Unterschied zwischen Konsens -PCR und PAN -PCR

Der Schlüsselunterschied Zwischen Konsens -PCR und PAN -PCR ist das Die Konsens -PCR zielt immer auf konservierte Regionen ab, während Pan PCR variable Regionen abzielt, um verschiedene Stämme einer Gruppe zu identifizieren

Die Polymerasekettenreaktion (PCR) ist eine Genamplifikationstechnik, die aus drei Hauptschritten als Denaturierung, Annealing und Erweiterung besteht. Dies wird häufig in der Diagnostik und der molekularen Identifizierung verwendet. Konsens -PCR- und PAN -PCR -Techniken basieren auf den Primerzielen, die jeder PCR -Typ verwendet.

INHALT

1. Überblick und wichtiger Unterschied
2. Was ist Konsens -PCR 
3. Was ist Pan PCR
4. Ähnlichkeiten zwischen Konsens -PCR und PAN -PCR
5. Seite an Seitenvergleich - Konsens PCR gegen PAN PCR in tabellarischer Form
6. Zusammenfassung

Was ist Konsens -PCR?

Die Konsens -PCR ist eine PCR -Technik, die auf eine konservierte Region für eine bestimmte Art oder Gattung abzielt. Daher werden hochkonservierte Regionen zur Verstärkung ausgewählt. Durch diese Methode können Organismen aufgrund ihres Konsens identifiziert und unterschieden werden. Diese Methode identifiziert eine konservierte Region für eine bestimmte Art. Beispielsweise bleibt die 16S -rRNA -Region von Bakterien eine konservierte Region unter Bakterien. Daher ist für die Verstärkung nur ein Primersatz erforderlich. In den meisten Fällen kann für die konservierte Region ein universelles Primer -Spezifikum verwendet werden.

Abbildung 01: PCR -Technik

Durch die Befolgung einer Konsens -PCR -Methode können die Artencharakterisierung und evolutionäre Beziehungen abgeleitet werden. Basierend auf der Amplifikationseffizienz des jeweiligen Stichprobenorganismus kann der Konsens des Organismus gegenüber der Gruppe ebenfalls abgeleitet werden. Darüber hinaus ist die Durchführung einer Konsens -PCR in phylogenetischen Untersuchungen von entscheidender Bedeutung. Es ermöglicht die Identifizierung einer Spezies und interpretiert die Abweichung des jeweiligen Organismus, der in Bezug auf den gemeinsamen Vorfahren gezeigt wird.

Was ist Pan PCR?

Eine PAN -PCR ist ein Multiplexing -Modus von PCR. In dieser Technik werden verschiedene Stämme unter Verwendung verschiedener Primerziele amplifiziert. Die Ziele können jedoch häufige Ziele für die Dehnungsgruppen sein. Somit können in PAN -PCR mehr als zwei Primer -Sets zu einem einzigen Zeitpunkt verwendet werden. Es kann in einer einzelnen Rohrreaktionsmethode oder als Multi-Strohr-Reaktionsmethode stattfinden. PAN -PCR ist zeitaufwändig und komplexer im Vergleich zu einer Konsens -PCR. Aus diesem Grund kann die Interpretation der PCR -Ergebnisse auch in PAN -PCR komplexer sein.

Die Hauptanwendung von PAN -PCR ist in der molekularen Diagnostik. Es ermöglicht die Unterscheidung zwischen verschiedenen Stämmen einer Spezies durch Zielverstärkung. Pan PCR ist eine ideale Technik, um verschiedene Stämme einer einzelnen Spezies zu identifizieren, die eine Krankheit verursacht. In den meisten Fällen ist die Automatisierung von PAN -PCR -Techniken für verschiedene Gesundheitszustände sehr wichtig und eine zuverlässige und hocheffiziente Technik.

Was sind die Ähnlichkeiten zwischen Konsens -PCR und PAN -PCR?

• Konsens -PCR und PAN -PCR sind zwei Arten von PCR -Techniken.
• Beide Verfahren folgen dem allgemeinen dreistufigen Verfahren - Denaturierung, Annealing und Erweiterung.
• Sie verwenden Primer, die zielspezifisch sind.
• Beide Reaktionen finden in einem thermischen Zykler statt.
• Diese Reaktionen können automatisiert werden.
• Beide können in der molekularen Diagnostik und Identifizierung verwendet werden. Die Genauigkeit variiert jedoch.
• Diese Verfahren erfordern Validierung.

Was ist der Unterschied zwischen Konsens -PCR und PAN -PCR?

Sowohl der Konsens als auch die PAN -PCR folgen dem gleichen Routineverfahren. Der wichtigste Unterschied zwischen Konsens -PCR und PAN -PCR basiert jedoch auf den Primer -Zielen, die für jedes Verfahren verwendet wird. Während Konsens -PCR immer auf konservierte Regionen abzielt, zielt eine PAN -PCR variable Regionen ab, um verschiedene Stämme einer Gruppe zu identifizieren. Aufgrund dieser Differenz variieren die Primer -Designing -Protokolle, die Anzahl der verwendeten Primersätze und die spezifischen Anwendungen.

Die folgende Infografik fasst den Unterschied zwischen Konsens -PCR und PAN -PCR zusammen.

Zusammenfassung -Konsens -PCR gegen Pan PCR

PCR, eingeführt von Mulli, spielt eine wichtige revolutionäre Rolle in molekularen Biologieanwendungen. Konsens- und PAN -PCR sind zwei Arten von PCR, basierend auf ihren Primer -Zielregionen. Während der Konsens -PCR auf konservierte Regionen abzielt, spielt PAN PCR variable Regionen und spielt eine wichtige Rolle bei der Identifizierung der Stamme. Aufgrund dieses grundlegenden Unterschieds zwischen Konsens -PCR und PAN -PCR variieren auch die spezifischen Funktionen jeder PCR -Art von phylogenetischer Analyse zur molekularen Charakterisierung bis zur molekularen Diagnostik.

Referenz:

1. Merkelbach-Bruse, S. et al. „Konsenspolymerasekettenreaktion und enzymgebundener Immunosorbent-Assay für den humanen Papillomavirus-Nachweis und die Typisierung in zervikalen Proben.”Diagnostische molekulare Pathologie: Das American Journal of Surgical Pathology, Teil B, U.S. Nationalbibliothek für Medizin, Mar. 1999, hier erhältlich.
2. Yang, Joy Y, et al. „PAN-PCR, eine Rechenmethode zum Entwerfen von Bakterien-Typing-Assays basierend auf den Sequenzdaten des gesamten Genoms.Journal of Clinical Microbiology, American Society for Microbiology, Mar. 2013, hier erhältlich.

Bild mit freundlicher Genehmigung:

1. "Polymerasekettenreaktion" durch Enzoklop - eigene Arbeit (CC BY -SA 3.0) über Commons Wikimedia