Was ist der Unterschied zwischen LTR- und Nicht-LTR-Retrotransposons

Der Schlüsselunterschied Zwischen LTR- und Nicht-LTR-Retrotransposons ist, dass LTR-Retrotransposons eine Art von Retrotransposons sind, die lang terminale Wiederholungen in ihrer Struktur haben, während nicht-LTR-Retrotransposons eine Art Retrotransposons sind, die in ihrer Struktur keine lang terminalen Wiederholungen aufweisen.

Retrotransposons (transponierbare Elemente oder Transposons der Klasse I über RNA -Zwischenprodukte) sind eine Art genetischer Komponente, die sich kopieren und in verschiedene genomische Stellen einfügen können. Sie führen dies durch, indem sie RNA durch einen Prozess, der als Reverse -Transkription bezeichnet wird. Es gibt zwei Haupttypen von Retrotransposons wie LTR- und Nicht-LTR-Retrotransposons

INHALT

1. Überblick und wichtiger Unterschied
2. Was sind LTR -Retrotransposons
3. Was sind Nicht-LTR-Retrotransposons
4. Ähnlichkeiten - LTR- und Nicht -LTR -Retrotransposons
5. LTR gegen Non-LTR-Retrotransposons in tabellarischer Form
6. Zusammenfassung - LTR gegen Non -LTR -Retrotransposons

Was sind LTR -Retrotransposons?

LTR -Retrotransposons sind eine Art von Retrotransposons, die in ihrer Struktur lang terminale Wiederholungen aufweisen. An jedem Ende eines LTR -Retrotransposon finden sich lange Stränge mit sich wiederholender DNA. Diese sind als Long Terminal Repeats (LTR) bekannt. Jeder LTR ist ein paar hundert Basispaare lang. LTR -Retrotransposons sind normalerweise über 5 Kilobasen lang. Darüber hinaus gibt es zwischen den lang terminalen Wiederholungen Gene, die zu Retrovirus -Genen transkribiert werden können Gag Und Pol. Diese Gene überlappen sich so, dass sie eine Protease codieren, die normalerweise das resultierende Transkript in funktionelle Genprodukte verarbeitet.

Abbildung 01: LTR -Retrotransposons

Gag Gene von Retrotransposons stellt ein Produkt her, das mit anderen Transkripten von Retrotransposons assoziiert, um virusähnliche Partikel zu bilden. Pol Gene stellt Produkte her, die Enzyme wie Reverse Transcriptase, Integrase und Ribonuclease H -Domänen umfassen. Das umgekehrte Transkriptase -Enzym führt die umgekehrte Transkription von Retrotransposon -DNA durch. Integrase -Enzym integriert Retrotransposon -DNA in die eukaryotische Genom -DNA. Ribonuklease -H -Domänen sind hilfreich, um Phosphodiesterbindungen zwischen RNA -Zwischenprodukten zu spalten. LTR -Retrotransposons codieren auch Transkripte mit TRNA. Da der Retrotransposon eukaryotische Genominformationen enthält, kann er Kopien von sich selbst in andere genomische Stellen innerhalb einer eukaryotischen Zelle einfügen.

Was sind Nicht-LTR-Retrotransposons?

Nicht-LTR-Retrotransposons sind eine Art Retrotransposons, die keine lang terminalen Wiederholungen in ihrer Struktur haben. Wie LTR-Retrotransposons enthalten auch Nicht-LTR-Retrotransposons Gene für Reverse-Transkriptase, RNA-Bindungsprotein, Nuklease und manchmal Ribonuklease-H-Domänen. Aber ihnen fehlen die lang terminalen Wiederholungen; Stattdessen haben sie kurze Wiederholungen, die eine umgekehrte Reihenfolge von Basen nebeneinander haben können. Die RNA -Bindungsproteine ​​binden an das Intermediat der RNA -Transposition, und Nukleasen brechen Phosphodiesterbindungen zwischen Nucleotiden in Nukleinsäuren.

Abbildung 02: LTR- und Nicht-LTR-Retrotransposons

Obwohl es sich um Retrotransposons handelt, können sie nicht mit einem RNA -Intermediat wie LTR -Retrotransposons eine umgekehrte Transkription durchführen. Dies liegt daran, dass Non-LTR-Retrotransposons keine Sequenzen enthalten. Daher wird ein nicht-LTR-Retrotransposon in mRNA transkribiert und in Proteine ​​als umgekehrte Transkriptase wirken. Reverse Transcriptase stellt eine DNA-Kopie der RNA des Nicht-LTR-Retrotransposons durch, die an einem neuen Ort in das Genom integriert werden kann. Darüber hinaus fallen Non-LTR-Retrotransposons in zwei Arten: Linien (lange intersagierte Kernelemente) und Sines (kurze Kernelemente mit kurzer Aussagen).

Was sind die Ähnlichkeiten zwischen LTR- und Nicht-LTR-Retrotransposons?

• LTR- und Nicht-LTR-Retrotransposons sind die beiden Haupttypen von Retrotransposons.
• Beide Typen enthalten Gene für Enzyme wie Reverse -Transkriptase, RNA -Bindungsprotein, Nuklease und Ribonuklease -H -Domänen.
• Sie können im menschlichen Genom gefunden werden.
• Beide Typen sind evolutionär wichtig.

Was ist der Unterschied zwischen LTR- und Nicht-LTR-Retrotransposons?

LTR-Retrotransposons haben lang terminale Wiederholungen in ihrer Struktur, während nicht-LTR-Retrotransposons langjährige Wiederholungen in ihrer Struktur fehlen. Dies ist daher der Schlüsselunterschied zwischen LTR- und Nicht-LTR-Retrotransposons. Darüber hinaus haben LTR -Retrotransposons lange direkte Wiederholungen, die nur eine Sequenz von Basen sind, die sich wiederholen. Andererseits haben Nicht-LTR-Retrotransposons kurze Wiederholungen, die eine umgekehrte Reihenfolge von Basen nebeneinander haben können.

Die folgende Infografik stellt die Unterschiede zwischen LTR- und Nicht-LTR-Retrotransposons in tabellarischer Form für Seite für Seitenvergleich vor.

Zusammenfassung -LTR gegen Non -LTR -Retrotransposons

LTR- und Nicht-LTR-Retrotransposons sind die beiden Haupttypen von Retrotransposons. LTR-Retrotransposons haben lang terminale Wiederholungen in ihrer Struktur, während Nicht-LTR-Retrotransposons keine lang terminalen Wiederholungen in ihrer Struktur aufweisen. Dies ist also der Hauptunterschied zwischen LTR- und Nicht-LTR-Retrotransposons.

Referenz:

1. Havecker, Ericka R, et al. „Die Vielfalt von LTR -Retrotransposons - Genombiologie.”Biomed Central, Biomed Central, 18. Mai 2004.
2. Han, Jeffrey s. „Nicht-longige Terminal Repeat (nicht-LTR) -Retrotransposons: Mechanismen, jüngste Entwicklungen und unbeantwortete Fragen-Mobile DNA.”Biomed Central, Biomed Central, 12. Mai 2010.

Bild mit freundlicher Genehmigung:

1. "LTR Retrotransposon" von Mariuswalter - eigene Arbeit (CC BY -SA 4.0) über Commons Wikimedia
2. "Komponenten des menschlichen Genoms" von Alglascock - eigene Arbeit (CC BY -SA 3.0) über Commons Wikimedia