Was ist der Unterschied zwischen Shine Dalgarno und Kozak -Sequenz

Was ist der Unterschied zwischen Shine Dalgarno und Kozak -Sequenz

Der Schlüsselunterschied Zwischen Shine Dalgarno und Kozak Sequenz ist, dass Shine Dalgarno -Sequenz eine ribosomale Bindungsstelle in der Bakterien- und Archaeal -Messenger -RNA ist, während die Kozak -Sequenz eine Protein -Translationsinitiationsstelle in den meisten eukaryotischen Messenger -RNAs ist.

Shine Dalgarno und Kozak Sequenz sind zwei Konsensussequenzen, die für die Übersetzungsinitiation sehr wichtig sind. In der molekularen Biologie ist Translation der Prozess, durch den Ribosomen im Zytoplasma nach dem Transkriptionsprozess Proteine ​​synthetisieren. In der Translation ist eine mRNA (Messenger -RNA) in einem Ribosom dekodiert, um eine spezifische Aminosäurkette außerhalb des Kerns zu produzieren. Typischerweise induziert ein Ribosom den Dekodierungsprozess durch Erleichterung der Bindung komplementärer tRNA -Anticodon -Sequenzen an mRNA -Codons. Die Übersetzung erfolgt in drei Phasen: Initiierung, Dehnung und Beendigung.

INHALT

1. Überblick und wichtiger Unterschied
2. Was ist Shine Dalgarno Sequenz
3. Was ist die Kozak -Sequenz
4. Ähnlichkeiten - glänzen Dalgarno und Kozak -Sequenz
5. Shine Dalgarno gegen Kozak -Sequenz in tabellarischer Form
6. Zusammenfassung -Shine Dalgarno gegen Kozak -Sequenz

Was ist Shine Dalgarno Sequenz?

Shine Dalgarno -Sequenz ist eine ribosomale Bindungsstelle in bakterieller und archaaler Messenger -RNA. Es befindet sich im Allgemeinen rund 8 Basen stromaufwärts des Startcodons AUG. Diese RNA -Sequenz hilft bei der Rekrutierung von Ribosomen in die Messenger -RNA, indem das Ribosom mit einem mRNA -Startcodon ausgerichtet ist. Somit initiiert es die Proteinsynthese. Einmal nach der Rekrutierung kann die TRNA Aminosäuren nacheinander hinzufügen, wie sie durch die mRNA -Codons diktiert werden. Diese besondere Sequenz ist in Bakterien häufig, aber in Archaea seltener. Darüber hinaus ist es auch in Chloroplasten- und mitochondrialen Transkripten vorhanden. SHINE DALGARNO -Sequenz wurde erstmals von australischen Wissenschaftlern John Shine und Lynn Dalgarno vorgeschlagen. Die sechs Basiskonsenssequenz ist Aggagg. Zum Beispiel in Escherichia coli Die Sequenz ist Aggaggu.

Abbildung 01: Shine Dalgarno -Sequenz

Die Auswahl der Initiationsstelle (Aug) hängt von der Wechselwirkung zwischen der 30S -Untereinheit der Ribosom- und der mRNA -Vorlage ab. Die pyrimidinreiche Region in der 16SRRNA-Komponente der 30S-Untereinheit bindet an die purinreiche Region, die als Shine Dalgarno-Sequenz stromaufwärts des Aug-Initiations-Codons in mRNA bekannt ist. Während der Bildung des Initiationskomplexes koppeln diese komplementären Nukleotidsequenzen zu einer doppelsträngigen RNA-Struktur. Dies erleichtert die Bindung von mRNA an ein Ribosom so, dass das Initiationscodon an der P -Ribosomstelle platziert wird.

Was ist die Kozak -Sequenz?

Die Kozak -Sequenz ist eine Protein -Translationsinitiationsstelle in den meisten eukaryotischen mRNA. Diese Sequenz wird auch als Kozak -Konsensussequenz bezeichnet. Die Kozak -Sequenz ist die optimale Sequenz für die Initiierung der Translation in Eukaryoten. Diese Sequenz ist ein integraler Aspekt der Proteinregulation. Es ist auch sehr wichtig für die gesamte Zellgesundheit. Es hilft, die Proteinübersetzung aus genetischen Nachrichten zu korrigieren, indem Ribosomen -Assemblierung und Übersetzungsinitiation vermittelt werden.

Abbildung 02: Kozak -Sequenz

Diese Sequenz wurde nach dem Wissenschaftler benannt, der sie entdeckte, Marilyn Kozak. Sie entdeckte es durch eine detaillierte Analyse der genomischen DNA -Sequenzen. Die Kozak-Sequenz ist 5 '(GCC) GCCRCCAGG-3'. Die Buchstaben in den oberen Fällen geben konservierte Basen an, während die unteren Niederlagen häufige variable Basen anzeigen. R zeigt einen Purin (Adenin oder Guanin) an, der immer an diesem Ort positioniert ist.

Was sind die Ähnlichkeiten zwischen Shine Dalgarno und Kozak Sequenz?

  • Shine Dalgarno und Kozak -Sequenz sind zwei Konsensussequenzen, die für die Übersetzungsinitiierung sehr wichtig sind.
  • Beide sind RNA -Sequenzen.
  • Die kleinere Untereinheit des Ribosoms bindet an beide Sequenzen.
  • Beide Sequenzen vermitteln die richtige Ribosomenanordnung und die Übersetzungsinitiierung.
  • Sie sind integrale Aspekte der Proteinregulation und der gesamten zellulären Gesundheit.

Was ist der Unterschied zwischen Shine Dalgarno und Kozak -Sequenz?

Shine Dalgarno -Sequenz ist eine ribosomale Bindungsstelle, die in Bakterien- und Archaeal -Messenger -RNA gefunden wird, während die Kozak -Sequenz eine Protein -Initiationsstelle für die Protein -Translation in den meisten eukaryotischen Messenger -RNA ist. Dies ist also der Hauptunterschied zwischen Shine Dalgarno und Kozak -Sequenz. Darüber hinaus ist die Shine Dalgarno-Sequenz 5'AGGAGU3 ', während die Kozak-Sequenz 5' (GCC) GCCRCCAIGG-3 'ist.

Die folgende Infografik listet die Unterschiede zwischen Shine Dalgarno und Kozak -Sequenz in tabellarischer Form für Seite für Seitenvergleich auf.

Zusammenfassung -Shine Dalgarno gegen Kozak -Sequenz

Shine Dalgarno- und Kozak -Sequenzen sind zwei Konsensus -RNA. Shine Dalgarno -Sequenz ist eine ribosomale Bindungsstelle in bakterieller und archaaler Messenger -RNA, während die Kozak -Sequenz eine Protein -Translationsinitiationsstelle in den meisten eukaryotischen Messenger -RNA ist. Dies fasst den Unterschied zwischen Shine Dalgarno und Kozak -Sequenz zusammen.

Referenz:

1. „Shine-Dalgarno-Sequenz.”Ein Überblick | Sciencedirect -Themen.
2. „Kozak -Konsensequenz.”Ein Überblick | Sciencedirect -Themen.

Bild mit freundlicher Genehmigung:

1. "Shine-Dalgarno-Sequenz" von Shakiestone. Verssión en español de alejandro porto - Datei: Shine -Dalgarno -Sequenz.PNG (CC BY-SA 3.0) über Commons Wikimedia
2. "Übersetzungsregulation von 5" Transkriptionsleiter cis-Elements "von APFEL412-eigene Arbeit (CC BY-SA 4.0) über Commons Wikimedia