Was ist der Unterschied zwischen TAQ und PFU -Polymerase

Was ist der Unterschied zwischen TAQ und PFU -Polymerase

Der Schlüsselunterschied zwischen TAQ und PFU -Polymerase ist, dass die Taq-Polymerase eine 5'-3'.

DNA -Polymerase katalysiert die Synthese von DNA während der Replikation. DNA -Polymerase verwendet einen Template -DNA -Strang, um den komplementären DNA -Strang zu synthetisieren. Zusätzlich zu seiner Funktion als Polymerase hilft es bei der DNA -Korrekturlesen und Schädigung der Reparatur durch seine Exonuklease -Aktivität. Taq- und PFU -Polymerase sind zwei Hauptpolymerase -Enzyme. Taq -Polymerase gehört zur Familie A, während die PFU -Polymerase zur Familie B gehört. Sie sind replikativ und reparieren Polymerasen und spielen eine wichtige Rolle bei einer Polymerasekettenreaktion (PCR).

INHALT

1. Überblick und wichtiger Unterschied
2. Was ist Taq -Polymerase
3. Was ist PFU -Polymerase
4. Ähnlichkeiten -Taq- und PFU -Polymerase
5. Taq gegen Pfu -Polymerase in tabellarischer Form
6. Zusammenfassung -Taq gegen Pfu -Polymerase

Was ist Taq -Polymerase?

Taq -Polymerase ist eine thermostabile DNA -Polymerase 1, die nach ihrer Entdeckung aus dem thermophilen eubakteriellen Mikroorganisum benannt ist Thermous aquaticus. T. Aquaticus ist ein Bakterium, das unter extrem heißen Bedingungen wie heißen Quellen und hydrothermalen Lüftungsschlitzen lebt. Taq Polymerase wird als Enzym identifiziert, das gegen hohe Temperaturen resistent ist; Daher wird es während der PCR häufig verwendet. Die Taq -Polymerase hat eine ähnliche Struktur wie E. coli Polymerase a. Es besteht aus einer funktionellen 5'-3'-Exonuklease-Domäne am Ende des Aminosäure-Terminals. Die verbleibenden zwei Domänen wirken durch gekoppelte Domänenbewegung in Koordination.

Abbildung 01: Taq -Polymerase

Die optimale Temperatur der Taq-Polymerase für ihre Aktivität beträgt 75-80 ° C. Das Enzym kann in weniger als zehn Sekunden bei 72 ° C einen 1000 bp -Strang DNA replizieren. Bei 75-80 ° C erreicht das Enzym seine optimale Polymerisationsrate, die 150 Nukleotide pro Sekunde pro Enzymmolekül beträgt. Die Verwendung von Taq Polymerase erleichtert eine hohe Spezifität der Primer und reduziert die Produktion nicht spezifischer Produkte wie Primer-Dimer.

Was ist PFU -Polymerase?

Die PFU-Polymerase ist ein Enzym Pyrococcus furiosus. Es hilft, die DNA des Organismus während der Zellteilung zu kopieren. Das Enzym gehört zur B-Familie der DNA-Polymerase und besteht aus einer 3'-5'-Exonuklease-Domäne. Ähnlich wie bei der Taq -Polymerase wird die PFU -Polymerase auch verwendet, um die DNA in PCR zu amplifizieren.

Abbildung 02: PFU -Polymerase

Die PFU -Polymerase hat hohe thermostbare und Korrekturlesen Eigenschaften. Das Enzym besitzt 3'-5 'Exonuklease-Korrekturlesenaktivität. Wenn sich die DNA aus dem 5' -3 ' -Ende zusammenstellt, hilft die Exonuklease -Aktivität der Pfu -Polymerase dazu. Infolgedessen die PCR -Fragmente erzeugt von Pfu Polymerase besteht aus weniger Fehlern. Pfu Polymerase zeigt auch eine signifikant höhere Replikationstreue. Jedoch, Pfu Die Polymerase ist langsamer und benötigt etwa ein bis zwei Minuten pro Zyklus zur Verstärkung bei 72 ° C.

Was sind die Ähnlichkeiten zwischen TAQ und PFU -Polymerase?

  • Taq- und PFU -Polymerase sind Polymerase -Enzyme.
  • Darüber hinaus werden sie als Enzyme in PCR verwendet.
  • TAQ- und PFU -Polymerasen sind thermostabile Enzyme.
  • Sie sind aus prokaryotischen Organismen isoliert.
  • Beide bestehen aus einer Exonuklease -Korrekturlesenaktivität.

Was ist der Unterschied zwischen TAQ und PFU -Polymerase?

Die Taq-Polymerase besitzt eine 5'-3 'Exonuklease-Korrekturlesenaktivität, während die PFU-Polymerase 3'-5' Exonuklease-Korrekturlesen besitzt. Dies ist daher der Schlüsselunterschied zwischen TAQ- und PFU -Polymerase. Die Taq -Polymerase ist nach dem Bakterium benannt Thermous aquaticus, Während die Pfu -Polymerase nach dem Archäon benannt ist Pyrococcus furiosus. Darüber hinaus gehört die Taq -Polymerase zur DNA -Polymerasegruppe a, während die PFU -Polymerase zur DNA -Polymerase -Gruppe B gehört.

Die folgende Infografik zeigt die Unterschiede zwischen TAQ- und PFU-Polymerase in tabellarischer Form für den Nebenseitigen Vergleich.

Zusammenfassung- Taq gegen Pfu-Polymerase

Taq- und PFU -Polymerase sind zwei Hauptpolymerase -Enzyme. Die Taq-Polymerase besitzt eine 5'-3 'Exonuklease-Korrekturlesenaktivität, während die PFU-Polymerase 3'-5' Exonuklease-Korrekturlesen besitzt. Dies ist der Schlüsselunterschied zwischen TAQ und PFU -Polymerase. Taq -Polymerase gehört zur Familie A, während die PFU -Polymerase zur Familie B gehört. Dies fasst also den Unterschied zwischen TAQ und PFU -Polymerase zusammen.

Referenz:

1. Ishino, Sonoko und Yoshizumi Ishino. „DNA -Polymerasen als nützliche Reagenzien für die Biotechnologie - die Geschichte der Entwicklungsforschung auf diesem Gebiet.Frontiers in Microbiology, vol. 5.
2. „PFU -DNA -Polymerase.”Ein Überblick | Sciencedirect -Themen.

Bild mit freundlicher Genehmigung:

1. "PDB 1KTQ EBI" von Jawahar Swaminathan und MSD -Mitarbeitern am Europäischen Bioinformatikinstitut - (Public Domain) über Commons Wikimedia
2. "PFU-Polymerase PCNA-Komplex-Band 3A2F Bio R 500" von RCSB (CC BY-SA 3.0) über Commons Wikimedia