Was ist der Unterschied zwischen crRNA tracrrna und gna

Der Schlüsselunterschied Zwischen crRNA -TracRRNA und gnNA ist crRNA eine der beiden RNA -RNA -CRISPR -Arten, die zur Ziel -DNA -Sequenz komplementär ist GRNA ist eine der beiden Hauptkomponenten des CRISPR-Cas9-Systems von Bakterien und Archaea, die die Ziel-DNA erkannt und CAS-Proteine ​​dazu führen, Doppelstrangbrüche in der Ziel-DNA zu machen.

CRISPR steht für Clustered regelmäßige durchsetzt kurze palindromische Wiederholungen. Es ist eines der Immunsysteme in Bakterien und Archaea. Bakterien und Archaea verwenden dieses System, um sich vor viralen Krankheitserregern zu schützen. Es ist einer der erstaunlichsten Mechanismen, die eine erfolgreiche genetische Modifikation beinhalten. Dieser Mechanismus (CRISPR-Cas9) wird als neuartiges Gen-Bearbeitungswerkzeug in der Biotechnologie verwendet. Es hat neue Fortschritte in die Biotechnologie gebracht, insbesondere im Bereich der Gentechnik.

Es gibt zwei Hauptkomponenten des CRISPR-Cas9-Systems. Sie sind Leitfaden-RNA (GRNA) und CRISPR-assoziierte (CAS) Nukleasen. Führungs -RNA ist eine spezifische RNA -Sequenz, die CAS -Proteine ​​leitet, um Ziel -DNA zu spalten. Leitfaden -RNA besteht aus zwei Arten von RNA. Sie sind CRISPR -RNA (crRNA) und tracrrna. CRISPR-assoziierte (CAS) Nukleasen sind nicht spezifische Endonukleasen, die doppelte Strangbrüche in der Ziel-DNA machen. Durch die Herstellung von Doppelstrangbrüchen in Ziel-DNA, Bakterien und Archaea lenken ihre endogenen Reparaturmechanismen, um die virale DNA zu inaktivieren.

INHALT

1. Überblick und wichtiger Unterschied
2. Was ist CrRNA  
3. Was ist tracrrna 
4. Was ist grna
5. Ähnlichkeiten - crRNA tracrrna und gna
6. crRNA gegen tracrrna vs grna in tabellarischer Form
7. Zusammenfassung - crRNA gegen tracrrna vs grna

Was ist CrRNA?

CrRNA oder CRISPR -RNA ist eine der beiden Arten von Führungs -RNA. Strukturell handelt es sich um eine 17-20 Nucleotidsequenz. Das wertvollste Merkmal von crRNA ist, dass es zur Ziel -DNA ergänzt wird. Daher übereinstimmt crRNA mit der viralen DNA -Sequenz. Die Spezifität des CRISPR-Cas 9-Systems hängt von crRNA ab. In Bakterien existiert CrRNA mit der tracrRNA -Sequenz, der zweiten Art von CRISPR -RNA. Die CrRNA-Produktion wird durch die Wiederbelichtung von Bakterien zu einem Virus ausgelöst. Bei der Exposition findet die Transkription des Gens, das für crRNA kodiert, statt. Dann beginnt der Abwehrmechanismus gegen das Virus.

Abbildung 01: CRISPR-Cas9-System

Was ist tracrrna?

Transaktivierende crRNA oder tracrRNA ist der zweite Teil von Guiderna oder CRISPR-RNA. Es wird als Tracer -RNA ausgesprochen.  TracrRNA dient als Bindungsgerüst für das Endonuklease CAS 9 -Protein. Mit anderen Worten, TracRRNA arbeitet als Griff, um Cas9 in Richtung der Ziel -DNA zu führen. Strukturell hat TracRRNA 42 Nukleotide. Es existiert kombiniert mit crRNA.

Was ist grna?

Leitfaden-RNA oder GRNA ist eine der beiden Hauptkomponenten des CRISPR-Cas9-Immunsystems. Es ist eine spezifische RNA -Sequenz, die aus zwei Elementen besteht: crRNA und tracrRNA. GRNA erkennt die Ziel-DNA und weist CAS-Proteine ​​an, Doppelstrangbrüche in der Ziel-DNA zu machen. Um dies zu tun, besteht crRNA aus einer komplementären Sequenz von Ziel -DNA, während tracrRNA -Führung CAS -Proteine ​​als Griff führt.

Abbildung 02: GRNA

Das Entwerfen der richtigen GRNA ist ein kritischer Schritt im CRISPR-Cas9-Gen-Bearbeitungswerkzeug. Daher hängen der Erfolg und die Bearbeitungseffizienz des CRISPR -Systems von der richtigen Abfolge von GRNA ab. GRNA kann in Zellen aus einem transfizierten Plasmid exprimiert werden. Wenn klonierte Plasmide in Zellen eingeführt werden, erzeugen Wirtszellen GRNA. Die am häufigsten erzeugte GRNA umfasst 100 Basispaare.

Was sind die Ähnlichkeiten zwischen crRNA tracrrna und gnna?

• crRNA, tracrrna und gna sind RNA -Sequenzen in Bakterien und Archaea.
• Sie alle gehören zum CRISPR -System.
• GRNA wird aus crRNA und tracrrna hergestellt.
• Sie sind daran beteiligt, die Bakteriophagen -DNA zu erkennen und Endonukleasen in Richtung Ziel -DNA zu leiten.
• Daher sind alle drei Arten von RNA an der Regie der Cas9-Nuklease beteiligt, um doppelte Strangbrüche in eindringlichen fremden genetischen Materialien durchzuführen.
• Der Erfolg des CRISPR -Experiments hängt von allen drei Arten von RNA ab.

Was ist der Unterschied zwischen crRNA tracrrna und gna?

crRNA ist ein Teil von GRNA von CRISPR, der zu der Ziel -DNA komplementär ist, während tracrRNA der zweite Teil der GRNA ist, das als Bindungsgerüst für die CAS -Nuklease dient. GRNA ist die Kombination von crRNA und tracrRNA und eine der beiden Komponenten des CRISPR-Cas9-Systems, das die Ziel-DNA erkennt und Nukleasen dazu führt, Doppelstrangbrüche in der Ziel-DNA zu machen. Dies ist also der Schlüsselunterschied zwischen crRNA -tracrrna und gnna.

Die folgende Tabelle fasst den Unterschied zwischen crRNA -tracrrna und gnNA zusammen.

Zusammenfassung - crRNA gegen tracrrna vs grna

Das CRISPR-Cas9-System ist ein Immunsystem von Bakterien und Archaea. Dieses System wird als Gen-Bearbeitungswerkzeug in der Biotechnologie verwendet. CRISPR besteht aus zwei Arten von RNA, nämlich CRISPR -RNA (crRNA) und transaktivierenden CRISPR -RNA (tracrRNA). Sie sind gemeinsam als Guiderna oder GRNA bekannt. Diese RNA erkennt Zielsequenzen von eindringenden Krankheitserregern und führt Endonukleasen, um Doppelstrangbrüche in der Ziel-DNA zu machen. Sobald Doppelstrangbrüche im fremden genetischen Material durchgeführt wurden, inaktiv. Daher fasst dies den Unterschied zwischen crRNA -tracrRNA und grNA zusammen.

Referenz:

1. “Leitfaden -RNA.”Ein Überblick | Sciencedirect -Themen.
2. Karvelis, Tautvydas et al. „CrRNA und tracrRNA führen Cas9-vermittelte DNA-Interferenz in Streptococcus thermophilus.”RNA Biology, Landes Bioscience, Mai 2013.

Bild mit freundlicher Genehmigung:

1. "CRISPR-CAS9-Aktionsmodus" von Viktoriaanselm-eigene Arbeit (CC BY-SA 4.0) über Commons Wikimedia
2. "GRNA-Cas9" von Marius Walter-Datei: GRNA-Cas9.PNG (CC BY-SA 4.0) über Commons Wikimedia