Unterschied zwischen Klon durch Klonsequenzierung und Schrotflintensequenzierung

Der Schlüsselunterschied Zwischen Klon durch Klonsequenzierung und Schrotflintensequenzierung liegt in ihrer Verhaltensmethode. Klon nach Klonsequenzierungsmethode beinhaltet die Zuordnung von Chromosomen und das Klonieren vor der Sequenzierung, während Klon durch Schrotflintensequenzierung sowohl die Chromosomen -Mapping- als auch die Klonierungsschritte während der Sequenzierung auslässt.

Klon durch Klonsequenzierung und Klon durch Schrotflintensequenzierung sind zwei Methoden der modernen Genomsequenzierung. Klon durch Klonsequenzierung ist eine zuverlässigere Methode der Sequenzierung. Die Methode des Klons durch Schrotflintensequenzierung ist jedoch schneller und billiger. Der Artikel konzentriert sich auf den subtilen Unterschied zwischen Klon durch Klonsequenzierung und Schrotflintensequenzierung.

INHALT

1. Überblick und wichtiger Unterschied
2. Was ist Klon durch Klonsequenzierung 
3. Was ist Klon von Schrotflintensequenzierung
4. Ähnlichkeiten zwischen Klon durch Klonsequenzierung und Schrotflintensequenzierung
5. Seite für Seitenvergleich - Klon durch Klonsequenzierung gegen Schrotflintensequenzierung in tabellarischer Form
6. Zusammenfassung

Was ist Klon durch Klonsequenzierung?

Klon durch Klonsequenzierung ist eine Methode zur Genomsequenzierung. Es erfordert die Zuordnung jedes Chromosoms vor der DNA -Spaltung. Nach der Abbildung sollte die DNA in Fragmente von 150 Kilobasen lang unterteilt werden. Diese Fragmente sind dann zur Sequenzierung bereit. Der nächste Schritt ist die Insertion von DNA -Fragmenten in bakterielle künstliche Chromosomen (BACs) und dann in Bakterienzellen. Da sich die Fragmente jetzt in den Bakterienzellen befinden, trennt sich jedes Mal, wenn sich die Bakterien dividieren. Dann ist die einzelne bakterielle Klon -DNA in 500 Basenpaare langfragte Fragmente fragmentiert. Sie sind kleiner und überlappende Fragmente. Als nächstes findet die Sequenzierung mit der Einführung dieser Fragmente in einen Vektor mit einer bekannten DNA -Sequenz statt. Ab der bekannten Sequenz des Vektors geht die Sequenzierung bis zur unbekannten Sequenz weiter.

Nach Abschluss der Sequenzierung müssen die Bereiche überlappender Sequenzen identifiziert werden. Danach findet eine Verbindungsverbindung der Fragmente statt, um die größeren Fragmente zu bilden, die ursprünglich in BACs vorgestellt wurden. Als nächstes findet der Zusammenbau größerer Fragmente in das Chromosom nach der Genomkarte statt.

Abbildung 01: Klon durch Klonsequenzierung

Der signifikante Vorteil des Klons durch Klonsequenzierung besteht darin, dass die vorbereitete Genomkarte zu einer zuverlässigen Ansammlung größerer Fragmente hilft. Der Nachteil dieser Sequenzierungsmethode ist jedoch, dass es zeitaufwändig ist, Genomkarten zu erzeugen und Klone zu machen. Dies war jedoch die Methode, die während des „Human -Genom -Projekts“ bevorzugt wurde.

Was ist Klon von Schrotflintensequenzierung?

Klon durch Schrotflintensequenzierung ist eine Sequenzierungsmethode, die DNA -Sequenzen zufällig in viele kleine Fragmente aufteilt und die Sequenz durch Beobachten der überlappenden Regionen wieder zusammenstellt. Größere Säugetiergenome sind schwer zu klonieren und montieren sich zusammen. Es liegt an ihrer strukturellen Komplexität und Größe. Obwohl das Klon -By -Klon -Sequenzierungsmethode zuverlässig ist, dauert es lange, bis die Genome komplexer Organismen die Sequenz von Sequenz. Daher ist Clon per Shotgun -Sequenzierung zu einer zuverlässigen billigeren Sequenzierungsmethode geworden, die schneller durchgeführt werden kann. Daher verlassen sich moderne Wissenschaftler auf diese Sequenzierungsmethode, um komplexe Genome anzugehen.

Abbildung 02: Klon durch Schrotflintensequenzierung

Während der Schrotflintensequenzierungsmethode während des Klons durch Klon -Methode finden keine konventionellen Genom -Mapping- und Klonierungsschritte statt. Zunächst ist das gesamte Genom in unterschiedliche Größen von 20 Kilobasen bis 300 Kilobasen fragmentiert. Als nächstes findet die Sequenzierung statt. Mithilfe einer ausgefeilten Computersoftware müssen dann die Fragmente zusammengebaut werden, indem Sie sich die überlappenden Regionen ansehen.

Klon durch Schrotflintensequenzierung hilft, die Genauigkeit bestehender Genomsequenzen zu verbessern. Der Hauptvorteil dieser Methode besteht darin, dass sie viel schneller und billiger als Klon nach Klonsequenzierungsmethode ist. Dieser Prozess beinhaltet jedoch nicht die Verwendung einer genetischen Karte. Daher treten Fehler während der Assemblage wahrscheinlicher auf. Somit ist dies ein großer Nachteil im Klon durch Schrotflintensequenzierungsmethode.

Was sind die Ähnlichkeiten zwischen Klon durch Klonsequenzierung und Schrotflintensequenzierung?

• Beide Klon durch Klonsequenzierung und Schrotflintensequenzierung sind zwei Methoden der Genomsequenzierung.
• Bei beiden Sequenzierungstechniken erfolgt die Zusammenstellung von kaputten Fragmenten durch Identifizierung überlappter Regionen.
• Außerdem ist die Aufteilung der DNA in kleinere Fragmente sowohl für die Klon- als auch für die Schrotflintensequenzierung erforderlich.

Was ist der Unterschied zwischen Klon durch Klonsequenzierung und Schrotflintensequenzierung?

Klon nach Klonsequenzierungstechnik umfasst zwei Hauptschritte: die Zuordnung von Chromosomen und Klonen. Im Gegensatz dazu folgt Clone durch Schrotflintensequenzierung diesen beiden Schritten nicht; Es zerlegt zufällig DNA. Daher ist dies der Schlüsselunterschied zwischen Klon durch Klonsequenzierung und Schrotflintensequenzierung. Aufgrund dieses Faktors ist Clon per Klonsequenz.

Fehler während der Montage treten jedoch seltener während des Klons durch Klonsequenzierung auf. Daher hat es eine hohe Zuverlässigkeit. Klon durch Schrotflintensequenzierung ist jedoch vergleichsweise eine weniger zuverlässige Technik. Dies ist also auch ein signifikanter Unterschied zwischen Klon durch Klonsequenzierung und Schrotflintensequenzierung.

Die folgende info-grafische enthält weitere Informationen zum Unterschied zwischen Klon durch Klonsequenzierung und Schrotflintensequenzierung.

Zusammenfassung -Klon durch Klonsequenzierung gegen Schrotflintensequenzierung

Bei der Zusammenfassung des Unterschieds zwischen Klon durch Klonsequenzierung und Schrotflintensequenzierung sind der Klon durch Klonsequenzierung und Schrotflintensequenzierung zwei Methoden der Genomsequenzierung. Klon nach Klonsequenzierungstechnik beinhaltet jedoch sowohl Genom -Mapping- als auch Klonierungsprozesse, während Klon durch Schrotflintensequenzierung nicht der Fall ist. Dies ist also der Schlüsselunterschied zwischen Klon durch Klonsequenzierung und Schrotflintensequenzierung. Da die Genomzuordnung während des Klons durch Klonsequenzierung stattfindet, treten bei der Anordnung von Sequenzen Fehler weniger wahrscheinlich auf. Aber Clon von Shotgun Sequenzierung ist viel schneller und billigerer Prozess. Es ist jedoch vergleichsweise weniger zuverlässig. Klon durch Klonsequenzierung war die bevorzugte Sequenzierungsmethode während des "Human -Genom -Projekts". Der moderne Molekularbiologe stützt sich jedoch mehr auf Klon durch Schrotflintensequenzierung.

Referenz:

1. „Was ist Klon-by-Clone-Sequenzierung?”Fakten, das öffentliche Engagement -Team auf dem Wellcome Genome Campus, 17. November. 2014, hier erhältlich.
2. „Was ist Schrotflintesequenzierung??”Fakten, das öffentliche Engagement -Team auf dem Wellcome Genome Campus, 17. November. 2014, hier erhältlich.

Bild mit freundlicher Genehmigung:

1. "Schritte des molekularen Klonen" von Alexpicardal97 - eigene Arbeit, CC BY -SA 4.0) über Commons Wikimedia
2. "Shotgun Sequencing LG" vom National Human Genome Research Institute - Nationale Gesundheitsinstitute. Nationales Institut für menschliche Genomforschung. „Glossar genetischer Begriffe sprechen.”Abgerufen am 17. November 2016 (Public Domain) über Commons Wikimedia