Was ist der Unterschied zwischen MLVA und MLST

Der Schlüsselunterschied Zwischen MLVA und MLST ist, dass MLVA den Polymorphismus von tandemly wiederholten DNA -Sequenzen verwendet, um mikrobielle Spezies zu charakterisieren, während MLST den Polymorphismus von DNA.

Die mikrobielle Typisierung wird normalerweise verwendet, um die Quelle und die Routen von Infektionen zu bestimmen. Es bestätigt oder schließt Ausbrüche aus. Die mikrobielle Typisierung verfolgt auch die Kreuzübertragung von Gesundheitsfäden und erkennt virulente Stämme. Darüber hinaus bewertet die mikrobielle Typisierung die Wirksamkeit von Kontrollmessungen von pathogenen mikrobiellen Spezies. MLVA und MLST sind zwei molekulare biologische Techniken, die bei der mikrobiellen Typisierung verwendet werden.

INHALT

1. Überblick und wichtiger Unterschied
2. Was ist MLVA 
3. Was ist mlst
4. Ähnlichkeiten -MLVA und MLST
5. MLVA gegen MLST in tabellarischer Form
6. Zusammenfassung -MLVA gegen MLST

Was ist MLVA?

Mehrere Loci -VNTR -Analyse (MLVA) ist eine molekulare biologische Methode, die den Polymorphismus von tandemly wiederholten DNA -Sequenzen verwendet, um mikrobielle Spezies zu charakterisieren. Es ist eine Methode, die für die genetische Analyse bestimmter mikrobieller Spezies verwendet wird.

Während des ersten Schritts von MLVA wird jeder gezielte VNTR-Ort durch PCR mit flankierenden regionspezifischen Primern verstärkt. Dann sind die erhaltenen Fragmente durch Elektrophorese auf einem Kapillarsequenzer getrennt. Die Genotypisierung jedes Ortes und der aus jeder Probe zusammengestellten Ergebnisse ermöglichen die Charakterisierung eines Mikroorganismus, dessen Spezies bekannt ist. Es ermöglicht auch die Identifizierung der Unterarten durch Allel -Typisierung und Vergleich mit den MLVA -Datenbanken.

Abbildung 01: MLVA

Diese MLVA -Methode ist selektiver als die MLST -Methode. Darüber hinaus erfordert die MLVA -Methode keinen DNA -Sequenzierungsschritt. Somit ermöglicht es, enge Unterarten oder klonale Arten zu unterscheiden.

Was ist mlst?

Multilokus -Sequenz -Typisierung (MLST) ist eine Technik, die den Polymorphismus von DNA -Sequenzen interner Fragmente mehrerer Housekeeping -Gene verwendet, um mikrobielle Spezies zu charakterisieren. MLST ist eine Technik in der genetischen Analyse für die Typisierung mehrerer Loci.

Abbildung 02: MLST

Es handelt sich um eine Art von Sequenzierung, die als Referenztechnik verwendet wird, um verschiedene Stämme von mikrobiellen Spezies zu unterscheiden. Diese Methode basiert auf der Sequenzierung von Housekeeping -Genen. Die Haushaltsgene kodieren normalerweise essentielle Proteine ​​von mikrobiellen Mitteln wie einem Bakterium. Diese Sequenzen von Housekeeping -Genen haben die Besonderheit, einen stabilen Polymorphismus im Laufe der Zeit zu präsentieren. Daher sind die Unterschiede in Sequenzen von Haushaltsgenen ausreichend genug, um Stämme voneinander zu unterscheiden. Darüber hinaus war das erste zu entwickelnde MLST -Schema Meningokokken, das ursächliche Mittel der Meningokokken -Meningitis und Septikämie. Seit seiner Einführung wurde MLST nicht nur für menschliche Krankheitserreger, sondern auch für Pflanzenpathogene verwendet.

Was sind die Ähnlichkeiten zwischen MLVA und MLST?

• MLVA und MLST sind zwei molekulare biologische Techniken, die bei der mikrobiellen Typisierung verwendet werden.
• Beide Techniken können zur mikrobiellen phylogenetischen Analyse verwendet werden.
• Beide Techniken basieren auf dem genetischen Polymorphismus.
• Sie können zum Nachweis menschlicher Krankheiten verwendet werden, die mikrobielle Krankheitserreger verursachen.
• Beide Techniken sollten von erfahrenen molekularen Biologen durchgeführt werden.

Was ist der Unterschied zwischen MLVA und MLST?

MLVA ist eine Technik, die den Polymorphismus von tandemen wiederholten DNA -Sequenzen verwendet, um mikrobielle Spezies zu charakterisieren. Inzwischen ist MLST eine Technik, die den Polymorphismus von DNA -Sequenzen interner Fragmente mehrerer Haushaltsgene verwendet, um mikrobielle Spezies zu charakterisieren. Dies ist daher der Schlüsselunterschied zwischen MLVA und MLST. Darüber hinaus ist die MLVA -Methode selektiver als die MLST -Methode.

Die folgende Infografik zeigt die Unterschiede zwischen MLVA und MLST in tabellarischer Form für den Nebenseitigen Vergleich.

Zusammenfassung -MLVA gegen MLST

MLVA und MLST sind zwei molekulare biologische Techniken, die bei der mikrobiellen Typisierung verwendet werden. MLVA verwendet den Polymorphismus von tandemly wiederholten DNA -Sequenzen, um mikrobielle Spezies zu charakterisieren, während MLST den Polymorphismus von DNA. Dies ist also der Hauptunterschied zwischen MLVA und MLST.

Referenz:

1. „Wiederholte Analyse der Tandem-Tandem-Tandem-Locus (MLVA).”Zentren für die Kontrolle und Prävention von Krankheiten, Zentren für die Kontrolle und Prävention von Krankheiten, 16. Februar. 2016.
2. „Multilokus -Sequenz -Typisierung.”Ein Überblick | Sciencedirect -Themen.

Bild mit freundlicher Genehmigung:

1. "1993 48 Kameido isoliert den Genotyp" (CC0) über Picryl
2. "FMICB-04-00414-G001 (14424086445)" nach Phylogenie-Figuren-FMICB-04-00414-G001 (CC durch 2.0) über Commons Wikimedia