Was ist der Unterschied zwischen SF1 und SF2

Der Schlüsselunterschied zwischen SF1 und SF2 ist ihre Fähigkeit, Nukleinsäuren abzuwickeln. Während SF1 nur DNA abwickelt, entspannt SF2 sowohl DNA als auch RNA.

Helicase ist eines der wichtigsten Enzyme, die am DNA -Replikationsprozess sowie an DNA -Reparaturprozessen teilnehmen. Die Hauptaufgabe der Helikase besteht darin, am Abwickelnsprozess teilzunehmen, um die Trennung von doppelsträngigen DNA. Die Aktivität des Enzyms ist während der Initiationsphase der DNA -Replikation von wesentlicher Bedeutung. Helikasen sind geteilt als SUper Familer 1 Und SUper Familer 2 hauptsächlich basierend auf ihren strukturellen Unterschieden. In jeder Superfamilie gibt es vielfältigere Arten von Helikasen.

INHALT

1. Überblick und wichtiger Unterschied
2. Was ist SF1  
3. Was ist SF2
4. Ähnlichkeiten -SF1 und SF2
5. SF1 gegen SF2 in tabellarischer Form
6. Zusammenfassung -SF1 gegen SF2

Was ist SF1?

Super Family 1 Helicase ist eine Art Helikase, die neben dem internen Kernprotein eine hexamere Struktur umfasst, die die Helikaseaktivität darstellt. SF1 -Helikase ist eine der größten Helikaseklassen und kann als SF1A -Helikasen und SF1B -Helikasen weiter eingestuft werden. Proteine ​​wie PCRA, Rep und UVRD gehören zur Klasse der SF1A -Helikasen. Im Vergleich dazu gehören Proteine ​​wie Reca und DDA zur Klasse der SF1B -Helikasen. Die Funktionen von SF1 -Helikasen variieren stark. Einige der wichtigsten Funktionen von SF1 -Helikasen umfassen DNA -Replikation, DNA -Rekombination, OKAZAKI -Fragmentverarbeitung, Telomerbildung und Reparatur der Nukleotid -Exzision von DNA -Schäden. Bei einigen bakteriellen Spezies nimmt auch die SF1 -Art von Helikasen teil, um den horizontalen Gentransfer durch Konjugation zu unterstützen. Darüber hinaus helfen SF1 -Helikasen in Viren bei der Virusreplikation.

Abbildung 01: Helikaseaktion

Es gibt viele verschiedene Motive, die mit der Struktur von SF1 -Helikasen assoziiert sind. Sie enthalten mindestens 7 konservierte Motive unter allen verschiedenen Arten von SF1 -Helikasen (Q, I, IA, II, III, IV, V und VI). Die Struktur von SF1 -Helikase ist ein Kristall, bei dem die Motive zusammengeklustert werden. Es gibt eine charakteristische ATP -Bindungstasche zwischen den Motiven und der DNA -Bindungsstelle. Die nicht konservierten Domänen werden verteilt, um die strukturelle Integrität des Helikasemoleküls aufrechtzuerhalten. Diese Domänen könnten zwischen den SF1A -Helikasen und den SF1B -Helikasen variieren.

Was ist SF2?

Super Family 2 Helicase ist eine der unterschiedlichsten Gruppen von Helikase -Superfamilien. Es gibt viele Arten von SF2 -Helikasen wie Recq -ähnliche Helikasen, RECG - wie Helikasen, Rad3/XPD und NS3 -Helikasen. Einige Restriktionsenzyme, wie z. B. Einschränkungsenzyme vom Typ I. Die allgemeine Funktion von SF2-Helikasen ist die Abwicklung von doppelsträngiger DNA. Einige Arten von SF2 -Helikasen haben jedoch nicht die Fähigkeit, als Helikase -Enzyme vollständig zu fungieren. SF2 -Helikasen werden auch in der RNA -Verarbeitung häufig verwendet. Die Dead-Box-Familie von SF2-Helikasen beteiligt sich an der RNA-Verarbeitung, einschließlich Transkription, Spleiß-, Translationsverarbeitungs- und RNA-Protein-Komplex-Assemblierung.

Abbildung 02: Helikase

Die Struktur der SF2 -Helikase enthält auch konservierte Motive. Einige Domänen unterscheiden sich jedoch geringfügig von der von SF1 -Helikase. Sie enthalten auch eine ATP -Bindungsdomäne, abgesehen von der DNA -Bindungsdomäne.

Was sind die Ähnlichkeiten zwischen SF1 und SF2?

• SF1 und SF2 zeigen Helikaseaktivität.
• Darüber hinaus nehmen beide an DNA -Replikation und Rekombination teil.
• SF1 und SF2 bestehen aus konservierten Motiven.
• Beide haben eine ATP -Bindungsdomäne und eine DNA -Bindungsdomäne.
• Diese Formen sind Multi-Domänen-Proteine.
• Wenn Mutationen in beiden Typen stattfinden, führt dies zu schädlichen Effekten.
• Sowohl SF1 als auch SF2 sind entscheidend, um die Kontinuität des Zellzyklus zu gewährleisten.
• SF1 und SF2 sind sowohl in Prokaryoten als auch in Eukaryoten vorhanden.

Was ist der Unterschied zwischen SF1 und SF2?

SF1 und SF2 sind zwei Superfamilien von Helikase. Sie zeigen eine große Vielfalt. Der Hauptunterschied zwischen SF1 und SF2 besteht darin, dass SF1 hauptsächlich an der Abwicklung von DNA beteiligt ist, während SF2 auch an der RNA -Verarbeitung während der Transkription und Translation teilnimmt. Beim Vergleich der verschiedenen Motive des Proteins unterscheiden sich SF1 und SF2 hauptsächlich basierend auf Motiv III und Motiv IV. Obwohl sie eine strukturelle Ähnlichkeit haben, bilden SF1 -Helikasen toroidale hexamere Strukturen, während SF2 diese strukturellen Anordnungen nicht formuliert.

Ein weiterer Unterschied zwischen SF1 und SF2 besteht darin, dass SF1 -Helikasen Adenin -Nukleotide mehr bevorzugen, während SF2 -Helikasen alle fünf Nukleotide bevorzugen. Beim Vergleich der sich abwickelten Richtung translozieren SF1 -Helikasen nur in die Richtung von 5 'bis 3', während SF2 -Helikasen die Fähigkeit haben, zusammen mit den Nukleinsäuren in beide Richtungen zu translozieren.

Die folgende Infografik stellt die Unterschiede zwischen SF1 und SF2 in tabellarischer Form für den Vergleich von Seite für Seite dar.

Zusammenfassung -SF1 gegen SF2

Helikasen sind eine sehr wichtige und vielfältige Gruppe von Enzymen, die an der DNA -Replikation teilnehmen. Aufgrund seiner hohen Vielfalt werden Enzyme jedoch in Superfamilien eingeteilt. SF1 und SF2 sind die beiden größten Superfamilien von Helikasen. Während SF1 hauptsächlich mit der Verarbeitung im Zusammenhang mit DNA assoziiert ist, ist SF2 sowohl mit der DNA- als auch mit der RNA -Verarbeitung verbunden. Dies ist daher der Schlüsselunterschied zwischen SF1 und SF2. Darüber hinaus unterscheiden sich SF1 und SF2 auch in ihrer strukturellen Anordnung, da SF2 keine hexameren Strukturen bildet. Mutationen in den SF1- und SF2 -Helikasen werden zur Entwicklung von Krebs nach Dysregulation des Zellzyklus und anderen wichtigen Mechanismen wie DNA -Reparatur führen.

Referenz:

1. Fairman-Williams, Margaret E, et al. „SF1- und SF2 -Helikasen: Familienangelegenheiten.Aktuelle Meinung in der Strukturbiologie, u.S. National Library of Medicine, Juni 2010.
2. Raney, Kevin D, et al. „Struktur und Mechanismen von SF1 -DNA -Helikasen.Fortschritte in der experimentellen Medizin und Biologie, u.S. National Library of Medicine, 2013.

Bild mit freundlicher Genehmigung:

1. "DNA Replication en" von Ladyofhats Mariana Ruiz - eigene Arbeit (Originaltext: eigener Arbeit. Bild in Datei umbenannt: DNA -Replikation.SVG) (Public Domain) über Commons Wikimedia
2. "4m4w" von Liu, b., Eliason, w.K., Steitz, t.A.; Visualisierungsautor: Benutzer: Astrojan - RCSB (CC BY -SA 4.0) über Commons Wikimedia