Unterschied zwischen Fisch und CGH

Unterschied zwischen Fisch und CGH

Der Schlüsselunterschied Zwischen Fisch und CGH ist das FISH ist eine molekulare Technik, die eine spezifische DNA -Sequenz auf einem Chromosom unter Verwendung von fluoreszenz markierten Sonden nachweist, während CGH eine weitere molekulare zytogenetische Technik ist, die Veränderungen in der genomischen DNA nachweist.

Die zytogenetische Analyse spielt eine wichtige Rolle in der Medizin beim Nachweis von chromosomalen Anomalien wie Aneuploidien, Deletionen, Duplikationen und Umständen usw. Chromosomalanomalien führen schließlich zu genetischen Erkrankungen wie Krebs, Unfruchtbarkeit, Down -Syndrom, Klinefelter -Syndrom, Turner -Syndrom, Leukämie usw. Es gibt verschiedene molekulare zytogenetische Methoden, um oben genannte Defekte und Krankheiten nachzuweisen. Unter ihnen sind Fische (fluoreszierende In -situ -Hybridisierung) und CGH (vergleichende genomische Hybridisierung) zwei leistungsstarke Hybridisierungstechniken. Beide Methoden haben jedoch Vor- und Nachteile.

INHALT

1. Überblick und wichtiger Unterschied
2. Was ist Fisch 
3. Was ist CGH
4. Ähnlichkeiten zwischen Fisch und CGH
5. Seite an Seite Vergleich - Fisch gegen CGH in tabellarischer Form
6. Zusammenfassung

Was ist Fisch?

Fisch ist eine Nukleinsäure -Hybridisierungstechnik, die an einem Teil oder Abschnitt des Gewebes im gesamten Gewebe oder in den Zellen durchgeführt wird. Es ist eine Sondenbasis-Methode. Die Technik hängt von der Theorie der Watson -Crick -Komplementär -Basenpaarung ab, was zu DNA -DNA -Hybriden oder DNA -RNA -Hybriden führt, die somit mutierte Gene nachweisen oder das interessierende Gen identifizieren können. Ferner verwendet diese Technik einzelsträngige DNA-Sequenzen, doppelsträngige DNA-Sequenzen, Einzelsträngige RNA-Sequenzen oder synthetisch. Außerdem ist das wichtigste Merkmal dieser Technik die Markierung von Sonden mit Fluoreszenzfarbstoffen. Somit binden die Sonden mit den komplementären Teilen des Chromosoms und machen es leicht zum Nachweis.

Darüber hinaus ist Fisch eine hochempfindliche und spezifische Methode. Daher ist es eine häufige Technik sowohl bei der Forschung als auch bei der Diagnose hämatologischer Malignitäten und soliden Tumoren. Aber Fisch zeigt eine geringe Auflösung. Es erfordert auch Vorkenntnisse der Zielabnormalität, um Sondensequenzen zu entwerfen.

Abbildung 01: Fisch

Es gibt viele Anwendungen von Fischen, hauptsächlich in der molekularen Diagnostik von Infektionskrankheiten, um das Vorhandensein von Krankheitserregern zu identifizieren und den Erreger über molekulare Diagnostik zu bestätigen. Darüber hinaus ist Fisch eine häufig verwendete Technik in den Bereichen Entwicklungsbiologie, Karyotypisierung und phylogenetische Analyse und physikalische Kartierung von Chromosomen.

Was ist CGH?

Vergleichende genomische Hybridisierung (CGH) ist eine weitere molekulare zytogenetische Technik auf DNA -basierter DNA, die die Veränderungen der genomischen DNA -Sequenzen nachweisen kann. Die Methode ist eine erweiterte Methode, die Chromosom- und Genmodifikationen analysieren kann, um die Veränderungen oder Veränderungen in den genomischen DNA -Sequenzen nachzuweisen. Ferner erfordert CGH die Isolierung und Fragmentierung von DNA aus der experimentellen Probe und Referenzprobe. Dann sollten die Proben unter Verwendung von zwei verschiedenen fluoreszierenden Farbstoffen (normalerweise rot und grün) markiert werden. Später sind beide Proben gemischt und konkurrierende Hybridisierung ermöglicht. Der letzte Schritt ist die Analyse der Proben für Veränderungen in der DNA wie die Gen -Duplikation, den Genverlust usw. Insbesondere misst es die DNA -Kopienzahlunterschiede zwischen der Testprobe und der Kontrollprobe.

Abbildung 02: CGH

Eine andere Version von CGH ist ab sofort verfügbar. Es ist eine fortgeschrittenere Methode als die normale CGH. Es handelt sich um eine Technik namens Array-basierter CGH oder ACGH. ACGH ermöglicht die genaue Identifizierung von Gen- oder Sequenzdeletionen in vielen tausend Sequenzen in einem einzigen Experiment.

Was sind die Ähnlichkeiten zwischen Fisch und CGH?

  • Fisch und CGH sind zwei molekulare Techniken.
  • Sowohl Fisch als auch CGH verlassen sich auf die Hybridisierung von Nukleinsäure.
  • Außerdem benötigen beide Techniken konstruierte Sonden, um spezifische DNA -Ziele nachzuweisen.
  • Wir verwenden sie für die vornatale und postnatale Diagnose genetischer Krankheiten.
  • Darüber hinaus sind sowohl Fisch als auch CGH sehr leistungsstarke Werkzeuge, um genomische Veränderungen zu untersuchen.
  • Sie verwenden fluoreszierende Farbstoffe, um Sonden zu kennzeichnen.

Was ist der Unterschied zwischen Fisch und CGH?

Fisch ist ein vor Ort Hybridisierungsverfahren, bei dem Fluoreszenzsonden verwendet werden, um spezifische DNA -Sequenzen nachzuweisen, während CGH eine molekulare Hybridisierungstechnik ist, die die Veränderungen der genomischen DNA -Sequenzen nachweist. Dies ist also der Hauptunterschied zwischen Fisch und CGH.

Darüber hinaus erfordert FISH Vorkenntnis der Zielabnormalität, um Sondensequenzen zu entwerfen, während CGH kein Vorkenntnis erfordert. Ein weiterer Unterschied zwischen Fisch und CGH besteht darin, dass die Fische eine begrenzte Auflösung aufweisen, während ACGH eine hohe Auflösung aufweist.

Die folgende Infografik fasst den Unterschied zwischen Fisch und CGH zusammen.

Zusammenfassung -Fisch gegen CGH

Fisch und CGH sind zwei molekulare zytogenetische Techniken, die den Nachweis von interessierenden Gensequenzen erleichtern. FISH erleichtert den Nachweis einer spezifischen DNA -Sequenz auf einem Chromosom unter Verwendung fluoreszenzmarkierter Sonden, während CGH den Nachweis von Veränderungen in der genomischen DNA erleichtert. Dies ist also der Hauptunterschied zwischen Fisch und CGH.

Referenz:

1. „Fluoreszenz in situ Hybridisierung (FISH)“ Nature News, Nature Publishing Group, hier verfügbar.
2. Hester, Susan D, et al. „Vergleich der vergleichenden genomischen Hybridisierungstechnologien auf Microarray -Plattformen.Journal of Biomolekulartechniken: JBT, Assoziation von Biomolekularen Ressourcenfazilitäten, APR. 2009, hier erhältlich.

Bild mit freundlicher Genehmigung:

1. "Multiplex ViewRNA -Fisch -Assay in Jurkat- und Hela -Zellen" von Ryan Jeffs - eigene Arbeit (CC BY -SA 3.0) über Commons Wikimedia
2. "CGH -Schema" von Mbaraudis (Talk) (Uploads) - eigene Arbeit (CC von 2.5) über Commons Wikimedia