Unterschied zwischen Sonde und Primer
Schlüsselunterschied - Sonde gegen Primer
Die molekulare Sonde ist ein kleines DNA- oder RNA -Fragment, das die komplementären Sequenzen in DNA oder RNA erkennt und die Identifizierung der Zielsequenz ermöglicht. Primer ist ein kleiner DNA- oder RNA -Abschnitt, der als Ausgangspunkt für die DNA -Synthese dient. Primer und Sonden hybridisieren mit den komplementären Nukleotiden der Template -DNA oder der Ziel -DNA. Der Schlüsselunterschied zwischen Sonde und Primer besteht jedoch darin Für die DNA -Replikation sind Primer erforderlich, während Sonden zum Nachweis spezifischer Sequenzen in der Proben -DNA erforderlich sind.
INHALT
1. Überblick und wichtiger Unterschied
2. Was ist Sonde
3. Was ist Primer
4. Seite an Seitenvergleich - Sonde gegen Primer
5. Zusammenfassung
Was ist eine Sonde?
Sonde ist ein kleines Fragment von DNA oder RNA, das verwendet wird, um die Ziel -DNA oder RNA in der Probe durch molekulare Hybridisierung nachzuweisen. Sie sind auch als bekannt als als Molekülmarker. Die Länge der Sonde kann variieren (100 bis 1000 Basen), und Sonden -Nukleotide werden zum Teil der Zielsequenz komplementär. Für die einfache Nachweis werden die Sonden mit radioaktiven Isotopen oder mit fluoreszierenden Farbstoffen oder Antikörpern markiert. Sonden binden mit den komplementären Grundlagen der Zielsequenz und zeigen das Vorhandensein der Ziel -DNA oder RNA in der Probe. Es gibt zwei Hauptmethoden zur Kennzeichnung von Sonden: Beendungskennzeichnung und Nickübersetzung. Sonden werden in verschiedene Typen, einschließlich DNA -Sonden, RNA -Sonden, cDNA.
Sonden sind wichtige Instrumente in vielen mikrobiellen und molekularen Bereichen wie Virologie, forensischer Pathologie, Vaterschaftstests, DNA -Fingerabdruck, Nachweis von genetischen Erkrankungen, RFLP, molekularer Cytogenetik, vor Ort Hybridisierung usw.
Abbildung 01: Fluoreszenz markierte Sonde, die bei Fisch zur Erfindung des Erregers verwendet wird
Was ist ein Primer?
Primer ist ein kurzes DNA- oder RNA -Fragment, das als Initiator für die DNA -Synthese dient. Das DNA -Polymerase -Enzym fügt der 3' -OH -Gruppe der Primersequenz Nukleotide hinzu und synthetisiert den neuen Strang, der zur Template -DNA komplementär ist. Primer sind sehr kurze Fragmente mit der Länge von 18 bis 20 Nukleotiden. Sie werden im Labor chemisch synthetisiert in vitro DNA -Amplifikation (PCR). Primer können eine Reihe von Nukleotiden haben, da sie vom Benutzer entworfen wurden. Sie werden synthetisiert, um mit den komplementären Grundlagen der Template -DNA übereinzustimmen. Daher kann es jede Sequenz von Nukleotiden haben. Primer sind für die DNA -Replikation von größter Bedeutung, da die DNA -Polymerase keine neue DNA ohne ein bereits bestehendes Stück DNA synthetisieren kann. Beim Entwerfen der Primer für PCR müssen die folgenden Dinge berücksichtigt werden:
- Primer sollten die komplementären Nukleotide bis zum flankierenden Ende der DNA enthalten, die sich verstärken will.
- Primer sollten eine Schmelztemperatur zwischen 55 und 65 haben 0C
- G- und C -Inhalt sollten zwischen 50 und 60% liegen.
In PCR werden zwei Primer als vorwärts und umgekehrt verwendet, um beide Stränge der Proben -DNA zu replizieren. Primer werden üblicherweise zur Durchführung von PCR- und DNA -Sequenzierung verwendet.
Abbildung 02: Primer -Glühen in PCR
Was ist der Unterschied zwischen Sonde und Primer?
Sonde gegen Primer | |
| Sonde ist ein kleines Fragment von DNA/RNA, das verwendet wird, um das Vorhandensein der Zielsequenz in einer Probe durch molekulare Hybridisierung nachzuweisen. | Primer ist eine kleine DNA- oder RNA -Strecke, die als Ausgangspunkt für die DNA -Replikation dient. |
| Funktion | |
| Dies erfasst das Vorhandensein einer spezifischen Sequenz in der Probe von DNA oder RNA. | Dies wirkt als Ausgangspunkt für die DNA -Synthese. |
| Länge | |
| Die Länge kann im Bereich von 100 bis 1000 Basen liegen | Die Länge beträgt in der Regel etwa 18 - 20 Basen |
| Bindung mit komplementärer Sequenz | |
| Sonde hybridisiert mit den komplementären Grundlagen der Zielsequenz | Primer temperiert mit den komplementären Grundlagen der DNA -Stränge. |
| Beschriftung | |
| Sonden werden zur einfachen Erkennung markiert | Primer sind im Allgemeinen nicht gekennzeichnet |
| Verwendung in PCR | |
| Sonden werden in PCR nicht verwendet | Primer werden in PCR verwendet |
Zusammenfassung - Sonde gegen Primer
Die Sonde ist ein kleines Fragment der DNA- oder RNA -Sequenz, das mit komplementären Nukleotiden hybridisiert werden kann, um eine Zielsequenz in der Probe nachzuweisen. Sonden werden radioaktiv, immunologisch oder fluoreszenz markiert, um das Vorhandensein einer Zielsequenz zu erkennen. Primer ist ein sehr kleines DNA- oder RNA -Fragment, das als Ausgangspunkt für in vitro DNA -Amplifikation. Die DNA -Polymerase identifiziert 3' -OH -Gruppenprimer und initiiert das Gebäude eines neuen Strangs, der zur Vorlage komplementär ist. Sonden und Primer funktionieren ähnlich durch Hybridisierung mit komplementären Nukleotiden. Daher ist der Schlüsselunterschied zwischen Sonde und Primer ihre Hauptfunktion.
Referenz:
1.Primer (Molekularbiologie).”Wikipedia. Wikimedia Foundation, 2. Februar. 2017. Netz. 01 März. 2017.
2.”Hybridisierungssonde.”Wikipedia. Wikimedia Foundation, 30. Dezember. 2016. Netz. 01 März. 2017
3.Primer (Molekularbiologie).”Primer (Molekularbiologie) - Sciencedirect -Themen. N.P., N.D. Netz. 01 März. 2017
Bild mit freundlicher Genehmigung:
1. "Fisch für die Identifizierung von Bakterienpathogen" durch Pepetps Togopic Ivan Akira Magnus Mansketimothy W. Ford -(CC BY -SA 3.0) über Commons Wikimedia
2. "Primers Revcom Smolded2" von Richard Wheeler (Zephyris) - eigene Arbeit (CC BY -SA 3.0) über Commons Wikimedia
