Was ist der Unterschied zwischen Linien und Sinus

Der Schlüsselunterschied zwischen Linien und Sinus ist, dass Linien (langweitmischte Kernelemente) eine Art längerer Nicht-LTR-Retrotransposons sind, während Sines (kurze Kernelemente) eine Art viel kürzerer Nicht-LTR-Retrotransposons sind.

Nicht-LTR-Retrotransposons enthalten keine Langzeit-Wiederholungen (LTR). Sie enthalten jedoch Gene für Reverse Transcriptase, RNA -Bindungsprotein, Nuklease und Ribonuklease -H -Domäne. Nicht-LTR-Retrotransposons haben kurze Wiederholungen. Diese Wiederholungen haben eine umgekehrte Reihenfolge von Basen nebeneinander. Abgesehen davon haben Nicht-LTR-Retrotransposons auch direkte Wiederholungen in LRT-Transposons gefunden.  Nicht-LTR-Retrotransposons fallen in zwei Kategorien als Linien und Sines.

INHALT

1. Überblick und wichtiger Unterschied
2. Was sind Linien 
3. Was sind Sines
4. Ähnlichkeiten -Linien gegen Sines
5. Linien gegen Sinus in tabellarischer Form
6. Zusammenfassung

Was sind Linien?

Linien (langweit zwischengestrichene Kernelemente) sind längere Nicht-LTR-Retrotransposons. Sie sind in den Genomen von Eukaryoten weit verbreitet. Sie machen normalerweise 21 aus.1% des menschlichen Genoms. Jede Linie ist ungefähr 7000 Basispaare lang. Linien können in mRNA transkribieren und sich in ein Protein übersetzen, das als Reverse -Transkriptase -Enzym fungieren kann. Diese reverse Transkriptase erzeugt DNA -Kopien der Linien -RNA. Diese DNA -Kopien können an einem neuen Ort in das Genom integriert werden.

Abbildung 01: Linien und Sinus

Das menschliche Genom hat nur eine reichlich vorhandene Linie namens Line-1. Linie-1-Element ist ungefähr 6000 Basispaare lang. Es gibt rund 100.000 abgeschnittene Linien-1-Elemente im menschlichen Genom. Zufällige Mutation kann in Linien auftreten. Aufgrund von zufälligen Mutationen können die Linien degenerieren. Sie werden nicht mehr transkribiert oder übersetzt. Darüber hinaus sind die Linien in fünf Hauptgruppen wie L1, RTE, R2, I und Jockey zusammengefasst. Diese fünf Gruppen unterteilen weiter in weitere 28 Kladen.

Linien werden normalerweise durch einen Mechanismus, den als Ziel primierten Reverse Transcription Mechanismus (TPRT) bezeichnet werden, verbreitet. Einfügen von Linien verursacht menschliche Krankheiten wie Hämophilie A, Krebs, Mendelsche Störungen usw. Die Hypomethylierung von Linien löst auch bestimmte Krebsarten aus.

Was sind Sines?

Sines (kurze Kernelemente) sind eine Art viel kürzerer Nicht-LTR-Retrotransposons. Sie sind ungefähr 100 bis 700 Basispaare lang. Sines sind auch DNA -Elemente, die sich in eukaryotischen Genomen durch RNA -Zwischenprodukte amplifizieren. Sines machen etwa 13% des Säugetiergenoms aus.  Die inneren Regionen der Sinus stammen aus tRNA. Es bleibt hoch konserviert. Sie sind oft in vielen Arten von Wirbeltieren und Wirbellosen vorhanden. Die Variation und Mutationen der Kopienzahl in den Sinus können eingebaut werden, um die Phylogenie-basierte Klassifizierung von Spezies zu konstruieren.

Sines können in drei Haupttypen eingeteilt werden: Kern-Sines, V-Sines und Amnsines. Alu -Element ist der häufigste Sinus in Primaten. Darüber hinaus sind mehr als 50 menschliche Krankheiten im Zusammenhang mit der Einführung von Sinus verbunden. Wenn sie in oder in der Nähe von Exons einfügen, können sie zu falschem Spleißen führen oder den Leserahmen ändern. Dies führt zu Krankheitsphänotypen wie Brustkrebs, Darmkrebs, Leukämie, Hämophilie, Mukoviszidose, Darmkrebs, Dent -Krankheit, Neurofibromatose usw.

Was sind die Ähnlichkeiten zwischen Linien und Sinus??

• Linien und Sinesare zwei Arten von Nicht-LTR-Retrotransposons.
• Beide haben keine Langzeitregionen (LTR).
• Beide werden überwiegend nur in Eukaryoten gefunden.
• Sie sind beide nicht autonom.

Was ist der Unterschied zwischen Linien und Sinus?

Linien sind längere Nicht-LTR-Retrotransposons, während Sines viel kürzerer Nicht-LTR-Retrotransposons sind. Dies ist also der Hauptunterschied zwischen Linien und Sinus. Darüber hinaus hat der Zeilencode für das umgekehrte Transkriptase -Enzym, während Sinus kein Reverse -Transkriptase -Enzym codiert. Dies ist also ein weiterer Unterschied zwischen Linien und Sinus.

Weitere Unterschiede zwischen Linien und Sinus sind unten in tabellarischer Form für Seite -Neben -Vergleiche aufgeführt.

Zusammenfassung -Zeilen gegen Sines

Retrotransposons sind hauptsächlich in allen Eukaryoten zu finden, fehlt jedoch in Prokaryoten. Ungefähr 37% des menschlichen Genoms enthalten Retrotransposons. Retrotransposons sind hauptsächlich zwei Typen: LTR- und Nicht-LTR-Retrotransposons. Nicht-LTR-Retrotransposons enthalten keine Langzeit-Wiederholungen (LTR), die in LTR-Retrotransposons vorhanden sind. Nicht-LTR-Retrotransposons werden weiter in zwei Kategorien unterteilt: Linien und Sines. Linien sind längere Nicht-LTR-Retrotransposons, während Sines viel kürzerer Nicht-LTR-Retrotransposons sind. Dies ist also die Zusammenfassung des Unterschieds zwischen Linien und Sinus.

Referenz:

1. „Retrotransposon.”Ein Überblick | Sciencedirect -Themen.
2. Hanks, Dustin C., und Haig h. Kazianer. „Rollen für Retrotransposoninsertionen bei menschlichen Erkrankungen.”Mobile DNA, Biomed Central, 6. Mai 2016.

Bild mit freundlicher Genehmigung:

1. "Line1s and Sines" von Mariuswalter - eigene Arbeit (CC BY -SA 4.0) über Commons Wikimedia