Unterschied zwischen RAPD und RFLP
Schlüsselunterschied - Rapd gegen RFLP
Genetische Marker werden in der molekularen Biologie verwendet, um genetische Variationen zwischen Individuen und Spezies zu identifizieren. Zufällige amplifizierte polymorphe DNA (Rapd) und Restriktionsfragmentlänge Polymorphismus (RFLP) sind zwei wichtige molekulare Marker, die routinemäßig in Laboratorien verwendet werden. RAPD wird mit kurzen und willkürlichen Oligonukleotidprimern durchgeführt und basiert auf der zufälligen Verstärkung der mehreren Stellen in der Template -DNA des Organismus. RFLP wird mit einer spezifischen Restriktionsendonuklease durchgeführt und basiert auf dem Polymorphismus der resultierenden Restriktionsfragmente und Hybridisierung. Der Hauptunterschied zwischen RAPL und RFLP ist das RAPD ist eine Art von PCR -Technik, die ohne vorherige Sequenzwissen durchgeführt wird wohingegen RFLP ist nicht an der PCR beteiligt und benötigt frühere Sequenzwissen, um die Technik durchzuführen.
INHALT
1. Überblick und wichtiger Unterschied
2. Was ist Rapd
3. Was ist RFLP
4. Seite an Seite Vergleich - Rapd gegen RFLP
5. Zusammenfassung
Was ist Rapd?
RAPD ist ein nützlicher molekularer Marker in der molekularen Biologie. Es ist eine schnelle und einfache Technik. RAPD kann als eine Methode definiert werden. RAPD verwendet kurze Oligonukleotidprimer mit willkürlichen Sequenzen für die PCR -Amplifikation. Primer werden künstlich ohne das vorherige Sequenzwissen synthetisiert. Daher wird es als einfache und nützliche Technik angesehen.
Die folgenden wichtigen Schritte sind an RAPD beteiligt.
- Extraktion der Ziel -DNA
- Amplifikation der mehreren Stellen der Ziel -DNA unter Verwendung zufällig ausgewählter Primer
- Gelelektrophorese der amplifizierten PCR -Produkte
- Färbung mit Ethidiumbromid und Identifizierung des Polymorphismus
Infolge der Variation des Primer -Glühens werden während der Verstärkung unterschiedliche Fragmente mit unterschiedlichen Längen erzeugt. Daher unterscheiden sich Bandingmuster auf den Gelen bei Individuen und Arten. Somit ermöglicht RAPD den Nachweis genetischer Variation zwischen Organismen bei der Identifizierung und Differenzierung.
RAPD wird in verschiedenen Studien zur molekularen Biologie angewendet, z.
Abbildung 01: Rapd
Was ist RFLP?
Restriktionsfragmentlänge Polymorphismen (RFLPs) ist ein molekularer Marker, der in der molekularen Biologie zur Identifizierung genetischer Variation in homologen DNA -Sequenzen verwendet wird. Es ist der erste genetische Marker, der für DNA -Fingerabdruck entwickelt wurde. Alle Organismen produzieren einzigartige DNA -Profile, wenn sie mit spezifischen Restriktionsenzymen beschränkt sind. RFLP dient als wichtiges Werkzeug für die Erzeugung einzigartiger DNA -Profile von Individuen und dem Nachweis genetischer Variationen zwischen ihnen. Wenn DNA -Proben mit spezifischen Restriktionsendonukleasen verdaut werden, liefert sie unterschiedliche DNA -Profile, die für jedes Individuum einzigartig sind. Daher ist der Haupt dieser Methode der Nachweis genetischer Variation zwischen Organismen durch Einschränkung der homologen DNA mit spezifischen Restriktionsenzymen und Analyse des Fragmentlängenpolymorphismus über Gelelektrophorese und Blotting. Blotting -Muster sind für jeden Organismus einzigartig und charakterisieren die spezifischen Genotypen.
Die folgenden Schritte sind an RFLP beteiligt.
- Isolierung einer ausreichenden Menge DNA aus Proben
- Fragmentierung der DNA -Proben mit spezifischen Restriktionsendonukleasen in eine kurze Sequenz
- Trennung der entstandenen Fragmente mit unterschiedlichen Längen durch Agarosegelelektrophorese.
- Übertragen des Gelprofils in eine Membran von Southern Blotting
- Hybridisierung der Membran mit markierten Sonden und Analyse des Fragmentlängenpolymorphismus in jedem Profil
RFLP hat verschiedene Anwendungen wie die Diagnose von Erbschaftskrankheiten, Genomzuordnung, kriminelle Identifizierung in forensischen Studien, Vaterschaftstests usw.
Abbildung 02: RFLP -Genotypisierung
Was ist der Unterschied zwischen RAPD und RFLP?
Rapd gegen RFLP | |
| RAPD ist ein molekularer Marker, der auf zufälligen Primern und PCR basiert. | RFLP ist ein molekularer Marker, der auf der Produktion verschiedener Längenbeschränkungsfragmente basiert. |
| Erforderliche Probe | |
| Kleine DNA -Proben reichen für die RAPD -Analyse aus. | Für die RFLP -Analyse ist eine große Menge extrahierter DNA -Probe erforderlich. |
| Zeit | |
| Rapd ist ein schneller Prozess. | RFLP ist ein zeitaufwändiger Prozess. |
| Primergebrauch | |
| Es werden zufällige Primer verwendet, und es können gleiche Primer für verschiedene Arten verwendet werden. | Speziesspezifische Sonden werden in RFLP zur Hybridisierung verwendet. |
| Zuverlässigkeit | |
| Die Zuverlässigkeit der Technik ist im Vergleich zu RFLP geringer. | RFLP ist eine zuverlässige Technik. |
| Blotting | |
| RAPD beinhaltet Southern Blotting. | Southern Blot ist ein einziger Schritt RFLP. |
| Erkennung von allelischen Variationen | |
| Allelische Variationen können nicht durch RAPD erkannt werden. | Allelische Variationen können durch RFLP erkannt werden. |
| Bedarf an Sequenzwissen | |
| RAPD erfordert keine vorherige Sequenzwissen. | Vorherige Sequenzwissen ist für die Sondenentwicklung erforderlich. |
| PCR | |
| PCR ist an Rapd beteiligt | PCR ist nicht an RFLP beteiligt. |
| Reproduzierbarkeit | |
| RAPD hat eine geringe Reproduzierbarkeit | RFLP ist im Vergleich zu RAPD eine hohe Reproduzierbarkeit. |
Zusammenfassung -Rapd gegen RFLP
RAPD und RFLP sind wichtige Marker, die in der Molekularbiologie verwendet werden. Beide Methoden sind in der Lage, genetische Variationen zwischen Organismen nachzuweisen. RAPD wird mit zufälligen Primern durchgeführt. RFLP wird unter Verwendung spezifischer Restriktionsenzyme durchgeführt. Beide Methoden produzieren DNA -Profile, die für einzelne Organismen einzigartig sind. RAPD ist vergleichsweise wenige Schritte als RFLP beteiligt. Aber es erzeugt weniger zuverlässige und reproduzierbare Ergebnisse als RFLP. Dies ist der Hauptunterschied zwischen RAPD und RFLP.
Verweise:
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2. Powell, Wayne, Michele Morgante, Chaz Andre, Michael Hanafey, Julie Vogel, Scott Tingey und Antoni Rafalski. „Der Vergleich von RFLP, Rapd, AFLP
Bild mit freundlicher Genehmigung:
1. "RFLP -Genotypisierung" von (unbekannten) - Nationale Institute of Health (Public Domain) über Commons Wikimedia
