Chromosomen -Wander- und Chromosomen -Springen sind zwei technische Werkzeuge,. Chromosomenwander. Chromosomales Jumping ist eine spezielle Version des chromosomalen Gehens, das die Haltepunkte des chromosomalen Gehens überwindet. Chromosomales Walk kann nur kleine Chromosomenlängen sequenz und kartieren, während das chromosomale Sprung die Sequenzierung großer Teile von Chromosomen ermöglicht. Dies ist der Hauptunterschied zwischen chromosomalem Gehen und chromosomalem Sprung.
INHALT
1. Überblick und wichtiger Unterschied
2. Was geht Chromosomen wandelt?
3. Was ist Chromosomenspringen
4. Nebeneinander Vergleich - Chromosomen Walking gegen Springen
5. Zusammenfassung
Chromosomenwander. Beim Chromosomenlauf wird ein Teil eines bekannten Gens als Sonde verwendet und fortgesetzt, wobei die gesamte Länge des Chromosoms zu kartieren oder sequenziert werden kann. Dies geht vom Marker zur Ziellänge aus. Beim Chromosomenlauf werden die Enden jeder überlappenden Fragmente zur Hybridisierung verwendet, um die nächste Sequenz zu identifizieren.
Die Sonden werden aus den Endstücken der geklonten DNA hergestellt und sie werden unterkloniert. Dann werden sie verwendet, um das nächste überlappende Fragment zu finden. Alle diese überlappenden Sequenzen werden verwendet, um die genetische Karte des Chromosoms zu konstruieren und die Zielgene zu lokalisieren. Es handelt sich um eine Methode zur Analyse langer DNA -Strecken durch kleine überlappende Fragmente aus der rekonstruierten Genombibliothek.
Isolierung eines DNA -Fragments, das das bekannte Gen oder Marker in der Nähe des Zielgens enthält
Herstellung der Einschränkungskarte des Fragments 2 und der Unterklammerung des Endbereichs des Fragments 2, um als Sonde für die Identifizierung des nächsten überlappenden Fragments zu dienen
Die obigen Schritte sollten bis zum Zielgen oder bis zu 3 'Ende der Gesamtlänge der Sequenz fortgesetzt werden.
Abbildung 01: Chromosomen -Wandertechnik
Chromosomenlauf ist ein wichtiger Aspekt des Zytogenetikums, um SNPs vieler Organismen zu finden und die gentechnisch übertragenen Krankheiten zu analysieren und Mutationen relevanter Gene zu finden.
Chromosomensprung ist eine Technik, die in der molekularen Biologie zur physikalischen Kartierung von Genomen der Organismen verwendet wird. Diese Technik wurde eingeführt, um eine Barriere des chromosomalen Gehens zu überwinden, das beim Auffinden der sich wiederholenden DNA -Regionen während des Klonierungsprozesses entstanden ist. Daher kann die Chromosomen -Jumping -Technik als eine spezielle Version des Chromosomen -Gehens betrachtet werden. Es ist eine schnelle Methode im Vergleich zu chromosomalem Gehen und ermöglicht es, die sich wiederholenden DNA. Chromosomalessprung verengt die Lücke zwischen dem Zielgen und den verfügbaren bekannten Markern für die Genom Mapping.
Das Chromosomen -Sprungwerkzeug beginnt mit dem Schneiden einer bestimmten DNA mit speziellen Restriktionsendonukleasen und Ligation der Fragmente in kreisförmige Schleifen. Dann wird ein Primer aus einer bekannten Sequenz verwendet, um die kreisförmigen Loops zu sequenzieren. Dieser Primer ermöglicht es alternatives Springen und Sequenzieren. Daher kann es die sich wiederholenden DNA -Sequenzen umgehen und schnell durch das Chromosom gehen, um das Zielgen zu suchen.
Die Entdeckung des Gens codiert für die Mukoviszidose. Kombiniert können chromosomales Springen und Gehen den Genom -Mapping -Prozess verbessern.
Abbildung 02: Chromosomenspringen
Chromosomen Walking gegen Springen | |
Chromosom ist ein Werkzeug, das in der molekularen Biologie für die Genomkartierung und das Lokalisieren spezifischer Gene verwendet wird. | Chromosomenspringen ist ein Werkzeug, das zur physikalischen Zuordnung von Genomen und zur schnellen Erkenntnis von Zielgenen in den Chromosomen verwendet wird. |
Vergleichende Längen der Sequenzierung | |
Nur kleine Fragmente können durch chromosomales Gehen kloniert werden. | Größere Längen der Chromosomen können durch das chromosomale Sprung abgebildet werden. |
Sich wiederholende DNA in Chromosomen klonieren | |
Die Chromosomen -Wanderungstechnik hat Schwierigkeiten beim Gehen durch die sich wiederholenden DNA -Sequenzen in Chromosomen. | Es ermöglicht die Umgehung der sich wiederholenden DNA -Sequenzen. Daher gibt es keine Schwierigkeiten, sie während der Sequenzierung zu finden. |
Faktoren, die die Prozesse beeinflussen | |
Der Erfolg des Prozesses hängt von der Größe des Genoms und der Entfernung ab, die von einer bekannten genomischen Position in Richtung des gewünschten Gens „gewandert“ werden muss. | Der Erfolg hängt nicht von der Größe des Genoms des Abstands vom Marker zu Ziel ab. |
Auswirkungen von nicht ungekochten DNA | |
Chromosomales Gehen kann durch nicht gelegte DNA -Fragmente gestoppt werden. | Die niedrigste Note Piccolos kann spielen. D ist D4. |
Notwendigkeit einer bekannten Sequenz | |
Der Prozess beginnt mit einem bekannten Gen in der Nähe des Ziels. | Der Prozess erfordert ein bekanntes Fragment für die Primerdesign. |
Chromosomales Gehen wird häufig angewendet, wenn bekannt ist, dass sich ein bestimmtes Gen in der Nähe eines zuvor klonierten Gens in einem Chromosom befindet, und es ist möglich, es mit wiederholter Isolierung benachbarter genomischer Klone aus der Genombibliothek zu identifizieren. Wenn sich jedoch während der chromosomalen Wandertechnik wiederholende DNA -Regionen ergeben, kann der Prozess nicht fortgesetzt werden. Daher bricht die Technik von diesem Punkt an. Chromosomensprung ist ein molekulares biologisches Instrument, das diese Einschränkung für die Kartierung von Genomen überwindet. Es umgeht diese sich wiederholenden DNA -Regionen, die schwer zu klonen sind und bei der physikalischen Kartierung von Genomen hilft. Dies ist der Hauptunterschied zwischen Chromosomen -Gehen und Springen.
Verweise:
1. Nakaseko, Yukinobu, Yasuhisa Adachi, Shin-Osi Funahashi, Osami Niwa und Mitsuhiro Yanagida. „Chromosomenlauf zeigt eine hoch homologe sich wiederholende Sequenz, die in allen Centromerregionen der Spalthefe vorhanden ist.”Das Embo -Journal. U.S. Nationalbibliothek für Medizin, Mai 1986. Netz. 22. März. 2017
2. Taheri, Ali. „Chromosom wandert und springt.Fortschritte in der Gentechnik. Omics International, 30. Oktober. 2013. Netz. 22. März. 2017