Unterschied zwischen CRISPR und CRISPR CAS9

Der Schlüsselunterschied Zwischen CRISPR und CRISPR CAS9 ist das CRISPR (regelmäßig miteinander verbunden mit kurzer Palindrom-Wiederholung) ist ein natürlich vorkommender prokaryotischer Immunverteidigungsmechanismus, während CRISPR CAS9 ein RNA-gesteuerter Cas9-Nuklease ist, der Teil des adaptiven CRISPR-adaptiven Immunsystems ist.

CRISPR ist ein antivirales Verteidigungs -Immunsystem in Bakterien und Archaea. Es ist eine Familie von DNA -Sequenzen im Bakteriengenom. Es besteht aus Spacer -Sequenzen, die aus DNA -Fragmenten von Bakteriophagen stammen, die zuvor infiziert waren. Bei nachfolgenden Virusinfektionen verwenden Bakterien diese Sequenzen, um die virale DNA zu zerstören. CRISPR -Sequenzen haben kurze palindromische Wiederholungen und Spacer -Sequenzen. Darüber hinaus haben CRISPR -Wiederholungsabstandshaltersequenzen häufig assoziierte Gene, die für CAS -Proteine ​​codieren. Cas9 ist eine RNA -geführte Endonuklease. Zusammen mit CRISPR -Sequenzen fungiert Cas9 -Protein als adaptives Immunsystem in Bakterien gegen Bakteriophagen.

INHALT

1. Überblick und wichtiger Unterschied
2. Was ist CRISPR 
3. Was ist CRISPR CAS9
4. Ähnlichkeiten zwischen CRISPR und CRISPR CAS9
5. Nebenseitiger Vergleich - CRISPR gegen CRISPR CAS9 in tabellarischer Form
6. Zusammenfassung

Was ist CRISPR?

CRISPR steht für Die regelmäßig verwickelten kurzen Palindrom -Wiederholungen. Es ist ein Cluster von DNA -Sequenzen im Bakteriengenom. Es wirkt als natürlicher Abwehrmechanismus in Bakterien und wurde zuerst in identifiziert E. coli. In Bakterien wirkt es als adaptiver Immunschutz, insbesondere gegen Bakteriophagen. Daher ist es ein sequenzspezifischer Mechanismus.

Abbildung 01: CRISPR

Das CRISPR-System enthält mehrere kurzsegmentierte DNA-Wiederholungssequenzen. Diese Wiederholungen sind palindromisch und haben die gleiche Basissequenz, wenn Sie von 5 bis 3 lesen, während die andere beim Lesen von 3 bis 5 die gleiche Sequenz angibt.  Darüber hinaus sind Wiederholungen identisch. Sie befinden sich zwischen kurzen „Spacer“ -DNA -Sequenzen, die nicht identisch sind. Diese Abstandshalter -DNA -Sequenzen sind jedoch ähnlich oder übereinstimmen mit fremden Bakteriophagen -DNA. Mit CRISPR assoziierte Gene werden als CRISPR -assoziierte Gene oder CAS -Gene bezeichnet. CAS -Gene codieren für CAS -Proteine, die Helikasen oder Nukleasen sind. Helikasen entspannen DNA, während Nukleasen DNA schneiden. Insgesamt ist es bei der Betrachtung des CRISPR ein Immunsystem von Bakterien, das gegen Bakteriophagen wirkt (Bakterien infizieren Viren).

Was ist CRISPR CAS9?

Cas9 oder CRISPR-assoziiertes Protein 9 ist eine bakterielle RNA-gesteuerte Endonuklease. Daher ist es ein Enzym, das Ziel -DNA (insbesondere Bakteriophagen -DNA) ergänzt und schneidet, ergänzt zur Führungs -RNA. Es führt Strangspezifische Spaltung durch. Cas9 -Protein wird durch ein CRISPR -assoziiertes Gen codiert. CRISPR CAS9 ist das RNA-gesteuerte CRISPR-Cas9-Nuklease-System, das als RNA-programmierbare DNA-Targeting- und Bearbeitungsplattform für die Bearbeitung von Genoms, Transkriptionsstörungen, epigenetische Modulation und Genombildgebung verwendet werden kann. Dieses CRISPR CAS9 -System ist in aktuellen Genombearbeitungssystemen sehr beliebt.

Abbildung 02: CRISPR CAS9

Gegenwärtig wird das CRISPR/Cas9 -System verwendet, um das Säugetiergenom entweder durch Transkriptionsrepression oder Aktivierung zu verändern oder zu verändern. Die Säugetierzellen können auf CRISPR/CAS9 -vermittelte DNA -Bruchs reagieren, indem sie einen Reparaturmechanismus einsetzen. Es kann entweder mit der nicht-homologen Endverbindungsmethode (NHEJ) oder der Homology-gerichteten Reparatur (HDR) durchgeführt werden. Beide Reparaturmechanismus erfolgen durch Einführung doppelsträngiger Pausen. Dies führt zur Bearbeitung von Säugetieren Gene. NHEJ kann zu einer Ablation von Genmutationen führen und können verwendet werden, um einen Verlust von Funktionseffekten zu erzeugen. HDR kann zur Einführung spezifischer Punktmutationen oder zur Einführung von DNA -Segmenten unterschiedlicher Länge verwendet werden. Gegenwärtig wird das CRISPR/ CAS -System in den Bereichen therapeutische, biomedizinische, landwirtschaftliche und Forschungsanwendungen verwendet.

Was sind die Ähnlichkeiten zwischen CRISPR und CRISPR CAS9?

• Cas9 ist Teil des CRISPR CAS -Systems.
• Das knackige Cas9 -System ist ein Immunsystem, das natürlich in Bakterien vorkommt.

Was ist der Unterschied zwischen CRISPR und CRISPR CAS9?

CRISPR ist ein Cluster von DNA -Sequenzen im Bakteriengenom, das als natürliches Abwehrsystem gegen Bakteriophagen wirkt. Es besteht aus regelmäßig verwickelten kurzen palindromischen Wiederholungen, Abstandshaltern und assoziierten Genen. Im Gegensatz dazu ist Cas9 ein CRISPR -assoziiertes Protein 9, ein RNA -geführter Endonuklease -Enzym. Es erkennt und spaltet DNA -Doppelsträhnen von Viren. Tatsächlich ist es ein Teil des CRISPR -Verteidigungssystems. Dies ist also der Hauptunterschied zwischen CRISPR und CRISPR CAS9.

Zusammenfassung -CRISPR gegen CRISPR CAS9

CRISPR CAS -System ist ein mikrobielles Verteidigungssystem. CRISPR ist ein Cluster von DNA. Cas9 ist ein Cas -Protein, das eine RNA -geführte Endonuklease ist. CRISPR und Cas9 -Protein sind ein Immunsystem, das gegen Bakteriophageninfektionen in Bakterien wirkt. Cas9 -Protein kann fremde virale DNA spalten und sie stören. CrRNA führt Cas9, um die virale DNA zu erkennen. Daher ist das CRISPR CAS9 -System ein natürliches Immunsystem, das in Bakterien gegen Viren vorkommt. Dies ist also die Zusammenfassung des Unterschieds zwischen CRISPR und CRISPR CAS9.

Referenz:

1. Jiang, Fuguo. „CRISPR-CAS9-Strukturen und Mechanismen.” Jährliche Bewertungen, Hier verfügbar.

Bild mit freundlicher Genehmigung:

1. “4qyz.”Von Boghog - eigene Arbeit (CC BY -SA 4.0) über Commons Wikimedia
2. "GRNA-Cas9" 'von Marius Walter-eigene Arbeit (CC BY-SA 4.0) über Commons Wikimedia