Unterschied zwischen molekularem Docking und Bewertung
Der Schlüsselunterschied Zwischen molekularem Docking und Bewertung ist das Das Docking ist eine Technik, mit der die Bindungsaffinität zwischen zwei Molekülen bestimmt wird, während die Bewertung ein Prozess der Bewertung einer bestimmten Pose durch Zählen der Anzahl günstiger intermolekularer Wechselwirkungen ist.
Die Begriffe molekulares Andocken und Bewertungen werden im Bereich der molekularen Modellierung verwendet. Die molekulare Modellierung ist eine Technik, um die möglichen Anordnungen verschiedener Moleküle in einer bestimmten Substanz zu bestimmen. Diese Technik ist wichtig, um neue stabile Verbindungen zu schaffen.
INHALT
1. Überblick und wichtiger Unterschied
2. Was ist molekulares Andocken
3. Was ist molekulare Bewertung?
4. Nebenseitiger Vergleich - Molekulares Andocken gegen Bewertung in tabellarischer Form
5. Zusammenfassung
Was ist molekulares Andocken?
Das molekulare Docking ist eine Rechensimulation eines Kandidatenliganden, der an einen Rezeptor bindet. Diese Methode sagt die bevorzugte Orientierung eines Moleküls an ein anderes Molekül vor, wenn sie an einander gebunden sind, um einen stabilen Komplex zu bilden. Die aus dieser Technik erhaltenen Ergebnisse können verwendet werden, um die Stärke der Assoziations- oder Bindungsaffinität zwischen zwei Molekülen vorherzusagen. Hier ist auch die molekulare Bewertungsfunktion wichtig.
Abbildung 01: Ein einfaches Diagramm, das den Prozess molekularer Wechselwirkungen in biologischen Systemen zeigt
Im Allgemeinen berücksichtigt diese Technik die biologisch relevanten Moleküle wie Proteine, Peptide, Nukleinsäuren, Kohlenhydrate und Lipide. Diese Moleküle sind sehr wichtig und spielen eine wichtige Rolle bei Signaltransduktionsmechanismen in unserem Körper. Daher beeinflusst die Ausrichtung der beiden Moleküle, die für diesen Signaltransduktionsprozess binden. Das bedeutet; Das molekulare Docking ist wichtig, um sowohl die Stärke als auch die Art des Signals zu bestimmen, der während der Signaltransduktion in biologischen Systemen erzeugt wird.
Darüber hinaus sind molekulare Docking-Techniken wichtig für die Gestaltung strukturbasierter Arzneimittel. Dies liegt an der Vorhersagbarkeit der Bindungskonformation kleiner Moleküle wie Liganden an eine geeignete Bindungsstelle.
Was ist molekulare Bewertung??
Die molekulare Bewertung ist eine Art mathematischer Funktion, die bei der Bewertung des Fortschritts des molekularen Docking nützlich ist. Im Bereich der Computerchemie werden Bewertungsfunktionen zur Vorhersage der Bindungsaffinität zwischen zwei Molekülen nach dem Docking verwendet. Wenn wir beispielsweise ein kleines Molekül eines Partikelmedikaments haben und es ein biologisches Ziel wie ein Protein gibt, können wir die Affinität des Arzneimittels zur Bindungsstelle bewerten. Darüber hinaus kann die molekulare Bewertung verwendet werden, um die intermolekularen Wechselwirkungen zwischen zwei Proteinen oder zwischen einem Protein und DNA.
Abbildung 02: Bewertungsfunktion kurz
Die Hauptanwendung der molekularen Bewertung liegt in den Arzneimitteldesign-Prozessen zum Beispiel, virtuelles Screening, De-novo-Design, Bleioptimierung usw.
Was ist der Unterschied zwischen molekularem Docking und Wertung?
Molekulares Andocken und Bewertungen sind bei der molekularen Modellierung wichtig. Der wichtigste Unterschied zwischen molekularem Docking und Scoring besteht darin, dass das Docken eine Technik ist, die zur Bestimmung der Bindungsaffinität zwischen zwei Molekülen verwendet wird, während die Bewertung ein Prozess der Bewertung einer bestimmten Pose durch Zählen der Anzahl der günstigen intermolekularen Wechselwirkungen ist.
Die folgende Infografik fasst den Unterschied zwischen molekularem Docking und Scoring zusammen.
Zusammenfassung -molekulares Docking gegen Bewertung
Molekulares Andocken und Bewertungen sind bei der molekularen Modellierung wichtig. Der wichtigste Unterschied zwischen molekularem Docking und Scoring besteht darin, dass das Docken eine Technik ist, die zur Bestimmung der Bindungsaffinität zwischen zwei Molekülen verwendet wird, während die Bewertung ein Prozess der Bewertung einer bestimmten Pose durch Zählen der Anzahl der günstigen intermolekularen Wechselwirkungen ist.
Referenz:
1. „Docking (molekular).”Docking (molekular) - Ein Überblick | Sciencedirect -Themen, hier erhältlich.
2. Dar, Ayaz Mahmood. „Molekulares Docking: Ansätze, Typen, Anwendungen und Grundprobleme.Omics International, Omics International, 27. März. 2017, hier erhältlich.
Bild mit freundlicher Genehmigung:
1. "Docking Repräsentation 2" von Scigenis - eigene Arbeit (CC BY -SA 4.0) über Commons Wikimedia
2. "ScoringFunction" von Poulamibarman bei English Wikibooks - Transfer von EN.Wikibooks nach Commons von Adrignola unter Verwendung von CommonShelper (Public Domain) über Commons Wikimedia
