächsten Generation usw. Darüber hinaus können entweder das vollständige Genom eines Organismus (Gesamtgenomsequenzierung) oder nur die proteinkodierenden Gene im Genom (Exomsequenzierung) eine Sequenzierung durchlaufen.

INHALT

1. Überblick und wichtiger Unterschied
2. Was ist die ganze Genomsequenzierung
3. Was ist Exomsequenzierung
4. Ähnlichkeiten zwischen der gesamten Genomsequenzierung und der Exomsequenzierung
5. Seite für Seitenvergleich - Ganzes Genomsequenzierung gegen Exomsequenzierung in tabellarischer Form
6. Zusammenfassung

Was ist die ganze Genomsequenzierung?

Das menschliche Genom enthält fast drei Milliarden Basenpaare DNA. Die gesamte Genomsequenzierung ist eine Methode, die das vollständige Genom eines Organismus sequenziert. In der gesamten Genomsequenzierung liegt die Überlegung auf die gesamte Sammlung von DNA -Molekülen, einschließlich Exomen, Introns, intergenen Räumen usw. Darüber hinaus sind das gesamte Genomsequenzierungssequenzieren nicht nur das Genom, das sich im Kern befindet, sondern auch die mitochondriale DNA.

Abbildung 01: Sequenzierung des gesamten Genoms

Bei der Vorbereitung auf diese Sequenzierung besteht der erste Schritt darin, die gesamte DNA zu extrahieren. Anschließend wird die extrahierte DNA unter Verwendung einer geeigneten Sequenzierungsmethode dem Sequenzierungsverfahren unterzogen. Durch die Analyse der resultierenden Sequenzen, Verwendung eines Bioinformatik -Tools können wir die seltenen Krankheiten, Krebs, Infektionskrankheiten usw. herausfinden, usw.

Was ist Exomsequenzierung?

Exom ist ein Teil des Genoms, das ungefähr 1 enthält.5% des Genoms, und es ist die Sammlung von Exons. Exons sind die Sequenzen, die in mRNA und dann in das endgültige Proteinprodukt transkribieren. Daher sind Exomsequenzierungssequenzierung die gesamten Proteinkodierungssequenzen im Genom. Die Exomsequenzierung zeigt die genetischen Störungen, da die meisten genetischen Störungen aufgrund der Mutationen der proteinkodierenden Gene auftreten. Daher verwenden diagnostische Prozesse genetischer Störungen häufig die Exomsequenzierung als Methode, um die Krankheit zu diagnostizieren. Auch im Vergleich zur Anwendung der gesamten Genomsequenzierung für Gentests braucht die Exomsequenzierung weniger Zeit und ist günstiger.

Abbildung 02: Exomsequenzierung

In der Exomsequenzierung müssen zunächst nur die Protein -Codierungssequenzen aus der Gesamt -DNA ausgewählt werden. Beachten Sie, dass die Menschen etwa 180000 Proteinkodiersequenzen haben. Dann wird das Exom unter Verwendung einer Sequenzierungsmethode mit hohem Durchsatz sequenziert.

Was sind die Ähnlichkeiten zwischen der gesamten Genomsequenzierung und der Exomsequenzierung?

• Ganzes Genomsequenzierung und Exomsequenzierung sind zwei Anwendungen der Sequenzierung.
• Beide Methoden sind nützlich, um die korrekte Reihenfolge der Nukleotidsequenz in beiden Methoden zu bestimmen.
• Auch Bioinformatik hilft bei beiden Techniken, Daten zu analysieren.

Was ist der Unterschied zwischen der gesamten Genomsequenzierung und der Exomsequenzierung?

Ganzes Genomsequenzierungssequenzieren die gesamte DNA des Genoms eines Organismus, während die Exomsequenzierungssequenzen nur die Protein -kodierenden Sequenzen aus dem Genom. Daher ist dies der grundlegende Unterschied zwischen der gesamten Genomsequenzierung und der Exomsequenzierung. Obwohl beide Methoden häufig verwendet werden, um die korrekte Reihenfolge der Nukleotidsequenz zu bestimmen, ist die gesamte Genomsequenzierung kostspielig und zeitaufwändig als die Exomsequenzierung.

Die folgende Infografik tabelt den Unterschied zwischen der gesamten Genomsequenzierung und der Exomsequenzierung auf.

Zusammenfassung -Gesamtgenomsequenzierung gegen Exomsequenzierung

Die Sequenzierung zeigt die genaue Reihenfolge der Basen in einem DNA -Fragment und kann entweder die gesamte Genomsequenzierung oder eine Exomsequenzierung sein. Hier sequenzieren das gesamte Genomsequenzierungssequenz. In Anbetracht ihrer Anwendungen ist die gesamte Genomsequenzierung hilfreich bei der Analyse der genetischen Aberrationen wie Einzelnukleotidvariationen, Deletionen, Einfügungen usw. im ganzen Genom, während die Exomsequenzierung hilfreich ist, um die genetischen Krankheiten nachzuweisen. Daher ist dies der Unterschied zwischen der gesamten Genomsequenzierung und der Exomsequenzierung.

Referenz:

1.„Ganzes Genom vs. Ganzexomsequenzierung vs. Gezielte Sequenzentafeln.”Healio, slack incorporated. Hier verfügbar  
2.„Was sind die gesamte Exomsequenzierung und die gesamte Genomsequenzierung? - Genetik Heimreferenz - nih.”U.S. Nationalbibliothek für Medizin, National Institutes of Health. Hier verfügbar  

Bild mit freundlicher Genehmigung:

1."Ganzes Genom -Schrotflintensequenzierung gegen hierarchische Schrotflintensequenzierung" von Commins, J., Toft, c., Tarife, m. A. - „Computerbiologische Methoden und ihre Anwendung auf die vergleichende Genomik endozellulärer symbiotischer Bakterien von Insekten.”(CC BY-SA 2.5) über Commons Wikimedia  
2."Exome Sequencing Workflow 1a" von Sarahkusala - eigene Arbeit (CC von 3).0) über Commons Wikimedia