Was ist der Unterschied zwischen Polysomenprofilerstellung und Ribosomenprofiling

Der Schlüsselunterschied zwischen Polysomenprofilerstellung und Ribosomenprofilerstellung ist, dass das Polysomenprofiling das Ribosomenverhalten analysiert, die sowohl Ribosomen als auch mRNA (Polysom) während der Translation unter Verwendung von Ribosomenprofilen analysiert.

Translation ist die zweite Phase der Proteinsynthese, die die Informationen in der mRNA in eine Aminosäuresequenz umwandelt. Translatomics ist eine Studie von ORFs (Open Leserahmen), die aktiv in einer Zelle eines Organismus übersetzt werden. Polysom- und Ribosomenprofilerstellungstechniken sind zwei Arten von Techniken im Bereich der molekularen Biologie, um verschiedene Parameter im Zusammenhang mit der Analyse des Translatoms zu bewerten und abzuleiten.

INHALT

1. Überblick und wichtiger Unterschied
2. Was ist Polysome Profiling
3. Was ist Ribosomenprofilerstellung
4. Ähnlichkeiten -Polysomenprofilerstellung und Ribosomenprofilerstellung
5. Polysomenprofilerstellung gegen Ribosomenprofiling in tabellarischer Form
6. Zusammenfassung -Polysomenprofilerstellung gegen Ribosomenprofilerstellung

Was ist Polysome Profiling?

Polysomenprofiling ist eine Technik, die den Status der Translation einer spezifischen mRNA durch Analyse des Verhaltens von Ribosom und mRNA (Polysom) färbt. Mit anderen Worten, diese Technik liefert Daten und Schlussfolgerungen zur Assoziation von mRNAs mit Ribosomen. Das Polysom ​​bezieht sich auf die Gruppe von Ribosomen, die an eine mRNA gebunden sind, die während der Verlängerungsphase der Translation vorhanden ist.

Abbildung 01: Polysome Profiling

Das Polysomenprofil erfordern das Zelllysat, das dann zentrifugiert wird. Die zentrifugierte Probe wird dann basierend auf ihren Dichten getrennt, um die kleinen und großen Untereinheiten der Ribosomen und die entsprechende mRNA zu charakterisieren, die an der Bildung des Polysoms beteiligt sind. Darüber hinaus beinhaltet der Prozess auch die Messung der optischen Dichte. Experten sind erforderlich, um Polysomenprofile durchzuführen.

Die Polysomenprofilerstellungstechnik ist ein wichtiges Werkzeug für viele Anwendungen. Wissenschaftler verwenden diese Technik, um den Übersetzungsgrad in Zellen zu untersuchen. Insbesondere ist es ein Instrument, um genaue Informationen über die Untersuchung einzelner Proteine ​​und deren spezifische mRNAs bereitzustellen. Im Kontext der Untersuchung des Übersetzungsgrades einer bestimmten mRNA ist die Polysomenprofilerstellungstechnik von entscheidender Bedeutung. Hier können die 3 'und 5' Sequenzen einer mRNA unter Bezugnahme auf ihre Auswirkungen auf die Menge der produzierten mRNA und den Übersetzungsniveau untersucht werden.

Was ist Ribosomenprofilerstellung?

Ribosomenprofilerstellung ist eine Technik, die das Verhalten des Ribosoms in Bezug auf seine mRNA während der Translation analysiert. Diese Technik wurde von Joan Steitz und Marilyn Kozak gefunden und entwickelt. Später wurde diese Technologie von zwei Wissenschaftlern, Nicholas und Jonathan, in Kombination mit Sequenzierung der nächsten Generation weiterentwickelt, was zur Entwicklung verschiedener verwandter Techniken wie der Übersetzung der Methodik der Ribosomen-Affinitätsreinigung (Trap) führte.

Abbildung 02: Ribosomensequenzierung

Das Verfahren des Ribosomenprofils beinhaltet die Isolierung der mRNA, das Entfernen der RNA, die nicht an Ribosomen gebunden ist, und die Trennung der an Ribosomen gebundenen mRNA. Nach diesem Verfahren wird das mRNA -Isolat umgekehrt transkribiert und die cDNA -Synthese erfolgt. Schließlich können Sequenzdaten mit dem Translationsprofil ausgerichtet werden, um die Eigenschaften des Ribosomenverhaltens in Bezug auf die mRNA abzuleiten.

Das Ribosomenprofiling hilft vielen Forschern, den Standort von Startübersetzungsstellen, das Komplement von übersetzten offenen Lesebrahmen (ORFs) in einer Zelle oder einem Gewebe, der Verteilung der Ribosomen auf mRNA und der Rate der Übersetzungsribosomen zu identifizieren und zu schließen. Ribosomenprofilerstellung ist auch als Ribosomen -Footprint oder Riboseq bekannt.

Was sind die Ähnlichkeiten zwischen Polysomenprofilerstellung und Ribosomenprofilerstellung?

• Polysomen- und Ribosomenprofilerstellung sind molekulare biologische Techniken, die in der Forschung wichtig sind.
• Sie liefern Informationen zum Übersetzungsprozess.
• Beide Profilerstellungsprozesse liefern Daten durch Analyse des Translatoms.
• Professionelle Experten werden benötigt, um beide Techniken für genaue Ergebnisse durchzuführen.
• Bioinformatik -Tools spielen eine wichtige Rolle bei beiden Techniken.

Was ist der Unterschied zwischen Polysomenprofilerstellung und Ribosomenprofiling?

Das Polysom ​​-Profiling analysiert das Ribosomenverhalten sowohl Ribosomen als auch mRNA (Polysom) während der Translation, während Ribosomenprofilering das Ribosomenverhalten nur unter Verwendung der mRNA -Sequenz während der Translation analysiert. Dies ist daher der wichtigste Unterschied zwischen Polysomenprofilerstellung und Ribosomenprofiling. Darüber hinaus beinhaltet Polysomenprofile Techniken wie Dichtegradientenzentrifugation und optische Dichtemessungen, während die Ribosomenprofilerstellung mRNA -Extraktions- und Sequenzierungstechniken beinhaltet. Auch Ribosomenprofilerstellung ist genauer als Polysomenprofilering.

Die folgende Infografik zeigt die Unterschiede zwischen Polysom- und Ribosomenprofilerstellung in tabellarischer Form für Seite für Seitenvergleich.

Zusammenfassung -Polysomenprofilerstellung gegen Ribosomenprofilerstellung

Translation ist die zweite Phase der Proteinsynthese, die die Umwandlung der Informationen über die mRNA -Sequenz in eine Aminosäuresequenz umfasst. Dieser Prozess erfordert eine mRNA -Vorlage, Ribosomen, Aminosäuren, tRNA und andere Faktoren. Polysom- und Ribosomenprofilering sind zwei molekulare Techniken. Das Polysom ​​-Profiling analysiert das Ribosomenverhalten sowohl Ribosomen als auch mRNA (Polysom) während der Translation, während Ribosomenprofilering das Ribosomenverhalten nur unter Verwendung der mRNA -Sequenz während der Translation analysiert. Die Polysomenprofilerstellung beinhaltet Techniken wie Dichtegradientenzentrifugation und optische Dichtemessungen. Die Ribosomenprofilerstellung beinhaltet Techniken wie die mRNA -Extraktion, die cDNA -Synthese und die Sequenzierung. Dies fasst den Unterschied zwischen Polysomenprofilerstellung und Ribosomenprofilerstellung zusammen.

Referenz:

1. Chassé, Héloïse et al. „Analyse der Translation unter Verwendung von Polysomenprofile.”Nukleinsäurenforschung, 2016.
2. Jin, Hyun Yong und Changchun Xiao. „Eine integrierte Polysomenprofilerstellung und Ribosomenprofiling -Methode zur Untersuchung in vivo transatome.Methoden in Molekularbiologie, 2017, pp. 1-18., https: // doi.org/10.1007/978-1-4939-7514-3_1.

Bild mit freundlicher Genehmigung:

1. „Wichtige Translatomics -Techniken“ von Polyribosom - eigene Arbeit (CC BY -SA 4.0) über Commons Wikimedia
2. "RibosomeProfilejpg" von Dennispietras - eigene Arbeit (CC BY -SA 4.0) über Commons Wikimedia