Ein Gen enthält codierende und nicht kodierende Regionen darin. Codierungssequenzen werden als Exons bekannt, und Nichtkodierungssequenzen werden als Introns bezeichnet. Die Nukleotidsequenz der Exons eines Gens repräsentiert den genetischen Code des Gens, um das spezifische Protein zu synthetisieren. Daher verbleiben Exons im mRNA -Molekül. Die gesamte Exon -Region des Genoms ist als Exom bekannt und ist ein wichtiger Bestandteil des Genoms. Der genetische Code der Gene wird in den genetischen Code des mRNA -Moleküls umgewandelt, der für die Produktion von Protein benötigt wird. Die gesamten mRNA. Der Schlüsselunterschied zwischen Exom und Transkriptom ist das Das Exom repräsentiert die Sequenzen der Exon -Regionen des Genoms während Transkriptom repräsentiert die Gesamt -mRNA einer Zelle oder eines Gewebes zu einem bestimmten Zeitpunkt.
INHALT
1. Überblick und wichtiger Unterschied
2. Was ist Exom
3. Was ist Transkriptom
4. Seite an Seitenvergleich - Exom vs Transkriptom
5. Zusammenfassung
Gene bestehen aus Exons, Introns und regulatorischen Sequenzen. Exons sind die Genregionen, die während der Transkription in mRNA -Sequenz transkribiert werden. Introns und andere Nichtkodierregionen werden während der Transkription entfernt. Die Nukleotidsequenz von Exons bestimmt den genetischen Code des Gens, das das spezifische Protein synthetisiert, das es codiert. Nur Exons bleiben innerhalb mRNA eines Proteins. Die Sammlung von Exons im Genom ist als Exom eines Organismus bekannt. Es repräsentiert einen Teil des Genoms, das in Genen exprimiert wird. Beim Menschen macht Exom 1% aus dem Genom aus. Es ist der proteinkodierende Teil des menschlichen Genoms.
Abbildung 01: Exom
Das Transkriptom ist die Sammlung aller Proteinkodier- und Nicht-kodierenden Transkripte (RNAs) in einem bestimmten Gewebe. Transkriptom repräsentiert die Sammlung von Gesamtmolekülen, die von den Genen in einer Zelle oder einem Gewebe exprimiert werden. Das Transkriptom einer Zelle kann mit dem Transkriptom eines anderen Zelltyps variiert werden. Das Transkriptom ist auch dynamisch - es ändert sich mit der Zeit als Reaktion auf interne und externe Stimuli. Auch innerhalb desselben Gewebes oder innerhalb desselben Zelltyps kann sich das Transkriptom nach wenigen Minuten ändern.
Transkriptom unterscheidet sich vom Exom eines Organismus. Transkriptom enthält nur die exprimierten Exomsequenzen. Obwohl das Exom einer Zelle gleich bleibt, unterscheidet sich das Transkriptom zwischen den Zellen, da die Genexpression für alle Zellen oder Gewebe nicht gleich ist. Nur essentielle Gene werden in verschiedenen Zellen und Geweben exprimiert. Die Genexpression ist ein Gewebe- oder Zelltyp -spezifischer Prozess. Es wird durch verschiedene Faktoren, einschließlich Umweltfaktoren, reguliert. Daher kann Transkriptom mit externen Umgebungsbedingungen variieren.
Transkriptom wird als Vorläufer für Proteomikstudien verwendet. Alle Proteine stammen aus mRNA -Sequenzen. Translationale Modifikationen können zu den Veränderungen in Proteinen führen. Transkriptom liefert jedoch wichtige grundlegende Informationen für die proteomischen Studien.
Abbildung 02: Transkriptom embryonaler Stammzellen
Exom gegen Transkriptom | |
Exom ist die Sammlung von Proteinkodierregionen der Gene. | Transkriptom ist die Sammlung aller transkribierten RNA einschließlich mRNA. |
Probe | |
Das Exom wird unter Verwendung von DNA -Probe untersucht. | Transkriptom wird unter Verwendung einer RNA -Probe untersucht. |
Studienmethode | |
Ganze Exomsequenzierung ist die Methode zur Untersuchung von Exom. | Die RNA -Sequenzierung ist die Methode zur Untersuchung des Transkriptoms. |
Exons sind die codierenden Sequenzen der Gene und bestimmen die mRNA -Sequenzen der Proteine. Die Sammlung dieser Codierungssequenzen (Exons) ist als Exom eines Organismus bekannt. Gene werden vor der Herstellung von Proteinen in mRNA -Moleküle transkribiert. Die gesamten mRNA -Moleküle einer Zelle oder eines Gewebes zu einem bestimmten Zeitpunkt werden als Transkriptom bezeichnet. Transkriptom repräsentiert die Gene, die zu einem bestimmten Zeitpunkt aktiv in mRNA exprimiert werden. Transkriptom ist Zell- und Gewebespezifikum und wirkt sich auf die Umgebungsbedingungen aus. Dies ist der Unterschied zwischen Exom und Transkriptom.
Verweise:
1.Sarah et al., „Gezielte Erfassung und massiv parallele Sequenzierung von zwölf menschlichen Exomenen." Natur. U.S. Nationalbibliothek für Medizin, 10. September. 2009. Netz. 01 Apr. 2017
2.Muttz et al. „Transkriptomanalyse unter Verwendung der Sequenzierung der nächsten Generation.”Elsevier: Article -Locator. N.P., September. 2012. Netz. 01 Apr. 2017
Bild mit freundlicher Genehmigung:
1."Das Transkriptom pluripotenter Zellen" durch grskovic, m. und Ramalho-Santos, m., Das pluripotente Transkriptom (10. Oktober 2008), Stembook, ed. Die STEM Cell Research Community, Stembook, doi/10.3824/Stembook.1.24.1, http: // www.STEMBOOK.Org. - [1] DirectStembook Abbildung 2 Das Transkriptom pluripotenter Zellen.Grskovic, m. und Ramalho-Santos, m., Das pluripotente Transkriptom (10. Oktober 2008), Stembook, ed. Die STEM Cell Research Community, Stembook, doi/10.3824/Stembook.1.24.1, (cc von 3.0) über Commons Wikimedia